R语言:有关差异分析的检验方法

R语言:有关差异分析的检验方法

1 读取,计算均值,箱图观察 2 查看数据分布 2.1 hist直方图 2.2 qqnorm散点图 3 Shapiro-Wilk正态性检验 4 方差齐性检验意义:方差分析就是在大家误差水平
Python200
南北文化差异体现在哪些方面?

南北文化差异体现在哪些方面?

南北文化差异体现在哪些方面?南北文化的差异使得中国文化更为丰富多彩,因而从古至今不乏有大批文人对此产生浓厚兴趣,康白情的《论中国之民族气质》,鲁迅的《北人与南人》,赵无眠的《南人 北人》畅谈着他们对南北文化差异的看法。而与此有关的一直挺
Python170
R语言与统计-1:t检验与秩和检验

R语言与统计-1:t检验与秩和检验

一般根据数据是否符合正态分布,选择合适的统计方法: T检验,亦称student t检验(Student's t test),主要用于样本含量较小(例如n&lt30),总体标准差σ未知的正态分布资料。t检验是用t分布理
Python210
如何求一年的月人均生产量

如何求一年的月人均生产量

建议用出勤表统计每个人的上班数.按21班为1个月,得R.DR表示每人每月的平均产量。(D1+D2+D3)(R1+R2+R3)表示一季度每人每月平均生产量。 你可以在载入的时候就把这个问题解决。比如,如果是.xlsx的数据,用read.x
Python230
《R语言实战》自学笔记44-t检验

《R语言实战》自学笔记44-t检验

数据准备t检验,亦称student t检验(Student's t test),主要用于样本含量较小(例如n &lt30),总体标准差σ未知的正态分布。t检验是用t分布理论来推论差异发生的概率,从而比较两个平均
Python160
DNA甲基化测序数据处理(二):差异分析

DNA甲基化测序数据处理(二):差异分析

衔接上一篇数据比对后的结果,使用R包DSS进行处理。 我们先来复习一下上一节课得到的数据结果:*.bismark.cov.gz文件 这里我们使用的R包为DSS,使用 Bioconductor 进行安装。 这个包可以对甲基化
Python180
什么是mk检验

什么是mk检验

mk检验是曼-肯德尔法,又称Mann—Kenddall 检验法,是一种气候诊断与预测技术,应用Mann-Kendall检验法可以判断气候序列中是否存在气候突变,如果存在,可确定出突变发生的时间。Mann-Kendall检验法也经常用于气候变
Python210
R语言GEO数据挖掘:步骤三:进行基因差异分析

R语言GEO数据挖掘:步骤三:进行基因差异分析

用limma包,这里注意,limma包是对基因芯片表达矩阵的分析,不能对逆转录RNAseq表达矩阵进行分析(因为数据特征不同),RNAseq需要用另一种方法 解读此表 但是上面的用法做不到随心所欲的指定任意两组进行比较,所有还有下一
Python180
R语言GEO数据挖掘:步骤三:进行基因差异分析

R语言GEO数据挖掘:步骤三:进行基因差异分析

用limma包,这里注意,limma包是对基因芯片表达矩阵的分析,不能对逆转录RNAseq表达矩阵进行分析(因为数据特征不同),RNAseq需要用另一种方法 解读此表 但是上面的用法做不到随心所欲的指定任意两组进行比较,所有还有下一
Python120
r语言可以完成生物信息哪些工作

r语言可以完成生物信息哪些工作

R可以完成:1、处理一些简单的有格式的文本数据,包括矩阵等2、画一些简单的统计图,比如直方图,箱线图等3、分析一些专门的数据,比如芯片数据,RNA-seq数据等4、画一些专业的图,比如热图之类的 【适用条件】 已知一个总体均数;可得到一
Python200
R语言绘制配对样品箱线图

R语言绘制配对样品箱线图

配对箱线图,常见于配对样本的数据分析中。 例如下图示例,为了研究某些基因在肿瘤组织和正常组织中是否具有表达量的显著不同,在取样时,往往会在同一患者个体中同时获取肿瘤和临近正常组织,两个组织样本就是配对关系。当然在这类研究中,往往需要调查
Python170
R语言GEO数据挖掘:步骤三:进行基因差异分析

R语言GEO数据挖掘:步骤三:进行基因差异分析

用limma包,这里注意,limma包是对基因芯片表达矩阵的分析,不能对逆转录RNAseq表达矩阵进行分析(因为数据特征不同),RNAseq需要用另一种方法 解读此表 但是上面的用法做不到随心所欲的指定任意两组进行比较,所有还有下一
Python210
实验设计的PB实验是什么?

实验设计的PB实验是什么?

Plackett-Burman试验就是筛选试验设计,主要针对因子数较多,且未确定众因子相对于响应变量的显著性是,采用的试验设计方法。方法主要通过对每个因子取两水平来进行分析,通过比较各个因子两水平的差异与整体的差异来确定因子的显著性。筛选试
Python170
《R语言实战》自学笔记44-t检验

《R语言实战》自学笔记44-t检验

数据准备t检验,亦称student t检验(Student's t test),主要用于样本含量较小(例如n &lt30),总体标准差σ未知的正态分布。t检验是用t分布理论来推论差异发生的概率,从而比较两个平均
Python360
什么是Jenks最佳自然断裂法?

什么是Jenks最佳自然断裂法?

jenks最佳自然断裂法是指:类内差异最小,类间差异最大。是Jenks提出的一种地图分级算法,认为数据本身有断点,可利用数据这一特点分级。算法原理是一个小聚类,聚类结束条件是组间方差最大、组内方差最小。类内差异最小,类间差异最大。扩展
Python270
R语言 求秩和检验

R语言 求秩和检验

x=rep(1:4, c(4,10,15,1))y=rep(3:7, c(2,9,2,4,2))wilcox.test(x,y,exact=FALSE)p-value=10e-8&lt.05拒绝原假设可认为两组总胆红素存在差异;T检
Python350
Java 可不可以做图像识别的系统

Java 可不可以做图像识别的系统

当然可以。一、纯JAVA开发的技术可行性,即JAVA是否能够实现图像识别的各种算法。二、如果第一点没有问题,纯JAVA与C++相比,开发效率上的差异。效率要低很多,和具体问题有关。三、如果第一点没有问题且第二点差异不太大时,纯JAVA与C+
Python170