基因突变基因突变科技名词定义中文名称:基因突变 英文名称:gene mutation 定义:由于核酸序列发生变化,包括缺失突变、定点突变、移框突变等,使之不再是原有基因的现象。 应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科);基因表达与调控(二级学科)2023-02-24Python270
R语言安装WGCNA,碰到依赖包无法安装的情况加权基因共表达网络分析 (WGCNA, Weighted correlation network analysis)是用来描述不同样品之间基因关联模式的系统生物学方法,可以用来鉴定高度 协同变化 的基因集, 并根据基因集的内连性和基因集与表2023-02-24Python280
R语言初学笔记:差异表达基因setwd("E:GSE25066")#环境设置 library(limma)#加载差异分析包limma #将分组文件加载到环境中,分组信息第一列为样本名,第二列为分组信息如“high”“low” targ2023-02-24Python140
R|Affymetrix芯片分析(1)-affyAffymetrix芯片储存着大量的生物信息学数据,因此有必要从实战出发的角度,汇总下Affymetrix芯片处理的流程。下面以GSE1438为例 常用的质量控制的指标: 平均数法、RLE、NUSE和RNA降解曲线根据以上指标综合决2023-02-24Python180
在实数集R中给出关系f={(x,x²):x∈R},讨论f的自反性,对称性和传递性。如果我理解的没错, 自反性, 对称性和传递性都没有.自反性要求: 任意a ∈ R, 有(a,a) ∈ f, 但是对a = 2就不成立.对称性要求: 若(a,b) ∈ f, 则(b,a) ∈ f, 但是对a = 2, b = 4就不成立.传递2023-02-24Python160
转录组分析中—用R语言画带基因名标签的PCA主成分分析图 1. “PCA.data.txt”为基因表达值矩阵。其中第一列为基因名称,这里以ensembl id作为指代;其余各列记录了RNA-seq获得的各基因在各样本中的表达量信息。2. “group.t2023-02-24Python120
随机对照研究中怎样利用r语言对数据进行校正产生随机数有两个函数,他们是 runif(),rnorm()举例:runif(10,min=0,max=1) #产生10个最小值为0,最大值为1的随机数[1] 0.23848237 0.44347367 0.59288350 0.586682023-02-24Python140
R语言画时间序列图用xlim或者ylim命令。比如:# Specify axis options within plot()plot(x, y, main="title", sub="subtitle",xlab=2023-02-24Python160
ruby—cell在中国有销售吗是的,Rubycell在中国有销售。 Rubycell在中国拥有官方商城、官方旗舰店、非官方商城等多个销售平台,可以购买到正品Rubycell产品。是的,Rubycell在中国有销售。 Rubycell在中国拥有官方商城、官方旗舰店、非官方2023-02-24Python220
Go语言怎么样?根据Go趋势报告显示,全球范围内有 110 万专业开发者选择Go作为其主要开发语言。如果把以其他编程语言作为主要开发语言,同时也在使用Go的开发者计算在内,这一数字将高达270万,中国的Go语言开发者排名第一,全球占比超过16%。Go 语2023-02-24Python180
基因ID转换---R语言这里使用的是Y叔的R包clustProfilter,里面有个函数bitr()但是使用这种方法总是会有一些基因比对不上,就会有类似的warning如果有更好的方法,欢迎大家一起探讨! 将Ensembl 中的蛋白ID转化成基2023-02-24Python130
如何用r语言绘制多变量散点图给你一些代码,你慢慢研究:install.packages('ggplot2')library(ggplot2)ggplot(a)+geom_bar(aes(x1,y,fillcol=x1x2),position=&2023-02-24Python170
怎么将r语言编写的数据用关系图展示在前端页面这样: 这里主要介绍下在R语言中绘制地图的个人琢磨的思路。绘制地图步骤有三: 你得需要绘制地图;(约等于废话) 你得有要绘制地图的地理信息,经纬度啊,边界啊等等; 你得利用2的数据在R中画出来。 以上步骤中,目前最关键的是2,怎么将r语言编2023-02-24Python340
怎样学习GO语言?golang学习比较简单,不过任何一门语言都不是孤立存在的,在这里简要说明一下golang开发的学习路线1.golang基础,包括go语言安装,go语言语法,流程控制语句,函数,方法,面向对象概念,网络编程,并发编程等2.golang开发框2023-02-24Python140
R语言批量合并容易遇到的问题:1.在导入文件时,可能会出现第一列列名为“X.U.FEFF.xx”。这可能是文件类型或编码方式导致,本人解决方法是将csv(utf-8)文件另存为csv文件。“X.U.FEFF.xx”字样消除。 2.在数据合2023-02-24Python250
R语言msigdbr包提取基因集首先查看可供选择的物种信息 使用msigdbr()函数可以得到想要的基因集,其中category参数可以指定基因集的类别,比如“H”或者“C1” 之后可以利用split函数把得到的基因集分组建成一个list 之后就可以利用这个l2023-02-24Python130
R语言生信分析——表达矩阵数值问题比如GPL570的矩阵就是没有取过log2的。 将原始表达矩阵eset (共24列)进行简单转换:eset[,1:24]<-log2(eset[,1:24]) 以前听 GSE号与对应平台GPL号以及注释包 ,总是不知道为什么2023-02-24Python160
什么是r检验r实验指的是科学研究的基本方法之一。根据科学研究的目的,尽可能地排除外界的影响,突出主要因素并利用一些专门的仪器设备,而人为地变革、控制或模拟研究对象,使某一些事物(或过程)发生或再现,从而去认识自然现象、自然性质、自然规律。科学实验,是指2023-02-24Python120
GO(Gene Ontology)Ontology 首先是出现于哲学领域的一个词汇,后来广泛用于计算机领域,发挥了很重要的作用,再后来这个概念被引入生物领域。 gene Ontology 是生物中Ontology中一个重要应用。go项目最初是由研究三种模式生物(果蝇、小2023-02-24Python160
单细胞测序的设计与分析缩略词表: fluorescence-activated cell sorting (FACS) —— 流式细胞荧光分选技术 whole-genome amplification (WGA)—— 全基因组扩增技术 multipl2023-02-24Python140