r语言data[i,1]输出为空值怎么处理R对命名了的数据结构进行操作。最简单的数据结构是数字向量;如,>x <- c(10.4, 5.6, 3.1, 6.4, 21.7)c()是创建函数,赋值运算符是'<-',与函数assi2023-02-25Python210
R语言分析各班学生成绩分析来自5各班的5位中学生的成绩情况,数据必须确保已保存在本地,名称为“scores.txt” scores <- read.table("scores.txt",header=TRUE, row.nam2023-02-25Python240
如何用r语言求正态分布的标准差用r语言求正态分布的标准差:产生100个均值为0标准差为1的正态分布随机数:rnorm(100,mean=0,sd=1)指数分布数dnorm(x,mean=5,sd=1,log=TRUE)。正态分布的标准差正态分布N~(μ,duδ^2),2023-02-25Python270
卡方检验结果怎么看?ASYMP.sig就是我们常说的P值,一般来说,只要P值小于0.05就认为结果有显著性差异,P值大于0.05就没有显著差异。分析结果:χ2值与P值,依次看“Chi-Square Tests”表的第1行,第1列和第3列。补充:第2行是校正2023-02-25Python360
R语言做聚类分析用统计量确定类的个数.有什么代码或者包吗聚类分析有两种主要计算方法,分别是凝聚层次聚类(Agglomerative hierarchical method)和K均值聚类(K-Means)。层次聚类又称为系统聚类,首先要定义样本之间的距离关系,距离较近的归为一类,较远的则属于不同的2023-02-25Python350
转录组分析中—用R语言画带基因名标签的PCA主成分分析图 1. “PCA.data.txt”为基因表达值矩阵。其中第一列为基因名称,这里以ensembl id作为指代;其余各列记录了RNA-seq获得的各基因在各样本中的表达量信息。2. “group.t2023-02-25Python250
如何用R语言绘制热图# --enable-R-shlib 需要设置,使得其他程序包括Rstudio可以使用R的动态库# --prefix指定软件安装目录,需使用绝对路径.configure --prefix=homeehbioR3.4.0 --ena2023-02-25Python690
R语言作业-统计30题链接: http:www.bio-info-trainee.com4385.html我做题的时候主要翻阅学习了《R语言实战》里统计相关内容。 需要掌握R内置数据集及R包数据集 鸢尾花(iris)数据集,包含150个鸢尾2023-02-25Python170
初学者R语言:热图基础画法及个性化调整详解热图(Heatmap):用颜色变化直观的表达数据之间差异的图,是对实验数据进行质制和差异数据的展现,是数据挖掘类文章的标配。 例如上图,每个小方格表示每个基因,其颜色表示该基因表达量大小,表达量越大颜色越深(红色为上调,蓝色为下调)。每2023-02-25Python250
R语言(ggplot)如何绘制分组比较的箱线图?如下图所示boxplot(x1~name,da,at=c(1,5,9),names=paste(c('A','B','C'),'x1',sep='.'2023-02-25Python230
r语言中t检验如何单独取t值独立双样本t检验,首先假设我们的两组数据完全由独立抽样得来;t.test函数可以直接用于检验像sleep这样的长数据,列group则为样本的分组依据。配对样本t检验,数据集为包含分组变量的数据框,那么程序将默认group=1的数据行中的第2023-02-25Python180
聚类算法之K均值算法(k-means)的Python实现聚类分析。我们先从二维空间说起,比如一个组织中的雇佣关系存在四种模式,x轴和y轴分别代表着企业对员工提供的诱因与企业对员工期望的贡献。两个坐标轴划分出了四种雇佣关系,企业对员工提供的诱因与企业对员工期望的贡献两个指标共同可以反映一个企业的员2023-02-25Python190
R语言网络图介数怎么算在最短路算法的基础上,每替换一次k点时该点介数+1,(k,j)边介数+1,不知道你的最短路总数怎么算,是包括所有的还是只包括3节点以上的路?反正再除下最短路总数就出来了。R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、2023-02-25Python240
R数据可视化2:箱形图 Boxplot箱形图(Box-plot)是一种用作 显示一组数据分散情况 的统计图,因形状如箱子而得名。除了生信领域,该图在其他领域也经常被使用。主要用于反映原始数据分布的特征,并且可以进行多组数据分布特征的比较。箱形图能显示出一组数据的 最大值(Ma2023-02-25Python270
R语言可视化通路富集网络图我们输入的数据包含 gene ID 和 vector(单样本)部分,这里的 gene ID 是一个通用概念,可以是基因、转录本、酶或蛋白质。这里的 vector 可以是样本的表达量、倍数变化, p-value, 组蛋白修饰数据等可测量的属2023-02-25Python220
求助卡方检验后构成比的两两比较多个样本率的两两比较,卡方分割将你的列联表两两分割,三个组就可以分割成3*(3-1)2即3次比较,spss的卡方检验会做吧?然后调整你的检验水准,公式见下图,此处m=3,故α’=0.017,即你的两两比较结果只有p≤0.017才能认为差异2023-02-25Python210
r语言如何最小二乘线性回归分析线性回归中,你要估计参数的话就需要设计一个函数,然后极小化这个函数来得到参数的估计。最小二乘方法就是这样的,依靠对残差平方和的最小化来估计参数。 还有其他的函数设计,诸如最小一乘方法,或者最小化残差的中位数等。偏最小二乘法判别分析(PLS_2023-02-25Python800
r语言求重复数duplicated() 找出重复出现的元素。给出一例子>test<-c(21,22,22,23,22,23,24)>duplicated(test)[1] FALSE FALSETRUE FALSE2023-02-25Python170
方差分析的作用是什么?方差分析:根据不同需要把某变量方差分解为不同的部分,比较它们之间的大小并用F检验进行显著性检验的方法。 又称“变异数分析”或“F检验”,是用于两个及两个以上样本均数差别的显著性检验。F值是两个均方的比值[效应项误差项],不可能出现负值。2023-02-25Python200
【R语言】--- 箱型图箱线图主要是通过四分位数描述数据分布,通过最大值,上四分位数,中位数,下四分位数,最小值五处位置描述数据分布情况。箱线图能够显示出可能为离群点(范围±1.5*IQR以外的值,IQR表示四分位距,即上四分位数与下四分位数的差值)的观测。从箱线2023-02-25Python210