转录组分析1——原始数据以及过滤RNA-Seq主要有三个步骤,分别是第一:建库;第二,测序;第三,数据分析 1、先登录界面找到这个数据集所在位置:https:www.ncbi.nlm.nih.govgeoqueryacc.cgi?acc=GSE527782023-02-25Python190
r语言求平均值1.导入数据install.packages('xslx')library(xlsx)Sys.setlocale("LC_ALL", "zh_cn.utf-8")a=read.xl2023-02-25Python230
QQPlot图的结构(1)若是检验一组数据是否来自某个分布,分布函数为F(x),通常图的纵坐标为排好序的实际数据(次序统计量:x(1)<x(2)<....<x(n)),可以称之为经验分位点。横坐标为这些数据的理论分位点,所谓2023-02-25Python190
R语言作业-统计30题链接: http:www.bio-info-trainee.com4385.html我做题的时候主要翻阅学习了《R语言实战》里统计相关内容。 需要掌握R内置数据集及R包数据集 鸢尾花(iris)数据集,包含150个鸢尾2023-02-25Python160
请问怎么用R语言正则表达式统计文章的单词数和中文字数,不能用程序包?首先声明,用R来处理字符串数据并不是一个很好的选择,还是推荐使用Perl或者Python等语言。不过R本身除了提供了一些常用的字符串处理函数,也对正则表达式有了一定的支持,具体各个函数的使用方法还是要参考R的帮助文档。sub()与gsub(2023-02-25Python160
【R语言】--- 箱型图箱线图主要是通过四分位数描述数据分布,通过最大值,上四分位数,中位数,下四分位数,最小值五处位置描述数据分布情况。箱线图能够显示出可能为离群点(范围±1.5*IQR以外的值,IQR表示四分位距,即上四分位数与下四分位数的差值)的观测。从箱线2023-02-25Python130
R语言实现bootstrap和jackknife检验方法写在最前面: 首先需要说一下,本文的bootstrap和jackknife都算是蒙特卡罗方法(Monte Carlo method)的一种。应用广泛的的MCMC链(马尔可夫链蒙特卡洛方法Markov chain Monte Carlo2023-02-25Python110
如何使用R语言进行正态性检验卡方拟合优度检验或者正态性检验都可以检验一串数据是否服从正态分布。如果你用spss里面就有正态性检验QQ图PP图如果你用R就用shapiro.testkolmogorov-smirnov非参数检验K-S检验如果你用matlab就是normp2023-02-25Python210
r语言贝叶斯判别先验概率怎么去Bayes判别,它是基于Bayes准则的判别方法,判别指标为定量资料,它的判别规则和最大似然判别、Bayes公式判别相似,都是根据概率大小进行判别,要求各类近似服从多元正态分布。1. Bayes准则:寻求一种判别规则,使得属于第k类的样品在2023-02-25Python150
R语言怎么检验分布是不是T分布ks.test()实现了KS检验,可以检验任意样本是不是来自给定的连续分布。你这里的用法就是:ks.test(data,pt,df=df) #data是样本的数据,df是要检验的t分布的自由度我们可以用很多方法分析一个单变量数据集的分布。最2023-02-25Python200
【R语言编程】---利用三代测序绘制菌群聚类热图与物种丰度图前言: 仍然是三代测序数据的分析,宏基因组的文章中经常出现聚类热图和物种丰度图,用来直观地识别与某些疾病或者表型相关的菌群构成。 1.读取数据 一共有11个样本,每一个样本的测序reads都经过Nanopore官方的Epi2Me2023-02-25Python260
R语言分析各班学生成绩分析来自5各班的5位中学生的成绩情况,数据必须确保已保存在本地,名称为“scores.txt” scores <- read.table("scores.txt",header=TRUE, row.nam2023-02-25Python400
基于R语言的分类、聚类研究1.所有在对iris数据集分(聚)类研究中,setosa均可以完全正确分(聚)类,而另外两类则会出现不同程度的误差,这也是导致整个研究模型出现误差的原因; 2.在使用的三种分类研究方法中,决策树模型的效果最优,因此可以使用该方法进行鸢尾2023-02-25Python240
R语言作业-统计30题链接: http:www.bio-info-trainee.com4385.html我做题的时候主要翻阅学习了《R语言实战》里统计相关内容。 需要掌握R内置数据集及R包数据集 鸢尾花(iris)数据集,包含150个鸢尾2023-02-25Python240
《R语言实战》自学笔记61-重复测量方差分析所谓重复测量方差分析,即受试者被测量不止一次。本节重点关注含一个组内和一个组间因子的重复测量方差分析(这是一个常见的设计)。 以下为R语言实战示例。基础安装包中的CO2数据集包含了北方和南方牧草类植物Echinochloa crus-2023-02-25Python180
R语言分析各班学生成绩分析来自5各班的5位中学生的成绩情况,数据必须确保已保存在本地,名称为“scores.txt” scores <- read.table("scores.txt",header=TRUE, row.nam2023-02-25Python270
R语言实用案例分析-相关系数的应用R语言实用案例分析-相关系数的应用在日常工作中,经常会存在多个变量之间存在关联关系,比如学习数学好的同学,物理成绩可能也比较高。在公司中外貌和讨人喜欢的关系往往也比较大,在人事招聘过程中,如果想要更加综合的评价某个人,需要把相关系数比较高的2023-02-25Python160
如何用r语言求正态分布的标准差用r语言求正态分布的标准差:产生100个均值为0标准差为1的正态分布随机数:rnorm(100,mean=0,sd=1)指数分布数dnorm(x,mean=5,sd=1,log=TRUE)。正态分布的标准差正态分布N~(μ,duδ^2),2023-02-25Python160
Python填写问卷星有些无意义的问卷作业,真的没有必要。 但是作业既然有了,那就想办法解决它把。 关于IP限制的问题,可以使用X-Forwarded-For更换IP。 只会用印象笔记markdown的我,感觉markdown好复杂。 我想做个目2023-02-25Python230
R语言入门--第十四节(聚类分析)(1)定义每一个观测值为一类; (2)计算每一类和其它各类的距离; (3)把“距离”最短的两类合并成一类,这样类的个数就减少一个; (4)重复步骤1和步骤2,直到包含所有观测值的类合并成单个类为止。 基于5种营养标准含量(变2023-02-25Python140