R语言入门--第十四节(聚类分析)

R语言入门--第十四节(聚类分析)

(1)定义每一个观测值为一类; (2)计算每一类和其它各类的距离; (3)把“距离”最短的两类合并成一类,这样类的个数就减少一个; (4)重复步骤1和步骤2,直到包含所有观测值的类合并成单个类为止。 基于5种营养标准含量(变
Python160
R语言学习笔记之聚类分析

R语言学习笔记之聚类分析

R语言学习笔记之聚类分析使用k-means聚类所需的包:factoextracluster #加载包library(factoextra)library(cluster)l#数据准备使用内置的R数据集USArrests#load t
Python170
R语言学习笔记之聚类分析

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R语言学习笔记之聚类分析使用k-means聚类所需的包:factoextracluster #加载包library(factoextra)library(cluster)l#数据准备使用内置的R数据集USArrests#load t
Python130
R语言-KNN算法

R语言-KNN算法

1、K最近邻(k-NearestNeighbor,KNN)分类算法,是一个理论上比较成熟的方法,也是最简单的机器学习算法之一。该方法的思路是:如果一个样本在特征空间中的k个最相似(即特征空间中最邻近)的样本中的大多数属于某一个类别,则该样本
Python120
R语言进行PCoA分析

R语言进行PCoA分析

#PCoA 分析在R语言中进行主要依赖于以下得包,进行这个分析得主要可以应用于形态学数据得相似与差异性分析。library(ade4)library(ggplot2)library(RColorBrewer)library(vegan)这里
Python150
建议收藏!10 种 Python 聚类算法完整操作示例

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聚类分析是一类将数据所对应的研究对象进行分类的统计方法。这一类方法的共同特点是,事先不知道类别的个数与结构;进行分析的数据是表明对象之间的相似性或相异性的数据,将这些数据看成对对象“距离”远近的一种度量,将距离近的对象归入一类,不同类对象之
Python170
R语言学习笔记之聚类分析

R语言学习笔记之聚类分析

R语言学习笔记之聚类分析使用k-means聚类所需的包:factoextracluster #加载包library(factoextra)library(cluster)l#数据准备使用内置的R数据集USArrests#load t
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R语言入门--第十四节(聚类分析)

R语言入门--第十四节(聚类分析)

(1)定义每一个观测值为一类; (2)计算每一类和其它各类的距离; (3)把“距离”最短的两类合并成一类,这样类的个数就减少一个; (4)重复步骤1和步骤2,直到包含所有观测值的类合并成单个类为止。 基于5种营养标准含量(变
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R语言-KNN算法

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1、K最近邻(k-NearestNeighbor,KNN)分类算法,是一个理论上比较成熟的方法,也是最简单的机器学习算法之一。该方法的思路是:如果一个样本在特征空间中的k个最相似(即特征空间中最邻近)的样本中的大多数属于某一个类别,则该样本
Python120
R语言-KNN算法

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1、K最近邻(k-NearestNeighbor,KNN)分类算法,是一个理论上比较成熟的方法,也是最简单的机器学习算法之一。该方法的思路是:如果一个样本在特征空间中的k个最相似(即特征空间中最邻近)的样本中的大多数属于某一个类别,则该样本
Python190
最小二乘法到底是计算哪个距离最短

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黄老师在《数据分析、展现与R语言》第三课第三个视频14分钟时是说,距离是点做平行于Y轴的直线到拟合直线的距离。然后选离所有点的距离最短的那条直线。魏老师在《DOE技术及应用》第二课第一个视频中又说,距离是点到拟合直线的垂直距离。然后选离所有
Python170
R语言怎么画出固定的经纬度区域图

R语言怎么画出固定的经纬度区域图

R语言怎么画出固定的经纬度区域图:1 如果有经纬度坐标,直接用geoda和arcgis就可以生成图了。2 R处理数据。3 x &lt- readShapePoly('bou2_4p.shp'),这个变量名x换个别
Python170
怎样用R语言计算一组词的jaccard相似度

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R在2.14版本之后,内置了parallel包,整合了之前已经比较成熟的snow包和multicore包,强化了并行计算能力,parallel包的思路是将输入数据分割、计算、整合结果,只不过运算被分配到了不同的cpu来。1、K最近邻(k-N
Python140
R语言哪些包可用来做聚类分析

R语言哪些包可用来做聚类分析

聚类的包,cluster包,里面包含了pam,agnes等函数,可以十分方便进行聚类计算。另外有系统自带的stats包,hclust,kmeans等函数。fpc包做聚类分析,也是可以的。另外,如果需要例子,这些包自带的文档里面都有使用的实例
Python120
R语言学习笔记之聚类分析

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R语言入门--第十四节(聚类分析)

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(1)定义每一个观测值为一类; (2)计算每一类和其它各类的距离; (3)把“距离”最短的两类合并成一类,这样类的个数就减少一个; (4)重复步骤1和步骤2,直到包含所有观测值的类合并成单个类为止。 基于5种营养标准含量(变
Python240
R语言的ggtree展示进化树的一些常用操作

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现在假设你已经拿到了nwk格式的进化树文件,如下 现在进化树的所有信息都存储在了 tree 这个变量里 用到的的 geom_tiplab()可以首先加上 theme_tree2() 函数显示出坐标轴范围,然后用 xlim()
Python200
基于R语言的分类、聚类研究

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1.所有在对iris数据集分(聚)类研究中,setosa均可以完全正确分(聚)类,而另外两类则会出现不同程度的误差,这也是导致整个研究模型出现误差的原因; 2.在使用的三种分类研究方法中,决策树模型的效果最优,因此可以使用该方法进行鸢尾
Python150