案例演示 | R语言绘制热图代码
本文是个人笔记，请谨慎付费[星球用户可免费看]。 我们在分析了差异表达数据之后，经常要进行热图的可视化展示。热图（Heat map） 是一个以 颜色 变化来显示数据的 矩阵 。虽然“热图”是一个新兴的词汇，但是用明暗的矩阵来标
推荐阅读
热门文章
连锁不平衡以及连锁不平衡衰减
[连锁不平衡粗俗的说就是：这几个基因耍流氓，喜欢抱团遗传，不再随机。而连锁不平衡衰减是指在基因组上，随着物理距离的增大，两个连锁的的等位基因的连锁程度不断减小。] LD衰减 图，在重测序类的文章中会经常出现群体遗传、GWAS等的
基于R语言绘制Network几种方式
框内的数字是行变量和列变量之间的相关系数R，相关系数R绝对值越大，颜色越深（红正，蓝负）。统计学中，P值越小相关性越显著，一般来说 一个*代表显著相关（P值为0.01，选取不同参数可能不一样）、两个**代表极显著相关（P值为0.001）、三
如何在R语言中使用Logistic回归模型
logit=glm(y~x1+x2,data=data,family=binomial(link='logit'))glm表示广义线性回归，data表示y,x1,x2所在的数据集，family中的link用来选择回归类型
回归分析 | R语言 -- 多元线性回归
多元线性回归是简单线性回归的扩展，用于基于多个不同的预测变量（x）预测结果变量（y）。 例如，对于三个预测变量（x），y的预测由以下等式表示：y = b0 + b1*x1 + b2*x2 + b3*x3回
R语言相关性分析
1. R语言自带函数cor(data, method=" ")可以快速计算出相关系数 ，数据类型：data.frame 如data.frame为：zz, 绘图如下：a. single protein：线性
QQ文本分析—R语言
1、参考文献 设置超链接: 时间分布和成员分析 ； QQ聊天内容 ； recharts安装包官方介绍 2、读入QQ聊天记录 文本内容QQ文本读入的形式从左到右分别为“时间”，“用户”，“聊天信息” 时间信息
回归分析 | R语言 -- 多元线性回归
多元线性回归是简单线性回归的扩展，用于基于多个不同的预测变量（x）预测结果变量（y）。 例如，对于三个预测变量（x），y的预测由以下等式表示：y = b0 + b1*x1 + b2*x2 + b3*x3回
使用R语言对SSR数据做主成分分析（PCA）的一个简单小例子
示例数据来自于R语言包 poppr ,csv文件存储，数据格式如下 使用到的是R语言的 poppr 包中的 read.genalex() 函数poppr 第一次使用需要先安装 读入数据 读入数据直接是 genclone obje
R语言使用nls拟合,为什么总说循环次数大于50
nls的数据源必须有误差。不能精确等于公式返回值（零残差）。循环次数大于50通常是使用 函数精确返回值 作为数据源去拟合函数。必须给y值加上随机误差。z=function(x,a,b){a*sin(x)+b*cos(x)}x=seq(1,1
如何用r软件对给定数据进行回归分析（不能用lm函数）
可以试着探索一下summary(lm(y~x))到底是什么。 首先看一下summary(lm(y~x))是什么数据类型： >mclass(summary(m)) [1] "summary.lm" #可以看
r语言sqldf不能用日期处理函数怎么办
把表示时间的字符串转成时间类型数据，在R语言里面有两个基本的函数：as.POSIXlt() 和 as.POSIXct()。两者都是S3泛型函数，根据参数的数据类型选择不同的转换方法，除字符串外还能够转换数字、因子等数据类型，适应性很强!在我
回归分析 | R语言 -- 多元线性回归
多元线性回归是简单线性回归的扩展，用于基于多个不同的预测变量（x）预测结果变量（y）。 例如，对于三个预测变量（x），y的预测由以下等式表示：y = b0 + b1*x1 + b2*x2 + b3*x3回
r语言线性回归分析怎么看正负相关
看回归方程y=a+bx中的b值的正负，如果b是正数，就是正相关；如果b是负数，就是负相关。b值只能用来判断相关性的正负，但b并不是相关系数，相关系数在线性回归方程中是确定系数R^2的平方根R值，其正负号由b值的正负号决定。正值表示两变量正相
回归分析 | R语言 -- 多元线性回归
多元线性回归是简单线性回归的扩展，用于基于多个不同的预测变量（x）预测结果变量（y）。 例如，对于三个预测变量（x），y的预测由以下等式表示：y = b0 + b1*x1 + b2*x2 + b3*x3回
怎样用r语言中做岭回归的程序包
（1）plot(lm.ridge(GDP~Consume+Investment+IO+Population+Jobless+Goods,data=dat,lambda=seq(0,0.3,0.001))) # 和线性回归类似，这个plot可
用r语言做cca时怎么显示物种环境相关系数
假设你要计算两组数值的线性相关系数，方法有两种：第一种方法：键入函数：=CORREL(数据列或行1，数据列或行2)。该函数是计算数据列或行1及数据列或行2的线性相关系数。例如有一列数据为A1:A20，还有一列数据为B1:B20，=CORRE
R语言相关性分析
1. R语言自带函数cor(data, method=" ")可以快速计算出相关系数 ，数据类型：data.frame 如data.frame为：zz, 绘图如下：a. single protein：线性
R语言-信度与效度
cronbach’s alpha系数，一般翻译成克隆巴赫alpha系数，效度用探索性因子分析(KMO和Bartlett)。 alpha等于测验题目数(测验题目数－1) 乘 {1 - 各被试在该题目上的方差的和所有被试总分的
R语言作业-统计30题
链接： http:www.bio-info-trainee.com4385.html我做题的时候主要翻阅学习了《R语言实战》里统计相关内容。 需要掌握R内置数据集及R包数据集 鸢尾花(iris)数据集，包含150个鸢尾