R语言安装DESeq2包

R语言安装DESeq2包

DESeq2用来处理转录组数据。那么先来完成第一步:安装。 1、传统方式安装 麻蛋,报错了!!!!为什么受伤的总是我。 2、开启查阅资料模式,然后得到的结论是这个包的安装需要利用BiocConductor或者BiocManage
Python180
为什么要使用 Go 语言?Go 语言的优势在哪里?

为什么要使用 Go 语言?Go 语言的优势在哪里?

1、简单易学。Go语言的作者本身就很懂C语言,所以同样Go语言也会有C语言的基因,所以对于程序员来说,Go语言天生就会让人很熟悉,容易上手。2、并发性好。Go语言天生支持并发,可以充分利用多核,轻松地使用并发。 这是Go语言最大的特点
Python90
调节性R-loops:促进基因表达和基因组稳定性(二)

调节性R-loops:促进基因表达和基因组稳定性(二)

        当R-loop去除途径被干扰时,R-loops在基因体或启动子中的存在可干扰转录起始、延伸或终止。虽然这些后果乍一看似乎是有害的,但细胞以一种可控的方式利用这些特性来调节基因表达。         调控型R-loops通
Python250
R语言 R软件问题

R语言 R软件问题

《R语言4.0.4软件》百度网盘资源免费下载:链接: https:pan.baidu.coms160twe4ScMvIbGm2TI_sjHw?pwd=3ts7 提取码: 3ts7R语言4.0.4是一款专业的统计建模软件,与其它建
Python130
R代表些什么?

R代表些什么?

1、数学中的R数论的 R 表示集合理论中的实数集,而复数中的实数部分也以此符号为代表。几何学的R 或 r 表示一个圆的半径。几何学中,∠R则表示直角。几何学中,直角三角形可表示成Rt△,“Rt”出自英文right-angle(直角)
Python260
「GO富集分析」从原理到实践 ~ 零基础掌握

「GO富集分析」从原理到实践 ~ 零基础掌握

原本,我并无写这一稿件的想法。主要原因有二: 如果要找合理解释,那么针对第一点,就是每天仍然有大量新接触生信数据分析的朋友;针对第二点,......在前两天我推的文稿《零基础快速完成基因功能注释GOKEGGPFAM..
Python160
嵌套Venn图的绘制(R语言)

嵌套Venn图的绘制(R语言)

​如何在差异基因Venn图中同时标识上下调基因数量信息韦恩(Venn)图是常见统计图之一,用于展示各样本(或分组)之间共有(或特有)元素的数量(或比例)。例如做RNA-seq的最直接目的,大多是鉴定差异表达的基因。当试验涉及到多
Python140
GO语言(三十):访问关系型数据库(上)

GO语言(三十):访问关系型数据库(上)

本教程介绍了使用 Godatabasesql及其标准库中的包访问关系数据库的基础知识。 您将使用的databasesql包包括用于连接数据库、执行事务、取消正在进行的操作等的类型和函数。 在本教程中,您将创建一个数据
Python130
GO语言入门,有什么好的教程啊?

GO语言入门,有什么好的教程啊?

可以学习黑马程序员的这个教程20小时快速入门go语言:网页链接go语言的优势可直接编译成机器码,不依赖其他库,glibc的版本有一定要求,部署就是扔一个文件上去就完成了。静态类型语言,但是有动态语言的感觉,静态类型的语言就是可以在编
Python110
R语言初学笔记:差异表达基因

R语言初学笔记:差异表达基因

setwd("E:GSE25066")#环境设置 library(limma)#加载差异分析包limma #将分组文件加载到环境中,分组信息第一列为样本名,第二列为分组信息如“high”“low” targ
Python200
R语言DESeq2基因差异表达分析

R语言DESeq2基因差异表达分析

经过表达定量后,我们已经得到了基因的表达量矩阵,差异表达分析通常是RNA-seq分析的第一步。 差异基因表达分析通常都是在R中,常用的有DESeq2,edgeR,limma等几种,这次主要介绍用DESeq2来进行差异表达分析。 需
Python160
GSVA自定义基因集分析

GSVA自定义基因集分析

已经很久没有再用R语言跑过数据了,最近有朋友需要跑GSVA,顺便重温了下R,现将内容分享如下。 GSVA全名Gene set variation analysis(基因集变异分析),是一种非参数,无监督的算法。与GSEA不同,GSVA
Python220
为什么要使用 Go 语言?Go 语言的优势在哪里

为什么要使用 Go 语言?Go 语言的优势在哪里

1、学习曲线它包含了类C语法、GC内置和工程工具。这一点非常重要,因为Go语言容易学习,所以一个普通的大学生花一个星期就能写出来可以上手的、高性能的应用。在国内大家都追求快,这也是为什么国内Go流行的原因之一。2、效率Go拥有接近C的运行效
Python110
R语言DESeq2基因差异表达分析

R语言DESeq2基因差异表达分析

经过表达定量后,我们已经得到了基因的表达量矩阵,差异表达分析通常是RNA-seq分析的第一步。 差异基因表达分析通常都是在R中,常用的有DESeq2,edgeR,limma等几种,这次主要介绍用DESeq2来进行差异表达分析。 需
Python90
GO语言入门,有什么好的教程啊?

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可以学习黑马程序员的这个教程20小时快速入门go语言:网页链接go语言的优势可直接编译成机器码,不依赖其他库,glibc的版本有一定要求,部署就是扔一个文件上去就完成了。静态类型语言,但是有动态语言的感觉,静态类型的语言就是可以在编
Python190
go是什么意思

go是什么意思

一是一种编程语言,另一个是动词,表示走的意思。简介Go是谷歌2009年发布的第二款编程语言。2009年7月份,谷歌曾发布了Simple语言,它是用来开发Android应用的一种BASIC语言。 谷歌资深软件工程师罗布·派克(Rob
Python130
R语言绘制生存曲线95%区间

R语言绘制生存曲线95%区间

1. 安装和加载包绘制Kaplan-Meier生存曲线需要用到的R包:survminer和survival。 library(survminer) # 加载包 library(survival) # 加载包2 拟合曲
Python110
2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

下游分析 cellranger count 计算的结果只能作为错略观测的结果,如果需要进一步分析聚类细胞,还需要进行下游分析,这里使用官方推荐 R 包(Seurat 3.0) 流程参考官方外周血分析标准流程( https:sat
Python120
转座子的起源和存在的意义是什么?

转座子的起源和存在的意义是什么?

有人这么描述转座子:基因组从出现就一直在经历一场和转座子及逆转录病毒的战争。真核生物的基因组到处是这场战争留下的疤痕,比如人类的基因组有45%的内容都跟转座子有关。起源问题留给更专业的人来回答,要说到存在的意义,我来讲几个植物里的故事吧。1
Python140
Go语言命令行利器cobra使用教程

Go语言命令行利器cobra使用教程

可以学习黑马程序员的这个教程20小时快速入门go语言:网页链接go语言的优势可直接编译成机器码,不依赖其他库,glibc的版本有一定要求,部署就是扔一个文件上去就完成了。静态类型语言,但是有动态语言的感觉,静态类型的语言就是可以在编
Python90