第一步：安装rJava和jdk
install.packages("rJava")
配置好java
第二步：设置环境变量 ，涉及java调用R（我的电脑右键-属性-高级设置-环境变量）
CLASSPATH=D:\soft\R-3.0.1\library\rJava\jri
PATH=D:\soft\R-3.0.1\bin\x64
R_HOME=D:\soft\R-3.0.1
第三步：D:\soft\R-3.0.1\library\\rJava\jri的3个类包, 复制黏贴，
放到C:\Program Files\Java\jdk1.7.0_05\lib下面
JRIEngine.jar
JRI.jar
REngine.jar
即可实现 library(rJava)
需要的，这是配置环境步骤，1.检查操作系统和R版本检查自己电脑是64位还是32位的（在控制面板里→系统），然后查看R的版本与操作系统是否一致，位置在RStudio里的Tools→Global Options2.下载并安装JAVA， 方法是百度关键词JDK + 64（or32），保证JAVA版本与R软件版本一致安装路径与R的安装路径一致，比如都放在C:\Program Files\JAVA下，安装过程中会有2处提示可更改安装路径，这其实是2次安装，一次是JDK一次是JRE，一般按照默认路径安装就行；需要注意的是，如果你是64位系统但下载安装的是32位JAVA，那么会默认安装到C:\Program Files (x86)\JAVA，x86代表是32位安装路径；安装完毕会有2个文件夹1、下载wgethttp://mirror.bjtu.edu.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz2、解压：tar-zxvfR-3.0.1.tar.gzcdR-3.0.13、安装(当然也可以跳过)yuminstallreadline-develyuminstalllibXt-devel./configure4、配置环境并编译安装#如果使用rJava需要加上--enable-R-shlib(这个我不需要，所以加入到后面)#如果3没安装,那么后面加上：--with-readline=no--with-x=no./configure--prefix=/usr/R-3.0.1make$$makeinstall5、配置环境变量并生效vi.bash_profileexportR_HOME=/usr/R-3.0.1exportPATH=.:$R_HOME/bin:$PATH#试环境变量生效source.bash_profile6、命令行测试[admin@JDsoftware]$RWARNING:ignoringenvironmentvalueofR_HOMERversion3.0.1(2013-05-16)--"GoodSport"Copyright(C)2013TheRFoundationforStatisticalComputingPlatform:x86_64-unknown-linux-gnu(64-bit)R是自由软件，不带任何担保。在某些条件下你可以将其自由散布。用'license()'或'licence()'来看散布的详细条件。R是个合作计划，有许多人为之做出了贡献.用'contributors()'来看合作者的详细情况用'citation()'会告诉你如何在出版物中正确地引用R或R程序包。用'demo()'来看一些示范程序，用'help()'来阅读在线帮助文件，或用'help.start()'通过HTML浏览器来看帮助文件。用'q()'退出R.>q()7、创建脚本测试(t.R)cd/opt/script/Rvimt.R#!/path/to/Rscript#第一行x<-c(1,2,3)#R语言代码y<-c(102,299,301)model<-lm(y~x)summary(model)8、测试：执行脚本RCMDBATCH--args/opt/script/R/t.Rmore/opt/script/R/t.Rout#查看执行的结果或者第二种方式Rscript/opt/script/R/test.R#结果直接输出到终端
