网站挂马是每个网站最头痛的问题，解决办法：1.在程序中很容易找到挂马的代码，直接删除，或则将你没有传服务器的源程序覆盖一次但反反复复被挂就得深入解决掉此问题了。但这不是最好的解决办法。最好的方法还是找专业做安全的来帮你解决掉
听朋友说 SineSafe 不错 你可以去看看。
清马+修补漏洞=彻底解决
所谓的挂马，就是黑客通过各种手段，包括SQL注入，网站敏感文件扫描，服务器漏洞，网站程序0day, 等各种方法获得网站管理员账号，然后登陆网站后台，通过数据库 备份/恢复 或者上传漏洞获得一个webshell。利用获得的webshell修改网站页面的内容，向页面中加入恶意转向代码。也可以直接通过弱口令获得服务器或者网站FTP，然后直接对网站页面直接进行修改。当你访问被加入恶意代码的页面时，你就会自动的访问被转向的地址或者下载木马病毒
清马
1、找挂马的标签，比如有<script language="javascript" src="网马地址"></script>或<iframe width=420 height=330 frameborder=0
scrolling=auto src=网马地址></iframe>，或者是你用360或病杀毒软件拦截了网马网址。SQL数据库被挂马，一般是JS挂马。
2、找到了恶意代码后，接下来就是清马，如果是网页被挂马，可以用手动清，也可以用批量清，网页清马比较简单，这里就不详细讲，现在着重讲一下SQL数据库清马，用这一句语句“update 表名 set 字段名=replace(字段名,'aaa','')”， 解释一下这一句子的意思：把字段名里的内容包含aaa的替换成空，这样子就可以一个表一个表的批量删除网马。
在你的网站程序或数据库没有备份情况下，可以实行以上两步骤进行清马，如果你的网站程序有备份的话，直接覆盖原来的文件即可。
修补漏洞（修补网站漏洞也就是做一下网站安全。）
1、修改网站后台的用户名和密码及后台的默认路径。
2、更改数据库名,如果是ACCESS数据库，那文件的扩展名最好不要用mdb，改成ASP的，文件名也可以多几个特殊符号。
3、接着检查一下网站有没有注入漏洞或跨站漏洞，如果有的话就相当打上防注入或防跨站补丁。
4、检查一下网站的上传文件，常见了有欺骗上传漏洞，就对相应的代码进行过滤。
5、尽可能不要暴露网站的后台地址，以免被社会工程学猜解出管理用户和密码。
6、写入一些防挂马代码，让框架代码等挂马无效。
7、禁用FSO权限也是一种比较绝的方法。
8、修改网站部分文件夹的读写权限。
9、如果你是自己的单独服务器，那就不仅要对你的网站程序做一下安全了，而且要对你的服务器做一下安全也是很有必要了！
常见的问题：第一、SQL注入漏洞，这个是最为常见的，也是危害最大的，作为电子商务网站，在线购买等行为涉及到金额，所以数据库安全是非常重要的。
第二、上传漏洞，如果用户可以上传图片和文件就需要注意加以区分木马和一般文件。
第三、尽量使用Session而不是cookie，防止cookie伪造。
第四、对js,CSS中的可执行代码进行过滤，防止使用xss注入。
第五、防止搜索引擎中发现你的漏洞。合理使用robots.txt文件，因为搜索引擎很容易找到你一些隐私的东西，黑客可以利用gg进行入侵。
第六、防止暴力破解，加大验证码的难度。
第七、防止跨站注入。
第八、服务器安全，这个比较通用，你可以查查。
加载页面的时候，会先获得当下产生的一个rand：<%String rand =(String)session.getAttribute("rand")%>
，这个值由服务端传给了photovalue="<%=rand %>" 这个文本框；但是，页面在客户端加载后，便再次去读取src="<%=request.getContextPath() %>/admin/PhotoVerify.jsp"的PhotoVerify.jsp页面，此时，PhotoVerify.jsp会重新产生一个rand，这个 rand 和之前传给客户端的不是同一个rand了，所以，验证码会报错。也就是获取页面时PhotoVerify.jsp产生了一个rand并传给了客户端，但页面加载完后加载图片时，图片src加载PhotoVerify.jsp又产生了一次rand，两次产生的rand，自然不一致了。可以通过AJAX的方式获得PhotoVerify.jsp最后产生的rand。一般来说，在客户端验证验证码，相当于没有设置验证码，不建议这么做，因为验证码就是为了防止穷举、暴力破解、程序自动注册等非法行为，而你把验证码直接放在了客户端，你这个验证码形同虚设。
