GO(Gene Ontology)

GO(Gene Ontology)

Ontology 首先是出现于哲学领域的一个词汇,后来广泛用于计算机领域,发挥了很重要的作用,再后来这个概念被引入生物领域。 gene Ontology 是生物中Ontology中一个重要应用。go项目最初是由研究三种模式生物(果蝇、小
Python130
用topGO进行GO富集分析

用topGO进行GO富集分析

topGO是一个半自动的GO富集包,该包的主要优势是集中了好几种统计检验的方法,目前支持的统计方法如下:BiocManager::install('topGO')需要R的版本为&gt=2.10,但
Python120
为什么要使用 Go 语言?Go 语言的优势在哪里?

为什么要使用 Go 语言?Go 语言的优势在哪里?

1、简单易学。Go语言的作者本身就很懂C语言,所以同样Go语言也会有C语言的基因,所以对于程序员来说,Go语言天生就会让人很熟悉,容易上手。2、并发性好。Go语言天生支持并发,可以充分利用多核,轻松地使用并发。 这是Go语言最大的特点
Python120
差异表达1|edgeR和DeSeq2

差异表达1|edgeR和DeSeq2

1. 过滤低表达的基因仅保留在两个样品或更多样本中CPM&gt1的基因CPM=Reads(total reads in the sample1,000,000)问题:会受到测序深度的影响 2. 选择一
Python130
为什么要使用 Go 语言?Go 语言的优势在哪里?

为什么要使用 Go 语言?Go 语言的优势在哪里?

1、简单易学。Go语言的作者本身就很懂C语言,所以同样Go语言也会有C语言的基因,所以对于程序员来说,Go语言天生就会让人很熟悉,容易上手。2、并发性好。Go语言天生支持并发,可以充分利用多核,轻松地使用并发。 这是Go语言最大的特点
Python220
如何用r语言实现布丰投针问题?

如何用r语言实现布丰投针问题?

原文链接:http:tecdat.cn?p=13033介绍布丰投针是几何概率领域中最古老的问题之一。它最早是在1777年提出的。它将针头掷到有平行线的纸上,并确定针和其中一条平行线相交的可能性。令人惊讶的结果是概率与pi的值直接相
Python120
2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

下游分析 cellranger count 计算的结果只能作为错略观测的结果,如果需要进一步分析聚类细胞,还需要进行下游分析,这里使用官方推荐 R 包(Seurat 3.0) 流程参考官方外周血分析标准流程( https:sat
Python130
2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

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下游分析 cellranger count 计算的结果只能作为错略观测的结果,如果需要进一步分析聚类细胞,还需要进行下游分析,这里使用官方推荐 R 包(Seurat 3.0) 流程参考官方外周血分析标准流程( https:sat
Python110
如何读取25q16cvsig的数据

如何读取25q16cvsig的数据

如何读取25q16cvsig的数据在R语言里面,有很多读取数据的方法。R能读文本文件,csv格式文件,通过RODBC包读取数据库数据等等。下面我介绍几种最基本的读取数据的方法!工具原料RStudio方法不管是读取数据还是写入,R都是在工作
Python120
肖战在机场抱的娃娃叫什么

肖战在机场抱的娃娃叫什么

肖战在机场抱的娃娃叫薯条布偶。肖战大家现在都非常熟悉了,因为饰演了魏无羡得到了大家的关注。其实肖战已经出道很多年了,但是一直以来都没有太高的人气,还是因为《陈情令》才得到大家的关注和喜爱。肖战抱的是薯条布偶,看起来非常可爱。不过哥哥看起来也
Python290
R语言初学笔记:差异表达基因

R语言初学笔记:差异表达基因

setwd("E:GSE25066")#环境设置 library(limma)#加载差异分析包limma #将分组文件加载到环境中,分组信息第一列为样本名,第二列为分组信息如“high”“low” targ
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2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

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下游分析 cellranger count 计算的结果只能作为错略观测的结果,如果需要进一步分析聚类细胞,还需要进行下游分析,这里使用官方推荐 R 包(Seurat 3.0) 流程参考官方外周血分析标准流程( https:sat
Python230
昂飞基因芯片ID_REF 如何与基因名称对应

昂飞基因芯片ID_REF 如何与基因名称对应

这是探针号,基因芯片是检测基因表达水平的工具,探针后面的数字是基因和探针杂交后,经过镭射处理的表达值,批量处理有很多软件可以使用,比如R语言bioconducror,具体你可以去bioconductor官网学习,里面有很多packages,
Python140