R语言计算β多样性指数及分析

R语言计算β多样性指数及分析

计算β多样性指数需要用到phyloseq包。它的安装方式不同于简单的install.packages(“phyloseq”) 有两种方法可以安装 1.先安装BiocManager install.packages("B
Python110
R语言数据对象与运算

R语言数据对象与运算

R语言数据对象与运算R语言数据对象与运算 笔记整理2.1 数据对象及类型R语言创建和控制的实体被称为对象(object)ls()命令来查看当前系统里的数据对象R对象的名称必须以一个英文字母打头,并由一串大小写字母、数字或钟点组成注意:R区分
Python140
R语言定义多维数组

R语言定义多维数组

R语言定义多维数组数组有一个特征属性叫做维数向量(dim属性),维数向量是一个元素取正整数值的向量 ,其长度是数组的维数,比如维数向量有两个元素时数组为二维数组(矩阵)。维数向量的 每一个元素指定了该下标的上界,下标的下界总为1。一组值
Python150
R语言之创建数据集

R语言之创建数据集

R语言之创建数据集数据集通常是由数据构成的一个矩形数组,行表示观测,列表示变量。R中有许多用于存储数据的结构,包括标量、向量、数组、数据框和列表。在R中,对象(object)是指可以赋值给变量的任何事物,包括常量、数据结构、函数、甚至是图形
Python120
R语言常用函数整理(基础篇)

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R语言常用函数整理本篇是基础篇,即R语言自带的函数。 vector:向量 numeric:数值型向量 logical:逻辑型向量 character;字符型向量 list:列表 data.frame:数据框 c:
Python140
r语言怎么输入多组数据

r语言怎么输入多组数据

r语言输入多组数据步骤如下:1.while(scanf("%数据类型",&amp变量)==scanf读取到数据的个数) { }2.while(scanf("%数据类型",&amp变量)
Python180
R语言如何创建n行相同矩阵

R语言如何创建n行相同矩阵

步骤如下:主要介绍一下利用matrix函数和rep生成矩阵。在R语言中可以使用matrix()函数来创建矩阵,其语法格式如下:matrix(data=NA,nrow=1,ncol=1,byrow=FALSE,dimnames=NULL)。r
Python80
R语言常用函数(基本)

R语言常用函数(基本)

vector:向量 numeric:数值型向量 logical:逻辑型向量 character;字符型向量 list:列表data.frame:数据框 c:连接为向量或列表 sequence:等差序列 rep:重复 length
Python130
R语言操作——TCGA数据处理

R语言操作——TCGA数据处理

获取表达矩阵,处理TCGA的count数据,1表示为行。 导入数据 加 ENTREZID列,用于富集分析(symbol转entrezid,然后inner_join) 转化空格为NA 用花花的专属TCGA包,ID进行转换
Python100
PCA(主成分分析)python实现

PCA(主成分分析)python实现

回顾了下PCA的步骤,并用python实现。深刻的发现当年学的特征值、特征向量好强大。 PCA是一种无监督的学习方式,是一种很常用的降维方法。在数据信息损失最小的情况下,将数据的特征数量由n,通过映射到另一个空间的方式,变为k(k&a
Python100
矩阵指数函数与常微分方程组求解

矩阵指数函数与常微分方程组求解

矩阵指数函数(matrix exponential)可用来求解常微分方程组。对于方形矩阵A,其矩阵指数函数定义为: 对矩阵A进行相似变换,结合与可得:矩阵指数函数有以下性质: 如果两个方阵A, B满足
Python140
R语言solve,default错误必须是正方形是什么意思

R语言solve,default错误必须是正方形是什么意思

可能是数据量不够,或者方程的构建有问题。解普通方程组可以用函数solve(),solve()的基本用法是solve(A,b),其中,A为方程组的系数矩阵,b为方程组的右端。例如:已知方程组 :2x1+2x3=1;2x1+x2+2x3=2;2
Python140
R语言常用函数整理(基础篇)

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R语言常用函数整理本篇是基础篇,即R语言自带的函数。 vector:向量 numeric:数值型向量 logical:逻辑型向量 character;字符型向量 list:列表 data.frame:数据框 c:
Python120
R语言中有哪些取整运算?

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R语言中取整运算主要包括以下五种:floor():向下取整;ceiling(): 向上取整;round(): 四舍五入取整;turnc(): 向0取整;signif(): 保留给定位数的精度。floor返回对应数字的'地板
Python150
python输入矩阵

python输入矩阵

python常见数组元素操作将数组元素由str转换成int 将数组外的引号去除 Python输入矩阵的方法: 例使用numpy创建矩阵有2种方法,一种是使用numpy库的matrix直接创建,另一种则是使用array来创
Python150
R语言常用函数整理(基础篇)

R语言常用函数整理(基础篇)

R语言常用函数整理本篇是基础篇,即R语言自带的函数。 vector:向量 numeric:数值型向量 logical:逻辑型向量 character;字符型向量 list:列表 data.frame:数据框 c:
Python140
求C语言源代码二分法求解非线性方程组的根(VC++6.0)

求C语言源代码二分法求解非线性方程组的根(VC++6.0)

如果连续函数在给定区间不单调,很有可能中值*下界值和中值*上界值都大于0,那么会跳出认为没有根,而事实上很有可能这个中值点靠近函数极点。而真正用二分法求给定区间的思路是:首先为函数求导,算出导函数的零点,然后再判断零点性质,最后将函数区间分
Python220