R语言之创建数据集R语言之创建数据集数据集通常是由数据构成的一个矩形数组,行表示观测,列表示变量。R中有许多用于存储数据的结构,包括标量、向量、数组、数据框和列表。在R中,对象(object)是指可以赋值给变量的任何事物,包括常量、数据结构、函数、甚至是图形2023-03-02Python80
R语言:截取细菌分类信息门、科、属data.txt 思路:1 strsplit切割,切割后的结果是列表格式,用unlist转成数组 2 用paste(c(), collapse="_")把菌科菌属粘贴到一起paste(a, b,2023-03-02Python120
r怎么把图例设置在绘图区外1. 如何将barplot图例做到绘图区外.txt 下面的代码包括了折线图和直方图的实现: 1、.h文件:#import #import 散点图的数据点数: 20#define num 20@interface BarChartView2023-03-01Python60
单细胞数据处理小细节汇总1. Seurat对象查看当前的Assay 在进行了SCTransform操作后,矩阵默认会变成SCT矩阵,如果不加设置,后续的PCA等操作都是基于SCT矩阵。 修改DefaultAssay: 2. Seurat使用FindV2023-03-01Python120
2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1下游分析 cellranger count 计算的结果只能作为错略观测的结果,如果需要进一步分析聚类细胞,还需要进行下游分析,这里使用官方推荐 R 包(Seurat 3.0) 流程参考官方外周血分析标准流程( https:sat2023-03-01Python130
基于R语言绘制Network几种方式孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)是以孟德尔独立分配定律为基础进行流行病学研究设计和数据分析,论证病因假说的一种方法。由基因型决定中间表型(暴露)的差异, 因果方向明确。通过引入一个称之为工具变量的中间变量2023-03-01Python170
python遗传算法目标函数怎么编一、遗传算法介绍遗传算法是通过模拟大自然中生物进化的历程,来解决问题的。大自然中一个种群经历过若干代的自然选择后,剩下的种群必定是适应环境的。把一个问题所有的解看做一个种群,经历过若干次的自然选择以后,剩下的解中是有问题的最优解的。当然,只2023-02-28Python150
GO数据库介绍(转载)类似于语义网络。是为了生物界有一个统一的数据交流语言。 因为在生物学界,存在在种种同名异义、异议同名的现象。为此产生了GO项目。 GO是用一套统一的词汇表来描述生物学中的分子功能、生物过程和细胞成分。其思想大概过程:对于一个基因产品(蛋2023-02-28Python170
Go语言有什么优势?GO语言的优势:可直接编译成机器码,不依赖其他库,glibc的版本有一定要求,部署就是扔一个文件上去就完成了。静态类型语言,但是有动态语言的感觉,静态类型的语言就是可以在编译的时候检查出来隐藏的大多数问题,动态语言的感觉就是有很多的包可以使2023-02-28Python190
想把GO当第二语言,网上哪些教GO的课程比较好?go也是我的第二语言,我对比过很多家平台,觉得还是慕课网的go课程更好,实用性比较强。尤其是我学的这门go开发工程师,除了理论还有大量的实战项目,感觉很实在。不过这门课最近做活动,我买的贵了,sad...可以学习黑马程序员的这个教程20小2023-02-28Python130
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基于R语言绘制Network几种方式我们输入的数据包含 gene ID 和 vector(单样本)部分,这里的 gene ID 是一个通用概念,可以是基因、转录本、酶或蛋白质。这里的 vector 可以是样本的表达量、倍数变化, p-value, 组蛋白修饰数据等可测量的属2023-02-28Python100
R语言数据过拟合怎么办这是代码加速的问题。且默认您的数据读入速度没有问题(数据量级在百万以下)。如果只是建立模型的那一行代码跑的很慢,如果建立模型的代码本身没有提供并行计算功能,部分模型可以尝试把公式换成则分别传入x=, y= 参数,多数模型无法加速。再除非有2023-02-28Python120
Go语言有什么优势?GO语言的优势:可直接编译成机器码,不依赖其他库,glibc的版本有一定要求,部署就是扔一个文件上去就完成了。静态类型语言,但是有动态语言的感觉,静态类型的语言就是可以在编译的时候检查出来隐藏的大多数问题,动态语言的感觉就是有很多的包可以使2023-02-28Python110
go语言到底有什么好处1. 部署简单Go 编译生成的是一个静态可执行文件,除了glibc外没有其他外部依赖。这让部署变得异常方便:目标机器上只需要一个基础的系统和必要的管理、监控工具,完全不需要操心应用所需的各种包、库的依赖关系,大大减轻了维护的负担。2. 并发2023-02-28Python70
R语言相关系数图corplot怎样只显示下半边画上三角矩阵 corrplot(M, type = "upper")供参考。corrplot中参数详解corrplot(corr, method = c("circle", "sq2023-02-28Python180
R语言初学笔记:差异表达基因setwd("E:GSE25066")#环境设置 library(limma)#加载差异分析包limma #将分组文件加载到环境中,分组信息第一列为样本名,第二列为分组信息如“high”“low” targ2023-02-28Python140
R语言 计算机 sample()是什么意思?随机取样?大致相当于排列组合中的组和,官方的函数解释:sample(x,size[,replace=TF]):随机在向量x中抽取size个元素,选项replace=T允许放回抽取,replace=F则为一次性抽取。这里有个函数参考的帖子:h2023-02-28Python150
有哪些适合自学的编程书籍推荐?推荐《每个程序员都应该知道的97件事情》对于编程初学者来说这本书都可以算上一个优质的入门书籍。本书提供了丰富的编程实践及理念,提供了大量的实例,并且书的排版格式阅读起来十分简洁方便。可以学习黑马程序员的这个教程20小时快速入门go语言:网2023-02-28Python140
R语言:ggplot主题包ggthemes参考: ggthemes: Extra Themes, Scales and Geoms for 'ggplot2' 输入数据 默认背景画图 常用背景1:theme_bw 常用背景2:t2023-02-28Python110