R语言自学笔记-3设置路径、R包操作

Python065

R语言自学笔记-3设置路径、R包操作,第1张

#设置默认路径

#显示当前工作目录(软件默认使用工作目录)

getwd()

#修改默认工作目录

setwd(dir = "e:/Rwork/")

#提示工作目录

getwd()

#查看目录下包含的文件

list.files()

#或者

dir()

#R包安装

install.packages("vcd")

#显示库所在的位置

.libPaths()

#显示库里有哪些安装包

library()

#载入包

library(vcd)

#or

require(vcd)

#直接输入函数看某些函数来自于R的哪个包

#如何使用R包

help(package="vcd")

help(package="ggplot2")

#查看包的信息,列出R包的基础内容,显示内置的数据集的内容,给包中的函数作为案例来使用

library(help="vcd")

#还有一些包中的函数,是包的核心内容,扩展了R的功能

Arthritis

#列出包中所有包含的函数

ls("package:vcd")

#每个函数如何使用查看对应帮助文档

#列出R包中包含的所有数据集

data(package="vcd")

#使用完一个包之后,将包从内存中移除

detach("package:vcd")

#再使用

Arthritis

#会出现报错:需要重新再加载

#删除已安装的包

remove.packages("vcd")

#会将R包从硬盘上彻底删除,无法继续使用了,用得不多

#R包的批量移植(更换新设备)

#列出当前环境中已安装的R包

installed.packages()

#取第一列,,,使用下标来访问数据框的第一列

installed.packages()[,1]

#将所以R包名字保存到一个文件中

Rpack<- installed.packages()[,1]

save(Rpack,file = "Rpack.Rwork")

#将这个文件移到另一个设备上

#在另一个设备上使用load函数打开这个文件

#存到另外一个变量Rpack中

#看到这些R包

#Rpack

#批量安装这些R包

#使用一个for循环

for(i in Rpack)install.packages(i)

#如何获取R的帮助信息

help.start()

#查看某个函数的功能

help(sum)

#or

?plot

?sum

#快速了解函数参数而不想查阅详细文档

args(plot)

#查看函数使用案例

example(mean)

example("hist")

#列出R的一些案例图

demo(graphics)

#查看R安装的某个包的帮助文档

help(package=ggplot2)

#有些R包包含vignette文档,这中文档包含更多内容,也更加规范,里面有简介、教程、开发文档等

vignette()

#不是每个包都包含这种格式的文档

vignette("xts")

#有时安装了某包但使用help命令搜索不到相关函数,是因为没有载入这个包

#需用使用library函数载入这个包

#载入之后才能使用help函数找到相关文档

#或者直接在help命令中加上package选项  等于  要搜索R包的名字,这种方法比较麻烦

#??接要搜索函数名字,这种情况下不加载包也可以

#有些情况下,不知道具体的函数名,只能模糊搜索

#查找与绘制热图相关的帮助信息(使用这条命令进行本地搜索)

help.search(heatmap)

#提示搜索不到

#因为需要加上引号

help.search("heatmap")

#搜到stats包中的heatmap函数,可以用来绘制热图

#help.search("heatmap")也可以简写成下面一条命令

??heatmap#不需要加引号

#列出所有包含关键字的内容

apropos("sum")

#可以通过mod参数调整查询的内容

apropos("sum",mod="function")#只列出函数

#help.search或??都是进行本地的文档搜索

#有时搜索不到或者文档太老了可以使用RSiteSearch()函数进行网络搜索

RSiteSearch(matlab)

#运行函数会使用默认浏览器来访问R官网,在官网中进行搜索,列出更多的结果

#可以利用搜索引擎进行问题搜索

R语⾔查看已加载包、卸除加载包及安装包与卸载包1、查看已加载的包

(.packages())

注意外⾯的括号和前⾯的点不能省。

包被安装后,在使⽤前需要加载。加载包使⽤命令 library(包名),⽐如library(codetools)。

查看有哪些包是被加载的,使⽤命令(.packages()) ,注意⼩括号和点号不能省略。

>(.packages())

[1] "stats" "graphics" "grDevices" "utils" "datasets" "methods" "base"

2、卸除已加载的包

如卸除RMySQL包

detach(“package:RMySQL”)

注意是卸除,不是卸载,也就是说不是把包从R运⾏环境中彻底删除,只是不希望该包被加载使⽤。

在包使⽤函数冲突,检验函数依赖时⽐较有⽤。

要将已经加载的包卸除。注意不是卸载删除,只是不加载这个包。在包函数冲突时需要。使⽤命令detach("package:包名")。或则detach("package:包名", unload=TRUE)

3、安装包

install.packages(“rjson”)

下载安装名为“rjson”的包。

要安装包,可以使⽤命令install.packages("包名"),或者

install.packages("包名", contriburl="http://url", dependencies = TRUE)

如果安装的时候要指定安装⽬录,可以使⽤install.packages("stepNorm", contriburl="http://url", lib="mydir")

4、卸载已加载的包

彻底删除已安装的包:

remove. packages(c(“pkg1”,”pkg2”) , lib = file .path(“path”, “to”, “library”))

注:

“pkg1”,”pkg2”表⽰包名,即⼀次可以卸载多个包;

“path”, “to”, “library”表⽰R的库路径,字符向量,通常情况下只输⼀个路径即可。使⽤命令.libPaths()可以查看库路径。⽰例:remove.packages(c(‘zoom’),lib=file.path(‘C:\\Program Files\\R\\R-3.2.2\\library’))

5、查看已安装的包

installed.packages()

library()

使⽤ library() 可以查看已经安装的包的列表,会打开⼀个新窗⼝显⽰信息。

使⽤ installed.packages() 可以看到各个包安装的路径,版本号等信息。

也可以使⽤ .packages(all.available=T) 就在控制台中显⽰已安装包的名字,只显⽰包的名字。

要查看已安装包的帮助信息,⽐如该包中有哪些函数,可使⽤ help(package="graphics") 。如果该包提供了信息,会以本地⽹页的形式打开帮助⽂件。

6、查看某个包提供的函数

help(package=’TSA’)

package参数为要查看的包的包名。

7、查看某个函数属于哪个包

help(函数名)

在打开的⽹页中查看属于哪个包。

8、升级包

update.packages()

5.9

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R语言查看已加载包、卸除加载包及安装包与卸载包

R语⾔查看已加载包、卸除加载包及安装包与卸载包1、查看已加载的包

(.packages())

注意外⾯的括号和前⾯的点不能省。

包被安装后,在使⽤前需要加载。加载包使⽤命令 library(包名),⽐如library(codetools)。

查看有哪些包是被加载的,使⽤命令(.packages()) ,注意⼩括号和点号不能省略。

>(.packages())

[1] "stats" "graphics" "grDevices" "utils" "datasets" "methods" "base"

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2、卸除已加载的包

如卸除RMySQL包

detach(“package:RMySQL”)

注意是卸除,不是卸载,也就是说不是把包从R运⾏环境中彻底删除,只是不希望该包被加载使⽤。

在包使⽤函数冲突,检验函数依赖时⽐较有⽤。

要将已经加载的包卸除。注意不是卸载删除,只是不加载这个包。在包函数冲突时需要。使⽤命令detach("package:包名")。或则detach("package:包名", unload=TRUE)

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3、安装包

install.packages(“rjson”)

下载安装名为“rjson”的包。

要安装包,可以使⽤命令install.packages("包名"),或者

install.packages("包名", contriburl="http://url", dependencies = TRUE)

如果安装的时候要指定安装⽬录,可以使⽤install.packages("stepNorm", contriburl="http://url", lib="mydir")

4、卸载已加载的包

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彻底删除已安装的包:

remove. packages(c(“pkg1”,”pkg2”) , lib = file .path(“path”, “to”, “library”))

注:

“pkg1”,”pkg2”表⽰包名,即⼀次可以卸载多个包;

“path”, “to”, “library”表⽰R的库路径,字符向量,通常情况下只输⼀个路径即可。使⽤命令.libPaths()可以查看库路径。⽰例:remove.packages(c(‘zoom’),lib=file.path(‘C:\\Program Files\\R\\R-3.2.2\\library’))