转录组分析1——原始数据以及过滤

Python016

转录组分析1——原始数据以及过滤,第1张

RNA-Seq主要有三个步骤,分别是第一:建库;第二,测序;第三,数据分析

1、先登录界面找到这个数据集所在位置:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov//geo/query/acc.cgi?acc=GSE52778

2、点击SRA Run selector

究计划的总体描述;项目通常涉及多个样本和数据集。

• NCBI BioSample:SAMN ****和/或SRS ****(例如:

SAMN02422669)描述生物来源材料;每个物理上独特的标本应注

册为具有一组独特属性的单个BioSample。

• SRA实验:SRX ****是特定样品的独特测序文库(SRX384345)

• SRA Run:SRR ****或ERR ****(例如:SRR1039508)是链接到给

定测序库(实验)的数据文件的清单。