R语言常用函数(基本)

R语言常用函数(基本)

vector:向量 numeric:数值型向量 logical:逻辑型向量 character;字符型向量 list:列表data.frame:数据框 c:连接为向量或列表 sequence:等差序列 rep:重复 length
Python150
R语言中$是什么意思

R语言中$是什么意思

$是S3类的引用方式,@是S4类的引用方式。$比较常用,@比较少用。通常我们的data.frame, list. 向量等用$就可以。S4也有例如,有个维恩包Vennerable:S4类型,想取得里面IntersectionSets,信息必
Python90
R语言字符串处理常用函数

R语言字符串处理常用函数

R语言字符串处理常用函数R语言中常用的字符串处理函数:(1)得到字符串长度:nchar()# 生成示范字符串(2)剪切字符串:strsplit()# 对字符串进行剪切(3) 得到子字符串:substr()# 得到子字符串(4) 判断字符串中
Python80
R语言里面的因子

R语言里面的因子

R语言中的因子确实不好理解,很多人都这么觉得。在R语言中,因子(factor)表示的是一个符号、一个编号或者一个等级,即,一个点。例如,人的个数可以是1,2,3,4......那么因子就包括,1,2,3,4.....还有统计量的水平的时候用
Python90
R语言操作——TCGA数据处理

R语言操作——TCGA数据处理

获取表达矩阵,处理TCGA的count数据,1表示为行。 导入数据 加 ENTREZID列,用于富集分析(symbol转entrezid,然后inner_join) 转化空格为NA 用花花的专属TCGA包,ID进行转换
Python130
r语言 sys.setlocale怎么修改默认中文

r语言 sys.setlocale怎么修改默认中文

在Windows 操作系统中,可在桌面上右键点击R的图标,并在弹出的窗口点击属性,然后在属性窗口的目标框中...Rgui.exe后面加上空格及language=English 即可!R语言常用函数整理本篇是基础篇,即R语言自带的函数。
Python90
R语言与统计-3:卡方检验

R语言与统计-3:卡方检验

R语言与统计-1:t检验与秩和检验 R语言与统计-2:方差分析拟合优度检验是用卡方统计量进行统计显著性检验的重要内容之一。它是依据总体分布状况,计算出分类变量中各类别的期望频数,与分布的观察频数进行对比,判断期望频数与观察频数是否有
Python100
R语言数据对象与运算

R语言数据对象与运算

R语言数据对象与运算R语言数据对象与运算 笔记整理2.1 数据对象及类型R语言创建和控制的实体被称为对象(object)ls()命令来查看当前系统里的数据对象R对象的名称必须以一个英文字母打头,并由一串大小写字母、数字或钟点组成注意:R区分
Python130
使用R语言将fasta转phylip格式

使用R语言将fasta转phylip格式

使用paml软件里的mcmctree功能需要phylip格式的比对结果,找了以下,发现用R包phylotools转化最方便,另外提醒一下要用mcmctree的朋友,我发现mcmctree的序列名字长度不能超过50个字符,如果超出的话,建议先
Python130
R语言常用函数整理(基础篇)

R语言常用函数整理(基础篇)

R语言常用函数整理本篇是基础篇,即R语言自带的函数。 vector:向量 numeric:数值型向量 logical:逻辑型向量 character;字符型向量 list:列表 data.frame:数据框 c:
Python200
R语言中如何解决unexpected symbol in 的问题?

R语言中如何解决unexpected symbol in 的问题?

解决方法:第一句赋值号“&lt-”前后加空格。或直接改成“=”。输入法改成纯英文,再手打一遍代码。不要从网页、pdf等直接复制代码。建议在纯英文环境code。R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个
Python160
R语言DESeq2基因差异表达分析

R语言DESeq2基因差异表达分析

经过表达定量后,我们已经得到了基因的表达量矩阵,差异表达分析通常是RNA-seq分析的第一步。 差异基因表达分析通常都是在R中,常用的有DESeq2,edgeR,limma等几种,这次主要介绍用DESeq2来进行差异表达分析。 需
Python130
C语言 求矩阵各行各列的和

C语言 求矩阵各行各列的和

思路:求矩阵各行的和时,矩阵的行先不变,利用for循环依次遍历该行的每一列元素累加求和;求矩阵各列的和时,矩阵的列先不变,利用for循环依次遍历该列的每一行元素累加求和。参考代码:#include&ltstdio.h&g
Python90
R语言数据对象与运算

R语言数据对象与运算

R语言数据对象与运算R语言数据对象与运算 笔记整理2.1 数据对象及类型R语言创建和控制的实体被称为对象(object)ls()命令来查看当前系统里的数据对象R对象的名称必须以一个英文字母打头,并由一串大小写字母、数字或钟点组成注意:R区分
Python130