data1<-read.table('clipboard',header=T) （其中，将EXCEL表格中的数据先复制，然后进行导入，即可），
第二步：将数据框转化为矩阵（A）
A<-as.matrix(data1)
第三步：将数据框的第一行的标题去掉
colnames(A)<-NULL
第四步：求矩阵A的转置阵，设转置阵为A1
A1<-t(A)
第五部：计算矩阵A与其转置阵A1相乘
H1<-A%*%A1
1、以读入txt格式的数据为例子，第一步打开R软件包，读入数据，如下图所示：
2、使用转换矩阵命令as.matrix()，使读入的数据变成矩阵格式，如下图所示：
3、验证是否转换成功，命令is.matrix()返回TRUE表示转换成功，如下图所示：
R语言数据结构主要有以下四种：
四种数据结构，重点掌握 向量 和 数据框
判断数据结构的函数： class()
向量的详细讲解在上一篇文章，以下主要讲数据框，矩阵，列表：
以下大部分操作使用的数据框为df
几个重要的函数：查看数据框的行数和列数，行名和列名；以及单独查行的数量，列的数量
数据框取子集有几种方法 ： $ 符号，坐标，名字，逻辑值
在 [,] 里，行在前面（左边），列在后面（右边），行与列用逗号 , 隔开： [行,列]
中括号里的逗号，表示维度的分割
数据框按照逻辑值取子集，TRUE对应的行/列留下，FALSE对应的行/列去掉。
修改第二列的列名，就是修改列名这个向量的第二个元素
https://blog.csdn.net/weixin_39718006/article/details/110516670
后续的笔记会有详细介绍
矩阵不能用 $ 符号取子集
t()：转置函数，行与列的互换
as.data.frame()：转换，把矩阵变为数据框 ，用as.matrix()函数也能把数据框变为矩阵
聚类，相似的行，相似的列会聚在一起。热图自动聚类，行和列的相对位置发生了变化，只是列与列，行与行之间的变化规律。
![热图自动聚类]]( https://upload-images.jianshu.io/upload_images/17511166-f6e2432a04cffbbe.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240 )
热图默认聚类，修改参数，不让聚类，热图与表达矩阵对应。
默认的设置不符合自己的预期，可以子啊作者允许的范围内定义。
查看函数帮助文档，参考修改，达到自己的要求。
列表没有列名和行名，只有元素的名字。列表可以由数据框，矩阵，向量，单独的一个数字都可以组成。
列表没有行和列的概念，只有元素，取子集的两种方式： [[]] ， $ ，
$ 有两个作用：数据框取子集和列表取子集。在矩阵和向量里不能用 $ 。
用 class() 函数更能具体说明问题， 判断数据结构和数据类型
以上内容是听 生信技能树 小洁老师的 R语言线上课 ，根据自己的理解记录下来，小洁老师授课非常细心，对不同水平的同学都照顾到，并且补充很多技巧以及注意事项。
认识R语言的四种数据结构，小洁老师强调重点掌握向量和数据框，在实战中遇到很多数据结构都是数据框，表达矩阵可以转化为数据框，数据框的一列可以看做是一个向量。小洁老师把实战中会需要的操作融入到练习题，在实战中能联想起小洁老师讲过的知识点。
