R语言计算方差

R语言计算方差

nrow(leadership)是leadership这个数据集的行数(可能就是样本数),1:nrow(leadership) 是一个向量,从1到nrow(leadership),sample(1:nrow(leadership)) 是将里
Python1780
案例演示 | R语言绘制热图代码

案例演示 | R语言绘制热图代码

本文是个人笔记,请谨慎付费[星球用户可免费看]。 我们在分析了差异表达数据之后,经常要进行热图的可视化展示。热图(Heat map) 是一个以 颜色 变化来显示数据的 矩阵 。虽然“热图”是一个新兴的词汇,但是用明暗的矩阵来标
Python230
R语言可视化通路富集网络图

R语言可视化通路富集网络图

我们输入的数据包含 gene ID 和 vector(单样本)部分,这里的 gene ID 是一个通用概念,可以是基因、转录本、酶或蛋白质。这里的 vector 可以是样本的表达量、倍数变化, p-value, 组蛋白修饰数据等可测量的属
Python280
如何在R语言中使用Logistic回归模型

如何在R语言中使用Logistic回归模型

Logistic回归在做风险评估时,一般采用二值逻辑斯蒂回归(Binary Logistic Regression)。以滑坡灾害风险评估为例。1、滑坡发生与否分别用0和1表示(1表示风险发生,0表示风险未发生);2、确定影响滑坡风险的影响因
Python150
R语言操作otu丰度表:分行列计算平均和标准差

R语言操作otu丰度表:分行列计算平均和标准差

公众号的读者留言问答的问题,首先他的数据集如下 1 这个是数据集按行求平均 2 这个是数据集中按行求标准差 3 这个公式的计算方法是先按照行求平均值得到一个向量a,按行求标准差得到一个向量b,最后是按照列来进行abs(x-a)
Python150
如何用r语言求正态分布的标准差

如何用r语言求正态分布的标准差

用r语言求正态分布的标准差:产生100个均值为0标准差为1的正态分布随机数:rnorm(100,mean=0,sd=1)指数分布数dnorm(x,mean=5,sd=1,log=TRUE)。正态分布的标准差正态分布N~(μ,duδ^2),
Python190
R语言箱线图(boxplot)四分位算法

R语言箱线图(boxplot)四分位算法

箱线图(Boxplot)也称箱须图(Box-whisker Plot),是利用数据中的五个统计量:最小值、第一四分位数、中位数、第三四分位数与最大值来描述数据的一种方法。它也可以粗略地看出数据是否具有有对称性,分布的离散程度等信息;特别适用
Python240
《R语言实战》自学笔记44-t检验

《R语言实战》自学笔记44-t检验

数据准备t检验,亦称student t检验(Student's t test),主要用于样本含量较小(例如n &lt30),总体标准差σ未知的正态分布。t检验是用t分布理论来推论差异发生的概率,从而比较两个平均
Python130
R语言-第一次用RStudio 画热图

R语言-第一次用RStudio 画热图

作业 读取文件用得比较多的参数有: “header”,“sep”,“quote”,“na.strings”,“fill”,“strip.white ”,“blank.lines.skip”,“comment.char ”,“”等等。
Python210
python之KS曲线

python之KS曲线

# 自定义绘制ks曲线的函数 def plot_ks(y_test, y_score, positive_flag):     # 对y_test,y_score重新设置索引     y_test.index = np.aran
Python160
r语言中两个等于号是什么意思

r语言中两个等于号是什么意思

r语言中等于号是用作赋值的功能。R语言最开始设计的时候,是采用箭头(&lt-)作为赋值符号的,这是从APL语言继承而来的(箭头表示赋值,等号表示判断)。之后的S语言也沿用了这个用法,再之后R语言为了保持和S语言的兼容性保留了这个箭头
Python220
单侧置信下限

单侧置信下限

单侧置信下限就是单侧置信区间设置在被估参数一侧,左侧或右侧的置信区间。这样求得的置信区间称为单侧置信下限。所以说单侧置信区间是置信区间的一部分置信区间95%置信区间(Confidence Interval,CI):当给出某个估计值的95%置
Python250
R语言分析各班学生成绩

R语言分析各班学生成绩

分析来自5各班的5位中学生的成绩情况,数据必须确保已保存在本地,名称为“scores.txt” scores &lt- read.table("scores.txt",header=TRUE, row.nam
Python650
R语言可视化通路富集网络图

R语言可视化通路富集网络图

我们输入的数据包含 gene ID 和 vector(单样本)部分,这里的 gene ID 是一个通用概念,可以是基因、转录本、酶或蛋白质。这里的 vector 可以是样本的表达量、倍数变化, p-value, 组蛋白修饰数据等可测量的属
Python230
怎么用r语言做t copula

怎么用r语言做t copula

(1)不要认为你认为懂的别人都懂,要把所有的基本情况都得交代清楚,否则,别人无法和你交流。(2) 所提问题要具体,把数据、执行的具体的stata命令、最终的结果等都列出来,便于别人判断。 如: 提问说“我xtgls命令不能回归”,你说这
Python230
网络数据的统计分析-R语言实战

网络数据的统计分析-R语言实战

资料:《Statistical Analysis of Network Data with R》 语言R常见的网络分析包: 网络分析研究大部分是描述性的工作。 网络的可视化 即是一门艺术,也是一门科学。 三元闭包体现了社会
Python120
r语言作meta分析的发表偏倚为什么得到空值

r语言作meta分析的发表偏倚为什么得到空值

排除偏倚之用。小样本所得的离散度较大,因此常处于漏斗图的底部,大样本离散度则较小,因此处于顶部。正常情况下应该是顶小而底大,如果不是这样,则可能存在较大偏倚。该种偏倚多由发表偏倚造成。为识别出评估发表偏倚影响的研究,在Medine(1993
Python140