1. NaN
R中的无定义数用NaN表示，即“Not a Number（非数）”。
不过在R中，R实际上是把NaN视作一个数的，当其参与运算时，返回结果总是NaN。我们可以使用is.nan()函数来检测计算结果有无定义，但是需要注意的是，对于NaN而言，is.finite()和is.infinite()都会返回FALSE。
2. NA
NA表示缺失值，即“Missing value”，是“not available”的缩写
3. Inf
R中的无穷大用Inf表示（即Infinity，无穷大），负无穷表示为-Inf。
要检查一个数是否为无穷，可以使用is.finite()或者is.infinite()函数
3. NULL
R语言中，NA代表位置上的值为空，NULL代表连位置都没有，变量为空，其长度为0，表明“空无一物”
将两个数据进行除法运算
而log2_foldchange就是我们需要的数据，发现里面有许多 NaN、 -Inf 、Inf ，想办法进行数据清洗。
都到这一步了，再绘制两个图形玩玩:
R语言中存在一些空值（null-able values），当我们进行数据分析时，理解这些值是非常重要的。
通常来说，R语言中存在：
这四种数据类型在R中都有相应的函数用以判断。
NA即Not available，是一个 长度为1的逻辑常数 ，通常代表缺失值。NA可以被强制转换为任意其他数据类型的向量。
可以采用is.na()进行判断。另外，NA和“NA”不可以互换。
NULL是一个 对象（object） ，当 表达式或函数产生无定义的值 或者 导入数据类型未知的数据 时就会返回NULL。
可以采用is.null()进行判断。
NaN即Not A Number，是一个 长度为1的逻辑值向量 。
可以采用is.nan()进行判断。另外，我们可以采用is.finite()或is.infinite()函数来判断元素是有限的还是无限的，而对NaN进行判断返回的结果都是False。
Inf即Infinity无穷大，通常代表一个很大的数或以0为除数的运算结果，Inf说明数据并没有缺失（NA）。
可以采用is.finite()或is.finite()进行判断。
理解完四种类型数值以后，我们来看看该采取什么方法来处理最最常见的缺失值NA。
小白学统计在推文《有缺失值怎么办？系列之二：如何处理缺失值》里说“ 处理缺失值最好的方式是什么？答案是：没有最好的方式。或者说，最好的方式只有一个，预防缺失，尽量不要缺失。 ”
在缺失数很少且数据量很大的时候，直接删除法的效率很高，而且通常对结果的影响不会太大。
如数据框df共有1000行数据，有10行包含NA，不妨直接采用函数na.omit()来去掉带有NA的行，也可以使用tidyr包的drop_na()函数来指定去除哪一列的NA。
用其他数值填充数据框中的缺失值NA。
使用tidyr包的replace_na()函数。
使用tidyr包的fill()函数将上/下一行的数值填充至选定列中NA。
除此之外，类似原理的填充法还有均值填充法（用该变量的其余数值的均值来填充）、LOCF（last observation carried forward）、BOCF（baseline observation carried forward）、WOCF（worst observation carried forward）等。
当分类自变量出现NA时，把缺失值单独作为新的一类。
在性别中，只有男和女两类，虚拟变量的话以女性为0，男性为1。如果出现了缺失值，可以把缺失值赋值为2，单独作为一类。由于将缺失值赋值，在统计时就不会把它当做缺失值删除，避免了由于这一个变量缺失而导致整个观测值被删除的情况。
假定有身高和体重两个变量，要填补体重的缺失值，我们可以把体重作为因变量，建立体重对身高的回归方程，然后根据身高的非缺失值，预测体重的缺失值。
参考资料：
R语言-v1-基础知识
Iretara 12-17 21:18
以例题的形式简述R语言基础知识
# 读取文件
setwd(" 文件链接的时候，用 / ")
install.packages(" readxl ")
library(readxl)
library (tidyverse)
hw1_a<- read_excel ("hw1_a.xlsx", col_types=c("numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric") )
hw1_b<- read_excel ("hw1_b.xlsx")
#读取csv
library(readr)
hw1_a<- read_csv ("/")
View(hw1_a)
# 描述型函数
hw1_a + hw1_b 表
#描述最小值，最大值，中值，均值，标准差
Str (hw1_a) #查看数据并指出各个 变量的形式
summary (hw1_a) #指出各个变量的形式， 最小值，最大值，中值，均值
library(psych)
describe (hw1_a) #比summary更简便的方法， 可以直接读取标准差等；但是，使用describe不可读取 NA值, 可以尝试使用 Hmisc包中 describe
描述型函数-R
# 连接
hw1_a %>% inner_join (hw1_b, by ="ID")
hw1_a %>% left_join (hw1_b, by ="ID")
hw1_a %>% right_join (hw1_b, by ="ID")
hw1_a %>% full_join (hw1_b, by ="ID")
inner_join<- inner_join (hw1_a,hw1_b, by =“ID”) #报告合并后的 总行数 ，178行
full_join<- full_join (hw1_a,hw1_b, by ="ID")
( nrow (full_join)) #报告合并后的 总行数 ，200行
> length (full_join$ID)
#找出各个列的 缺失值
i<-NA
a<-NA
for(i in 1:length(full_join[1,])){ a[i]<- sum(is.na( full_join[,i] ) ) }
paste("缺失值是",a)
#缺失值总数
sum(is.na(full_join))
#删除缺失值 na.omit()
full_join1=filter(full_join,!is.na(full_join[2]))
full_join1=filter(full_join1,!is.na(full_join1[3]))
full_join1=filter(full_join1,!is.na(full_join1[4]))
full_join1=filter(full_join1,!is.na(full_join1[5]))
full_join1=filter(full_join1,!is.na(full_join1[6]))
full_join1=filter(full_join1,!is.na(full_join1[7]))
full_join1=filter(full_join1,!is.na(full_join1[8]))
sum(is.na(full_join1))
找出Income中的 极端值 并滤掉对应行的数据
quantile (hw1_a$Income,c(0.025,0.975))
hw1_a2= filter (hw1_a,Income>14168.81 &Income<173030.92)
#使用dplyr进行数据转换
arrange()
>arrange (hw1_a,Income) #默认升序
>arrange(hw1_a, desc (Income)) #desc降序，NA排序一般最后
select()
>select (hw1_a, - (Years_at_Address:Income)) #不要变量
>rename (hw1_a, In_come=Income) #改名
>select（hw1_a,Income, exerything ()） #把Income放在前面
拓例题1：
library(nycflights13)
view(flights)
#counts
（1）
not_cancelled <- flights %>%
filter(! is.na(dep_delay), !is.na(arr_delay))
（2）
not_cancelled %>%
group_by (year,month,day) %>%
summarize (mean=mean(dep_delay))
（3）
delays <- not_cancelled %>%
group_by (tailnum) %>%
summarize (delay=mean(arr_delay))
ggplot (data=delays,mapping=aes(x= delay))+
geom_freqpoly (binwidth=10) #freqpoly
（4）
delays <- not_cancelled %>%
group_by(tailnum) %>%
summarize(delay=mean(arr_delay,na.rm=TRUE), n=n() ) #tailnum的次数
ggplot(data=delays,mapping=aes(x= n, y=delay))+
geom_point(alpha=1/10)
拓例题2：
#请按照价格的均值，产生新的变量price_new, 低于均值为“低价格”，高于均值为“高价格”。 同样对市场份额也是，产生变量marketshare_new, 数值为“低市场份额”和“高市场份额”
price=data1$price
pricebar=mean(price)
price_new= ifelse (price>pricebar,“高价格”,”低价格”)
marketshare=data1$marketshare
marketsharebar=mean(marketshare)
marketshare_new=ifelse(marketshare>marketsharebar ,“高市场份额”,”低市场份额”)
data1= mutate (data1,price_new,marketshare_new)
#可视化
#将Income 对数化
lninc<- log (hw1_a$Income)
#画出直方图和 density curve密度曲线
hist (lninc,prob=T)
lines ( density (lninc),col="blue")
# 添加额外变量 的办法，在 aes()中添加 样式 (color、size、alpha、shape)
ggplot(data=inner_join)+
geom_point(mapping = aes(x=Years_at_Employer,y= Income, alpha= Is_Default))
# 按照Is_Default 增加一个维度，使用明暗程度作为区分方式
ggplot(data=inner_join)+
geom_point(mapping = aes(x=Years_at_Employer,y= Income,
alpha=factor( Is_Default ) ))
#使用形状作为另外一种区分方式
ggplot(data=inner_join)+
geom_point(mapping = aes(x=Years_at_Employer,y= Income,
shape=factor( Is_Default)))
可视化-R
拓展：
#将 flight1 表和 weather1 表根据共同变量进行内连接，随机抽取 100000 行数据， 将生产的结果保存为 flight_weather。 (提示：sample_n()函数，不用重复抽取)
flight_weather <- inner_join(flight1, weather1) %>% sample_n(100000)
# 从 flight_weather表中对三个出发机场按照平均出发延误时间排降序，并将结果保留在 longest_delay表中。把结果展示出来
longest_delay<- flight_weather %>%
group_by(origin) %>%
summarize(delay=mean(dep_delay, na.rm=TRUE )) %>%
arrange(desc(delay))
#根据不同出发地（origin）在平行的 3 个图中画出风速 wind_speed（x 轴）和出发 延误时间 dep_delay（y 轴）的散点图。
ggplot(data= flight_weather) +
geom_point(mapping=aes(x=wind_speed,y=dep_delay))+
facet_grid(.~origin, nrow = 3 ) # 按照class分类，分成3行
#根据 flight_weather 表，画出每个月航班数的直方分布图，x 轴为月份，y 轴是每个 月份航班数所占的比例。
ggplot(data=flight_weather)+
geom_bar(mapping=aes(x=month, y=..prop .., group=1))
#根据 flight_weather 表，画出每个月航班距离的 boxplot 图，x 轴为月份，y 轴为 航行距离, 根据的航行距离的中位数从低到高对 x 轴的月份进行重新排序
ggplot(data=flight_weather)+
geom_boxplot(mapping=aes(x= reorder (month,distance,FUN=median),y=distance))
线性回归
# 以Income作为因变量，Years at Employer作为自变量，进行 OLS回归
m1<- lm (Income ~ Years_at_Employer,data=hw1_a)
#通过***判断显著性
summary (m1)
#画出拟合直线
ggplot(data= hw1_a)+
geom_point(aes(x=Income,y=Years_at_Employer))+
geom_abline(data= m1,col= "blue")
#证明拟合直线是最优的
b0=runif(20000,-5,5)
b1=runif(20000,-5,5)
d<-NA
sum<-NA
n<-1
while(n<=20000){
for(i in 1:24){
d[i]<-(hw1_a $ Income[i]-b0[n]-b1[n]*hw2$ Years_at_Employer[i])^2}
sum[n]<-sum(d)
n<-n+1
}
resi=m1$residuals
resi2=sum(resi^2)
check=sum(as.numeric(sum<resi2))
check
