方差膨胀因子怎么算插入---函数---统计-----VAR或VARP VAR分母N减了1,估算样本方差。VARP分母N,计算样本总体的方差 由于样本受到 ,一般n不大,一般用估算样本方差。 当大面积的如学生成绩统计,上千万,VAR、VARP都可以,只有数学意2023-02-24Python190
求助BP神经网络在R语言的实现具体如下:library(AMORE)x1 <- round(runif(2000,1,2000)) #随机生成2000个数x2 <- round(runif(2000,1,2000)) x11 <- s2023-02-24Python170
《数量生态学:R语言的应用》第二版阅读笔记2对于我们的物种数据,通常具有相同的刚量,通常是正值和零,对这样的数据几种简单的转化函数,可以降低极大值的影响: 简单转化只是对数值进行独立的处理,而标准化是数值之间的处理。 这些标准化过程是否正常运行?最好利用绘图函数或总结函数密2023-02-24Python180
《R语言实战》自学笔记44-t检验数据准备t检验,亦称student t检验(Student's t test),主要用于样本含量较小(例如n <30),总体标准差σ未知的正态分布。t检验是用t分布理论来推论差异发生的概率,从而比较两个平均2023-02-24Python360
r语言贝叶斯判别先验概率怎么去Bayes判别,它是基于Bayes准则的判别方法,判别指标为定量资料,它的判别规则和最大似然判别、Bayes公式判别相似,都是根据概率大小进行判别,要求各类近似服从多元正态分布。1. Bayes准则:寻求一种判别规则,使得属于第k类的样品在2023-02-24Python170
召回率(R值),准确率(P值)及F值一直总是听说过这几个词,但是很容易记混,在这里记录一下。希望对大家理解有帮助。 首先来做一个总结: 精确率是针对我们预测结果而言的,它表示的是预测为正的样本中有多少是真正的正样本。 召回率是针对我们原来的样本而言的,它表示的是2023-02-24Python180
R语言与统计-1:t检验与秩和检验一般根据数据是否符合正态分布,选择合适的统计方法: T检验,亦称student t检验(Student's t test),主要用于样本含量较小(例如n<30),总体标准差σ未知的正态分布资料。t检验是用t分布理2023-02-24Python120
标准误用r语言怎么算方法如下:设样本量为 n,假定为 30 , R 里面提供了 var 函数来求样本方差var 函数的定义是: 但样本方差的定义是 n <- 30x <- rnorm(30)# 样本标准差为print(var(x2023-02-24Python190
【R语言编程】---利用三代测序绘制菌群聚类热图与物种丰度图前言: 仍然是三代测序数据的分析,宏基因组的文章中经常出现聚类热图和物种丰度图,用来直观地识别与某些疾病或者表型相关的菌群构成。 1.读取数据 一共有11个样本,每一个样本的测序reads都经过Nanopore官方的Epi2Me2023-02-24Python290
R语言绘制配对样品箱线图配对箱线图,常见于配对样本的数据分析中。 例如下图示例,为了研究某些基因在肿瘤组织和正常组织中是否具有表达量的显著不同,在取样时,往往会在同一患者个体中同时获取肿瘤和临近正常组织,两个组织样本就是配对关系。当然在这类研究中,往往需要调查2023-02-24Python270
R语言 求秩和检验x=rep(1:4, c(4,10,15,1))y=rep(3:7, c(2,9,2,4,2))wilcox.test(x,y,exact=FALSE)p-value=10e-8<.05拒绝原假设可认为两组总胆红素存在差异;T检2023-02-24Python350
GO富集分析GO富集是组学数据分析常用的手段,通常用来挖掘差异基因中GO term的富集程度。Fisher's exact test是常用的统计检验方法,但这种方法存在明显的缺点。很多公司提供的测序分析结果都普遍使用这样的方法,导致很多后续的2023-02-24Python200
r语言怎么计算回归模型的置信区间用predict就能做到。predict的用法:predict(object, newdata, se.fit = FALSE, scale = NULL, df = Inf,interval = c("none", &2023-02-24Python170
R语言绘制配对样品箱线图配对箱线图,常见于配对样本的数据分析中。 例如下图示例,为了研究某些基因在肿瘤组织和正常组织中是否具有表达量的显著不同,在取样时,往往会在同一患者个体中同时获取肿瘤和临近正常组织,两个组织样本就是配对关系。当然在这类研究中,往往需要调查2023-02-24Python160
R语言:有关差异分析的检验方法1 读取,计算均值,箱图观察 2 查看数据分布 2.1 hist直方图 2.2 qqnorm散点图 3 Shapiro-Wilk正态性检验 4 方差齐性检验意义:方差分析就是在大家误差水平2023-02-24Python160
如何通过一致性聚类实现对表达谱数据的亚型分类通过ConsensusClusterPlus包对基因表达谱执行一致性聚类(Consensus Clustering)在大样本的组学分析中,经常需要讨论样本的分子分型。文章中最常见的方法,就是使用一种叫一致性2023-02-24Python230
r语言中t检验如何单独取t值独立双样本t检验,首先假设我们的两组数据完全由独立抽样得来;t.test函数可以直接用于检验像sleep这样的长数据,列group则为样本的分组依据。配对样本t检验,数据集为包含分组变量的数据框,那么程序将默认group=1的数据行中的第2023-02-24Python190
数据分析师—技术面试数据分析师—技术面试三月份开始找实习,到现在已经有半年的时间了,在这半年的时间中,该经历的基本上都已经经历,春招实习时候,拿到了7个offer,校招时候,成功的拿下一份心仪的工作,结束了我的秋招旅程。对于面试,技术层面即算法、软件等等,业务2023-02-24Python190
R语言中curve(dunif(x,0,1)),dunif(x,o,1)是什么意思呢curve()接受的第一个参数可以是一个关于x(一维变量)的函数,可以直接写成f(x)(f是定义好的函数)。dunif()是均一分布的密度函数,第一个参数是要求密度的点,第二、三的参数给出均一分布的最小最大值。所以合起来就是要画出U(0,12023-02-24Python110
R语言-17决策树是一个预测模型,分为回归决策树和分类决策树,根据已知样本训练出一个树模型,从而根据该模型对新样本因变量进行预测,得到预测值或预测的分类 从根节点到叶节点的一条路径就对应着一条规则.整棵决策树就对应着一组表达式规则。叶节点就代表该规则下2023-02-24Python170