如何做基线表

Python027

如何做基线表,第1张

如何做基线

rm(list =ls())

setwd("C:\\Users\\17657\\Desktop\\ska3")

options(repos='http://cran.rstudio.com/')

library(xlsx)

baseline<- read.xlsx('临床信息.xlsx',sheetIndex = 1,header = T,encoding = 'UTF-8')

baseline<-baseline[1:1096,]

base<-subset(baseline,select = c(age,T,M,N,stage,ER,PR,HER2,subtype))

Freq<-lapply(base[,1:9],table)

prop<-lapply(Freq[1:9],prop.table)

prop

character<-c(names(Freq[1]),names(Freq[[1]]))

Noc<-c(NA,paste0(Freq[[1]],'(',prop[[1]],')'))   

char<-NULL

characteristics<-data.frame('characteristics'=character,' number of class'=Noc)

for (i in 1:9) {character<-c(names(Freq[i]),names(Freq[[i]]))

Noc<-c(NA,paste0(Freq[[i]],'(',prop[[i]]*100,')'))           

characteristics<-data.frame('characteristics'=character,' number of class(%)'=Noc)

char<-rbind(char,characteristics)

}

write.xlsx(char,'基线表.xlsx',col.names=T,row.names=F,showNA=F)

好啦可以啦~

q1, 首先要确定是barplot还是hist,如果是barplot的话,应该不存在breaks的问题,因为barplot的传入参数是个矩阵;

我假设你要画的是个hist,我偶遇过这个问题,我的理解是hist的breaks的值要能被范围整除才行;比如x=1:200,break=7的话,就只能画出4个柱来,但如果breaks=10就没问题;基本上是这样的,偶尔也有例外;比如break=5就不行....奇怪得很

最后,没办法的办法,就只能用barplot代替hist了,barplot肯定不会有这个问题,统计下hist参数中的分布情况,转换成矩阵,用barplot吧;

q2, 貌似一般都用一组因素把这些类别区分开,我用abcde,表示你的小学,中学...了,比如这样:

a=1:7b=8:10c=c(9,10,11)d=c(40,55)e=100:110f=factor(c(rep(1,sum(length(a),length(b),length(c))),rep(2,sum(length(d),length(e)))))#先用c()生成数组,在转换成factor,其实数组也ok的,不过plot()中两个数组和factor不一样 x=c(a,b,c,d,e)plot(x~f)q3, 就我所知不行;yes或no一定也要是能映射到x,y范围内的点才行;你是想表示分类结果吗?如果是的话,通常用颜色,或者在点旁边的text表示。

q4, 举个例子吧

x=-50:50y=x^2+x+1z=10*abs(x)+1 plot(x,y,type='l')lines(x,z,lty=3)legend(c('type1','type2'), x=-20,y=2500, col=c('black','red'), lty=c(1,3))legend的x和y是legend的左上角,匿名参数是类型名称,col,lty,pch 是对应的颜色,线类型,和点类型。

最后,我现在多用ggplot2,如果不抵触的话可以看看,和R的基础作图包思路不是很一样,但是图很清新的;

如果还有问题,建议把数据集data.frame粘贴几行上来,我也试试;

你先写一个函数,然后在R的界面加载

新建一个脚本:

fun<-function(x){

if(x>=0 &x<=3) y=3*x+2

else y=2*x-0.5*x^2

y

}

保存为fun.R

然后在R界面里

>source("fun.R")

>x<-seq(0,6,0.01) 每隔0.01取一个点

>y<-fun(x)

>plot(x,y)