GO 和 KEGG 的区别1、属性不同Go(又称 Golang)是 Google 的 Robert Griesemer,Rob Pike 及 Ken Thompson 开发的一种静态强类型、编译型语言。功能:内存安全,GC(垃圾回收),结构形态及 CSP-styl2023-02-24Python560
方差分解分析 (VPA):定量不同环境因子对群落变化的解释比例这篇微文写的非常棒,因此转发至自己的智库中,以便日后学习。 衷心的感谢每一位知识的奉献者。。。。VPA ,全称Variance Partitioning Analysis,中文成为方差分解分析,该分析的目的是 确定指定的环境因子对群落结构变2023-02-24Python1170
为什么要使用 Go 语言?Go 语言的优势在哪里?1、简单易学。Go语言的作者本身就很懂C语言,所以同样Go语言也会有C语言的基因,所以对于程序员来说,Go语言天生就会让人很熟悉,容易上手。2、并发性好。Go语言天生支持并发,可以充分利用多核,轻松地使用并发。 这是Go语言最大的特点2023-02-24Python140
如何利用R软件绘制箱线图方法步骤打开r软件,输入数据集。这里以一个班级的学生成绩为例来介绍箱线图的使用方法。输入绘制箱线图命令boxplot(class1),运行命令,得到一班学生成绩箱线图。箱线图箱体中间的粗黑线表示中位数所在位置,可以看到本例的平均值大约在82023-02-24Python430
R语言怎么设置行距在“设置”-“语言格式设置”里面,找到style里面的Line numbermargin一项,调整字体大小就可以调整左边标号的大小,然后文本内容的行间距就可以任意调整。孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)是以2023-02-24Python160
求问R里安装WGCNA程序包时出现下述错误怎么解决呵呵,这个问题我刚解决,呵呵,综合了大家的经验.按照如下顺序,使用逗添加删除程序地卸载iTunes和相关软件(一定要按顺序做。这些项目皆在逗添加删除程序地里,如果没有即可忽略。):1.iTunes2.QuickTime3.AppleSo2023-02-24Python140
R语言中 .rds 是什么文件?如何运用。R语言中如何删除数据对象首先需要打开R studio,新建文件脚本,【File】——【New Script】。然后会发现,global environment这里之前代码留下的数据集非常麻烦,清除方法如下:首先,写入 rm(A),即可清除相2023-02-24Python190
R语言GEO数据挖掘:步骤三:进行基因差异分析用limma包,这里注意,limma包是对基因芯片表达矩阵的分析,不能对逆转录RNAseq表达矩阵进行分析(因为数据特征不同),RNAseq需要用另一种方法 解读此表 但是上面的用法做不到随心所欲的指定任意两组进行比较,所有还有下一2023-02-24Python230
R语言可视化通路富集网络图我们输入的数据包含 gene ID 和 vector(单样本)部分,这里的 gene ID 是一个通用概念,可以是基因、转录本、酶或蛋白质。这里的 vector 可以是样本的表达量、倍数变化, p-value, 组蛋白修饰数据等可测量的属2023-02-24Python200
推荐几个模拟构建蛋白质结构的软件你是说做出一个蛋白质结构模型呢还是说看蛋白质的空间结构的软件的呢都说了吧:由一条序列做出一个蛋白质结构模型最常用的方法是同源模建,软件有modeller(比较专业)swiss-pdb-viewer(本地提交在线预测结构的)看蛋白质空间结构图2023-02-24Python180
R语言ggcorrplot包绘制相关性热图热图是科研论文中一种常见的可视化手段,而在转录组研究领域,我们常常需要分析一些基因与基因之间的相关性,来判断生物样本中是否存在共表达情况,以及共表达基因模块。除了基因集之间,其他方向,比如免疫细胞群体之间相关性,样本的相关性,也常常用相关性2023-02-24Python160
Go语言有什么优势?GO语言的优势:可直接编译成机器码,不依赖其他库,glibc的版本有一定要求,部署就是扔一个文件上去就完成了。静态类型语言,但是有动态语言的感觉,静态类型的语言就是可以在编译的时候检查出来隐藏的大多数问题,动态语言的感觉就是有很多的包可以使2023-02-24Python200
qPCR数据处理qPCR这项技术,被广泛用于生物学的研究,只有有以下用途: qPCR作为一种DNA定量手段,一般情况下, 还可以分为 绝对定量 和 相对定量 。 好的, 那么一般情况下, 我见过比较多的qPCR,都是以RNA相对定量为目的的,也是2023-02-24Python180
生物等效名词解释生物等效性(bioequivalency , BE )是指一种药物的不同制剂在相同实验条件下,给予相同的剂量,其吸收速度与程度的主要药物动力学参数无统计学差异。当吸收速度的差别没有临床意义时,某些药物制剂其吸收程度相同而速度不同也可以认为生2023-02-24Python170
为什么要使用 Go 语言?Go 语言的优势在哪里1、学习曲线它包含了类C语法、GC内置和工程工具。这一点非常重要,因为Go语言容易学习,所以一个普通的大学生花一个星期就能写出来可以上手的、高性能的应用。在国内大家都追求快,这也是为什么国内Go流行的原因之一。2、效率Go拥有接近C的运行效2023-02-24Python140
生物信息学中GO是什么意思GO是Gene Ontology的简称,是生物学家为了衡量基因的功能而而发起的一个项目,从分子功能(molecular function)、生物学过程(biological process)和细胞定位(cellular component)2023-02-24Python240
深入浅出介绍聚类分析聚类分析是生信分析中常用的工具,在转录组分析中经常用到。聚类分析将表达模式相似的基因聚类在一起,以基因集的形式进行后续分析,今天我给大家介绍其相关原理。 聚类方法有很多,常用的有以下几个: 下图的例子展示的是,差异表达基因集的聚类2023-02-24Python250
转录组分析中—用R语言画带基因名标签的PCA主成分分析图 1. “PCA.data.txt”为基因表达值矩阵。其中第一列为基因名称,这里以ensembl id作为指代;其余各列记录了RNA-seq获得的各基因在各样本中的表达量信息。2. “group.t2023-02-24Python170
R语言绘图包05--韦恩图的绘制:ggvenn和VennDiagramR语言绘图包系列: 这个包支持列表或数据框的数据作为输入 1.4.1 美化颜色和大小 颜色填充参数:fill_color- 默认是 c("blue", "yellow", "2023-02-24Python160
怎么用r语言进行dna菌群多样性分析基因测序分析微生物菌群结构 NA是什么意思微生物群落测序是指对微生物群体进行高通量测序,通过分析测序序列的构成分析特定环境中微生物群体的构成情况或基因的组成以及功能。借助不同环境下微生物群落的构成差异分析我们可以分析微生物与环境因素或宿主之2023-02-24Python290