R语言:十一个统计检验都在这了R语言的各种检验 1、W检验(Shapiro–Wilk (夏皮罗–威克尔 ) W统计量检验) 检验数据是否符合正态分布,R函数:shapiro.test(). 结果含义:当p值小于某个显著性水平α(比如0.05)时,则认为2023-02-26Python130
lefse分析LDA可以设为2.5吗lefse分析LDA可以设为2.5。当出现超过两类的情况时,可以使用由费舍尔判别派生出的分析方法,它延伸为寻找一个保留了所有类的变化性的子空间。这是由 C.R.Rao 总结出来的。假设,C个类中每一个类都有均值和相同的协方差。在对自变量2023-02-26Python230
R语言-KNN算法1、K最近邻(k-NearestNeighbor,KNN)分类算法,是一个理论上比较成熟的方法,也是最简单的机器学习算法之一。该方法的思路是:如果一个样本在特征空间中的k个最相似(即特征空间中最邻近)的样本中的大多数属于某一个类别,则该样本2023-02-26Python180
(R语言)fit函数代表什么意思?包装函数,允许在相同的连贯函数结构下适应不同的数据挖掘方法。1、R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。2、R是统计领域广泛使用的诞生于192023-02-26Python250
R语言中实现层次聚类模型R语言中实现层次聚类模型大家好!在这篇文章中,我将向你展示如何在R中进行层次聚类。 什么是分层聚类?分层聚类是一种可供选择的方法,它可以自下而上地构建层次结构,并且不需要我们事先指定聚类的数量。该算法的工作原理如下:将每个数据点放入其自己的2023-02-26Python110
《R语言实战》自学笔记69-重抽样和自助法数据准备 许多实际情况中统计假设(假定观测数据抽样自正态分布或者其他性质较好的理论分布)并不一定满足,比如数据抽样于未知或混合分布、样本量过小、存在离群点、基于理论分布设计合适的统计检验过于复杂且数学上难以处理等情况,这时基于随机化和2023-02-26Python70
有放回的随机抽样怎么做用R语言怎么实现?—R?即随机抽样.sample(x,size,replace = FALSE,prob = NULL)replace=F,表示不重复抽样replace=T 表示可以重复抽样x=1:5sample(x,6,replace=T) #重复抽样[1] 12023-02-26Python170
R语言实现bootstrap和jackknife检验方法写在最前面: 首先需要说一下,本文的bootstrap和jackknife都算是蒙特卡罗方法(Monte Carlo method)的一种。应用广泛的的MCMC链(马尔可夫链蒙特卡洛方法Markov chain Monte Carlo2023-02-26Python120
debian sparkr怎么配置环境变量1. SparkR的安装配置1.1. R与Rstudio的安装1.1.1. R的安装我们的工作环境都是在Ubuntu下操作的,所以只介绍Ubuntu下安装R的方法:1)在etcaptsources.list添加源deb h2023-02-26Python100
求问R语言怎么用ecdf的结果相当于一个函数,你可以看下:x <- rnorm(1000)y <- ecdf(x)y(x)plot(x,y(x), ylab = "ECDF(x)")ks.test()实现了KS检验,可以检验任2023-02-26Python130
r语言中线性判别分析怎么分两类1)当对象为数据框data.frame时lda(x,grouping,prior = propotions,tol = 1.0e-4,method,CV = FALSE,nu,...)2) 当对象为公式Formula时lda(formula2023-02-26Python200
【R语言编程】---利用三代测序绘制菌群聚类热图与物种丰度图前言: 仍然是三代测序数据的分析,宏基因组的文章中经常出现聚类热图和物种丰度图,用来直观地识别与某些疾病或者表型相关的菌群构成。 1.读取数据 一共有11个样本,每一个样本的测序reads都经过Nanopore官方的Epi2Me2023-02-26Python130
r语言var是什么意思是指向量自回归模型。VAR是计量经济学中的一个概念,用于多元时间序列相关关系的分析。计算机语言中的var:Pascal:var在Pascal作为程序的保留字,用于定义变量。如:vara:integer,定义变量a,类型为整数varu:arr2023-02-26Python130
如何用R语言实现对jpg页面的等比例缩放private void button1_Click(object sender, EventArgs e) { Font newFontnewFont = new Font(this.richTextBox1.SelectionFont,2023-02-26Python100
哪个软件可以计算 fleiss kappa这是十分正常的。P值小于0.001只是表明你的kappa系数明显大于0,也就是你的样本显示出的一致性并不是由于随机造成的。你的kappa系数是0.712,接近1,因此明显大于0是应该的,这是一个自然而然的结果,不要担心。如果此时P值大于0.2023-02-26Python190
r语言求平均值vec = vector(length =1000)for(i in 1:1000) vec[i] = UR_FUNC()mean(vec)如下:数据集a有变量:x1,x2,x3等等求各变量的均值方差,代码如下:mean(a$x2023-02-26Python160
R语言中的garchm各个参数代表什么在当前图形区域的四个边缘之一,显示文本。mtext(text, side = 3, line = 0, outer = FALSE, at = NA,adj = NA, padj = NA, cex = NA, col = NA, font2023-02-26Python140
R语言-KNN算法1、K最近邻(k-NearestNeighbor,KNN)分类算法,是一个理论上比较成熟的方法,也是最简单的机器学习算法之一。该方法的思路是:如果一个样本在特征空间中的k个最相似(即特征空间中最邻近)的样本中的大多数属于某一个类别,则该样本2023-02-26Python150
R 常用语句汇总## 分组统计 display(df %>% filter(RESP_DT == '20191102') %>% group_by(colname) %>% summarise2023-02-26Python120
火山图基因差异表达怎么制作'r语言今天就先来聊聊如何看差异表达基因数据,火山图,聚类图又怎么看。1差异基因筛选方法那差异基因是如何筛选出来的呢?差异基因的筛选方法有很多,包括倍数法、T检验、F检验及SAM等。下面简单介绍一下GCBI上用的倍数法和SAM法。倍数法适用于没有生2023-02-26Python120