有谁懂怎么用Python读取nc文件里的数据吗

Python015

有谁懂怎么用Python读取nc文件里的数据吗,第1张

试试这个咯:

nc='/home/willie/Desktop/nc.nc'

with open(nc,'rb') as f:

s=f.read()

前几文主要讲的是如何处理Xarray中的DataArray和DataSet,现在分享一下如何从nc文件或其他文件中读取数据,以及如何将处理好的数据输出成一个nc文件。

首先还是要再强调DataArray和DataSet的区别,DataArray是一个带标签结构的数组,DataSet是一个数据集,这意味着,从一个nc文件中读取到的全部信息构成了一个DataSet,而nc文件中的某一个变量是一个DataArray。

反之,我们要将一个数据写成nc文件,那么就是要创建一个DataSet。

这个数据结构有点像站点数据,对xy维设定了两层,分别是经纬度,还有一维时间维(whatever,反正是随便创建一个DataSet)。

就可以输出成nc文件了。

当然还可以更懒一点,

直接将abc这个DataArray转成DataSet,DataArray的标签和纬度信息会自动转换。

之后使用to_netcdf即可。

读取的语句也十分简单。

函数只需要基本的路径及文件名,无需像NCL一样声明状态'r'。

Xarray读取多文件也提供了相应函数(我目前没有使用过,我通常都是使用CDO提前处理,大家可以自行尝试)。

根据官方的介绍,Xarray也支持grib文件的读取。

前提是需要一个解码库"eccodes"

或者利用Xarray借助PYNIO去读。

官方文档中还有一部分是关于画图的,然而画图部分个人认为使用matplotlib+cartopy的组合更加灵活,因此Xarray系列到这里应该就完结了。

下一步的计划是按照魏凤英老师的统计方法一书,试着将常用的气象统计方法利用python去实现,但是水平实在有限。

python很多库支持了对nc格式文件的读取,比如NetCDF4,PyNio(PyNio和PyNgl可以看做是NCL的Python版本)以及Xarray等等。

我最初使用PyNio,但是由于NCL到Python的移植并不完全,导致目前远不如直接使用NCL方便,而在接触Xarray库后,发现其功能强大远超NCL(也可能是我NCL太菜的原因)。

安装同其它库一致:

我这里以一套中国逐日最高温度格点资料(CN05.1)为例,其水平精度为0.5°X0.5°。

可以看到,文件的坐标有时间, 经度,纬度,变量有日最高温

我们将最高温数据取出

这与Linux系统中的ncl_filedump指令看到的信息是类似的

Xarray在读取坐标信息时,自动将时间坐标读取为了datetime64 格式,这对我们挑选目的时间十分方便。Xarray通常与pandas配合使用。

比如我们想选取1979.06.01-1979.06.20时期数据,我们只需

再比如我们想选取夏季数据时,只需

更多的时间操作同python的datetime函数类似。

当我们想选取特定经纬度范围(高度)的数据时,.loc[]函数同样可以解决。

在这里,我选取了40°N-55°N,115°E-135°E范围的数据

甚至,我们还可以套娃,同时叠加时间和范围的选取

这足够满足常用到的数据索引要求。

对于这类简单排列的.txt文件,可以通过np.load读取,用pandas的.read_csv更为方便

读取txt的同时,对每列赋予了一个列名,通过data.a可以直接按列名调用相应数据。

对于较复杂的.txt文件,仍可通过该函数读取

skiprows=5跳过了前5行的文件头,sep='\s+'定义了数据间隔为空格,这里用的是正则表达。

pd.read_csv函数有很多的参数,可以处理各种复杂情况下的文本文件读取。

grib文件可通过pygrib库读取

import pygrib

f = pygrib.open('xxx.grb')