使用R语言将fasta转phylip格式

使用R语言将fasta转phylip格式

使用paml软件里的mcmctree功能需要phylip格式的比对结果,找了以下,发现用R包phylotools转化最方便,另外提醒一下要用mcmctree的朋友,我发现mcmctree的序列名字长度不能超过50个字符,如果超出的话,建议先
Python120
python列表索引out of range是什么意思?

python列表索引out of range是什么意思?

在python中,list index out of range意思是列表的索引分配超出列范围。对于有序序列: 字符串 str 、列表 list 、元组 tuple进行按索引取值的时候,默认范围为 0 ~ len(有序序列)-1,计数从0
Python100
python 中的map(转载)

python 中的map(转载)

1 map()函数的简介以及语法: map是python内置函数,会根据提供的函数对指定的序列做映射。 map()函数的格式是: map(function,iterable,...) 第一个参数接受一个函数名,后面的参数接受
Python50
python程序基本结构有哪三种

python程序基本结构有哪三种

python中有三大控制结构,分别是顺序结构、分支结构以及循环结构,任何一个项目或者算法都可以使用这三种结构来设计完成。第一:顺序结构顺序结构就是按照你写的代码顺序执行,也就是一条一条语句顺序执行。这种结构的逻辑最简单,就是按顺序执行就行了
Python60
想使用马尔科夫模型,用什么语言编程

想使用马尔科夫模型,用什么语言编程

将C语言实现的隐马尔科夫模型算法(UMDHMM)改为C#语言实现。功能描述:前向算法(forward algorithm):给定HMM求一个观察序列的概率(评估)后向算法(backward algorithm):给定HMM求一个观察序列的概
Python210
python常用序列结构

python常用序列结构

序列是python的基本数据结构,序列中的每个元素被分配一个序号即索引,索引从0开始。序列的两种常用类型:列表和元组。列表与元组的区别:列表可修改,元组不能修改。通用序列操作1、索引:索引0指向第一个元素,索引-1指向最后一个元素。2、程序
Python150
python入门教程

python入门教程

《【3】学习视频》百度网盘资源免费下载链接:https:pan.baidu.coms1M89UGS4TQFxL6DiMiM1ZYA提取码:m6tm【3】学习视频|python视频教程|Python入门基础视频教程|lets py
Python110
90-预测分析-R语言实现-时间序列1

90-预测分析-R语言实现-时间序列1

时间序列(time series)是随机变量Y 1 、Y 2 、……Y t 的一个序列,它是由等距的时间点序列索引的。 一个时间序列的均值函数就是该时间序列在某个时间索引t上的期望值。一般情况下,某个时间序列在某个时间索引t 1 的均
Python140
如何利用python实现bass模型

如何利用python实现bass模型

步骤如下:1、下载maven的bin,在apache官方网站可以下载。2、下载下来之后,解压,找个路径放进去, 把bin的位置设在环境变量里,新建环境变量MAVEN_HOME。3、在PATH里加入maven的bin的路径。4、配置完毕后,在
Python130
python中for循环的用法

python中for循环的用法

python中for循环常用于遍历字符串、列表、元组、字典、集合等序列类型,逐个获取序列中的各个元素。在使用 for 循环时,最基本的应用就是进行数值循环。在使用 for 循环遍历字典时,经常会用到和字典相关的 3 个方法,即 items(
Python140
如何在Python中用LSTM网络进行时间序列预测

如何在Python中用LSTM网络进行时间序列预测

时间序列模型时间序列预测分析就是利用过去一段时间内某事件时间的特征来预测未来一段时间内该事件的特征。这是一类相对比较复杂的预测建模问题,和回归分析模型的预测不同,时间序列模型是依赖于事件发生的先后顺序的,同样大小的值改变顺序后输入模型产生
Python140
用R语言对vcf文件进行数据挖掘.2 方法简介

用R语言对vcf文件进行数据挖掘.2 方法简介

目录vcfR 可以直接读取vcf格式的数据。如果同时读取参照序列fasta格式的序列文件和gff格式文件的注释文件还可以获取更完整的信息(此步骤并非必须,可以只读取vcf数据)。在此处便于重复用到了 pinfsc50 包。这个包里是
Python6490
python 8个常用内置函数解说

python 8个常用内置函数解说

8个超好用内置函数set(),eval(),sorted(),reversed(),map(),reduce(),filter(),enumerate()python中有许多内置函数,不像print那么广为人知,但它们却异常的强大,用好了
Python200
彻底搞懂python序列的切片操作

彻底搞懂python序列的切片操作

切片是python极其有用且强大的功能。它使我们能够使用简单明了的语法来操作序列,包括字符串、列表、元组。切片简单来说就是从序列中切取咱们需要的值,并生成一个新的序列,理论上来说,只要表达式正确,我们可以通过切片切取序列中的任意值。
Python230
Python中 for 语句的用法?

Python中 for 语句的用法?

Python 中的 for 语句和 C 或 Pascal 中的略有不同。通常的循环可能会依据一个等差数值步进过程(如 Pascal),或由用户来定义迭代步骤和中止条件(如 C ),Python 的 for 语句依据任意序列(链表或字符串)中
Python200