R语言:十一个统计检验都在这了

R语言:十一个统计检验都在这了

R语言的各种检验 1、W检验(Shapiro–Wilk (夏皮罗–威克尔 ) W统计量检验) 检验数据是否符合正态分布,R函数:shapiro.test(). 结果含义:当p值小于某个显著性水平α(比如0.05)时,则认为
Python130
lefse分析LDA可以设为2.5吗

lefse分析LDA可以设为2.5吗

lefse分析LDA可以设为2.5。当出现超过两类的情况时,可以使用由费舍尔判别派生出的分析方法,它延伸为寻找一个保留了所有类的变化性的子空间。这是由 C.R.Rao 总结出来的。假设,C个类中每一个类都有均值和相同的协方差。在对自变量
Python230
R语言-KNN算法

R语言-KNN算法

1、K最近邻(k-NearestNeighbor,KNN)分类算法,是一个理论上比较成熟的方法,也是最简单的机器学习算法之一。该方法的思路是:如果一个样本在特征空间中的k个最相似(即特征空间中最邻近)的样本中的大多数属于某一个类别,则该样本
Python180
(R语言)fit函数代表什么意思?

(R语言)fit函数代表什么意思?

包装函数,允许在相同的连贯函数结构下适应不同的数据挖掘方法。1、R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。2、R是统计领域广泛使用的诞生于19
Python250
R语言中实现层次聚类模型

R语言中实现层次聚类模型

R语言中实现层次聚类模型大家好!在这篇文章中,我将向你展示如何在R中进行层次聚类。 什么是分层聚类?分层聚类是一种可供选择的方法,它可以自下而上地构建层次结构,并且不需要我们事先指定聚类的数量。该算法的工作原理如下:将每个数据点放入其自己的
Python110
《R语言实战》自学笔记69-重抽样和自助法

《R语言实战》自学笔记69-重抽样和自助法

数据准备 许多实际情况中统计假设(假定观测数据抽样自正态分布或者其他性质较好的理论分布)并不一定满足,比如数据抽样于未知或混合分布、样本量过小、存在离群点、基于理论分布设计合适的统计检验过于复杂且数学上难以处理等情况,这时基于随机化和
Python70
R语言实现bootstrap和jackknife检验方法

R语言实现bootstrap和jackknife检验方法

写在最前面: 首先需要说一下,本文的bootstrap和jackknife都算是蒙特卡罗方法(Monte Carlo method)的一种。应用广泛的的MCMC链(马尔可夫链蒙特卡洛方法Markov chain Monte Carlo
Python120
debian sparkr怎么配置环境变量

debian sparkr怎么配置环境变量

1. SparkR的安装配置1.1. R与Rstudio的安装1.1.1. R的安装我们的工作环境都是在Ubuntu下操作的,所以只介绍Ubuntu下安装R的方法:1)在etcaptsources.list添加源deb h
Python100
r语言var是什么意思

r语言var是什么意思

是指向量自回归模型。VAR是计量经济学中的一个概念,用于多元时间序列相关关系的分析。计算机语言中的var:Pascal:var在Pascal作为程序的保留字,用于定义变量。如:vara:integer,定义变量a,类型为整数varu:arr
Python130
哪个软件可以计算 fleiss kappa

哪个软件可以计算 fleiss kappa

这是十分正常的。P值小于0.001只是表明你的kappa系数明显大于0,也就是你的样本显示出的一致性并不是由于随机造成的。你的kappa系数是0.712,接近1,因此明显大于0是应该的,这是一个自然而然的结果,不要担心。如果此时P值大于0.
Python190
r语言求平均值

r语言求平均值

vec = vector(length =1000)for(i in 1:1000)    vec[i] = UR_FUNC()mean(vec)如下:数据集a有变量:x1,x2,x3等等求各变量的均值方差,代码如下:mean(a$x
Python160
R语言-KNN算法

R语言-KNN算法

1、K最近邻(k-NearestNeighbor,KNN)分类算法,是一个理论上比较成熟的方法,也是最简单的机器学习算法之一。该方法的思路是:如果一个样本在特征空间中的k个最相似(即特征空间中最邻近)的样本中的大多数属于某一个类别,则该样本
Python150
R 常用语句汇总

R 常用语句汇总

## 分组统计   display(df %&gt% filter(RESP_DT == '20191102') %&gt% group_by(colname) %&gt% summarise
Python120
火山图基因差异表达怎么制作'r语言

火山图基因差异表达怎么制作'r语言

今天就先来聊聊如何看差异表达基因数据,火山图,聚类图又怎么看。1差异基因筛选方法那差异基因是如何筛选出来的呢?差异基因的筛选方法有很多,包括倍数法、T检验、F检验及SAM等。下面简单介绍一下GCBI上用的倍数法和SAM法。倍数法适用于没有生
Python120