聚类分析4—环境数据来解释 (数量生态学:R语言的应用-第四章)在这之前我们学习了聚类分析的基本概念、几种计算层次聚类的方法、进一步解读和比较层次聚类结果以及非层次聚类,这些聚类方法都是基于物种多度数据对样方进行分组,当然这些聚类方法也可以用于其他类型数据,特别是环境数据,所以本次就是介绍用 环境数据2023-02-24Python210
R语言线性回归esrequre <- function(x){ #求标准差平方估计值sum <- 0sum0 <- 0for(i in 1:length(x)){sum0 <- residu[i]^2sum2023-02-24Python100
请教R语言做矩阵散点图,添加相关系数,并采用稳健回cor()函数可以提供双变量之间的相关系数,还可以用scatterplotMatrix()函数生成散点图矩阵 不过R语言没有直接给出偏相关的函数; 我们要是做的话,要先调用cor.test()对变量进行Pearson相关性分析, 得到简单相2023-02-24Python160
【R语言编程】---根据表达量计算mRNA与lncRNA的皮尔森相关系数前言: 在构建ceRNA 网络时,需要计算lncRNA 与 蛋白编码gene(pc gene) 间的表达相关性,一般采用皮尔逊相关系数。具体如何做呢? 2.获得mRNA的表达矩阵 4个基因在100个样本的表达量矩阵: 32023-02-24Python190
R语言进行相关性分析相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析,从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性分析旨在研究两个或两个以上随机变量之间相互依存关系的方向和密切程度。一般来讲研究对象(样品或处理组)之间使用距离分析,而元素(物种或2023-02-24Python280
r语言主成分分析biplot怎么看#R中作为主成分分析最主要的函数是princomp()函数#princomp()主成分分析 可以从相关阵或者从协方差阵做主成分分析#summary()提取主成分信息 #loadings()显示主成分分析或因子分析中载荷的内容#predi2023-02-24Python170
R语言相关性分析1. R语言自带函数cor(data, method=" ")可以快速计算出相关系数 ,数据类型:data.frame 如data.frame为:zz, 绘图如下:a. single protein:线性2023-02-24Python360
如何在R语言中使用Logistic回归模型在日常学习或工作中经常会使用线性回归模型对某一事物进行预测,例如预测房价、身高、GDP、学生成绩等,发现这些被预测的变量都属于连续型变量。然而有些情况下,被预测变量可能是二元变量,即成功或失败、流失或不流失、涨或跌等,对于这类问题,线性回归2023-02-24Python320
怎么用r语言进行dna序列分析有现成的包:matchprobes包 里面有个函数basecontent(seq)计算4中碱基每种的含量;自己做的话:#List是你的序列 unlist(strsplit(List,""))->sep.let2023-02-24Python870
如何用R语言进行相关系数与多变量的meta分析本文第一大部分将介绍用R软件的meta分析数据包实现相关系数的Meta分析,第二大部分如何用R语言进行多变量的meta分析。 想获取R语言相关系数meta分析的程序模板的同学请在公众号(全哥的学习生涯)内回复“相关系数”即可。 me2023-02-24Python260
R语言相关性分析图。想知道怎么分析这些数据?框内的数字是行变量和列变量之间的相关系数R,相关系数R绝对值越大,颜色越深(红正,蓝负)。统计学中,P值越小相关性越显著,一般来说 一个*代表显著相关(P值为0.01,选取不同参数可能不一样)、两个**代表极显著相关(P值为0.001)、三2023-02-24Python250
《R语言实战》自学笔记44-t检验数据准备t检验,亦称student t检验(Student's t test),主要用于样本含量较小(例如n <30),总体标准差σ未知的正态分布。t检验是用t分布理论来推论差异发生的概率,从而比较两个平均2023-02-24Python130
R语言-第一次用RStudio 画热图作业 读取文件用得比较多的参数有: “header”,“sep”,“quote”,“na.strings”,“fill”,“strip.white ”,“blank.lines.skip”,“comment.char ”,“”等等。2023-02-24Python210
cov(x,y)和cov(y,x)相等吗?是相等的。cov函数cov函数用于求协方差矩阵,计算协方差的数学公式为:cov(x1,x2)=E[(x1-u1)(x2-u2)]。其中,E是数学期望,u1=Ex1,u2=Ex2。cov函数的调用语法如下。(1)C=cov(x):若x为一向量2023-02-24Python280
cv值是什么意思cv值是变异系数。CV是变异系数,是标准差与平均值之比用百分数(%)表示。2S,-2S为控制线,任何控制值超出X±2S限值的,被确定该批结果为失控。比如说该批号质控品瓶上标注的值是20,变异系数CV为5%,那么你所做出来的值就必须在22023-02-24Python200
怎样用r语言中做岭回归的程序包(1)plot(lm.ridge(GDP~Consume+Investment+IO+Population+Jobless+Goods,data=dat,lambda=seq(0,0.3,0.001))) # 和线性回归类似,这个plot可2023-02-24Python190
R语言的“密度提琴图”绘制方法,让提琴图更加丰富多彩最初我是在“ A genome-based model for adjusting radiotherapy dose (GARD): a retrospective, cohort-based study ”这篇文章中看到的一个图。2023-02-24Python140
请问如何用R语言做大量次数的几何布朗运动的模拟(参数μ,σ已知)这上网搜应该搜的到吧,比如这篇文章"股票价格行为关于几何布朗运动的模拟--基于中国上证综指的实证研究",照着几何布朗运动的公式直接写代码应该就行了吧,代码逻辑都很清晰。下面是照着这片文章模拟一次的代码,模拟多次的话,外面2023-02-24Python210
多元回归可以用一个数据集进行预测吗r前几天写了一篇直接在PowerBI里面使用度量值做一元回归的内容,虽然灵活性很高,但是实际中对一个结果影响的因素是很多的,还是使用多元回归的场景更多。而且我们借助统计分析包不仅可以计算出回归参数,还可以看看一些衡量模型的重要指标,比如R22023-02-24Python160
网络数据的统计分析-R语言实战资料:《Statistical Analysis of Network Data with R》 语言R常见的网络分析包: 网络分析研究大部分是描述性的工作。 网络的可视化 即是一门艺术,也是一门科学。 三元闭包体现了社会2023-02-24Python120