基于R语言实现Lasso回归分析

Python09

基于R语言实现Lasso回归分析,第1张

基于R语言实现Lasso回归分析主要步骤:将数据存成csv格式,逗号分隔在R中,读取数据,然后将数据转成矩阵形式加载lars包,先安装调用lars函数确定Cp值最小的步数确定筛选出的变量,并计算回归系数具体代码如下: 需要注意的地方: 1、数据读取的方法,这里用的file.choose( ),这样做的好处是,会弹出窗口让你选择你要加载进来的文件,免去了输入路径的苦恼。 2、数据要转为矩阵形式 3、(la) 可以看到R方,这里为0.66,略低 4、图如何看? summary的结果里,第1步是Cp最小的,在图里,看到第1步与横轴0.0的交界处,只有变量1是非0的。所以筛选出的是nongyangungunPs: R语言只学习了数据输入,及一些简单的处理,图形可视化部分尚未学习,等论文写完了,再把这部分认真学习一下~~在这里立个flag

举个例子:

一般人在身高相等的情况下,血压收缩压Y与体重X1和年龄X2有关,抽取13组成年人数据(如下图),构建Y与X1、X2的线性回归关系。

1.先创建一个数据框blood:

  blood<-data.frame(

     X1=c(76,91.5,85.5,82.5,79,80.5,74.5,79,85,76.5,82,95,92.5),

    X2=c(50,20,20,30,30,50,60,50,40,55,40,40,20),

     Y=c(120,141,124,126,117,125,123,125,132,123,132,155,147)

                                )

2.拟合线性回归:

  lm.sol<-lm(Y~X1+X2,data=blood)

  提取模型计算结果

  summary(lm.sol)

这里说一下含义:

1、在计算结果的第一部分(call)列出了相应的回归模型公式;

2、第二部分(Residuals)列出了残差的最小值点、1/4分位点、3/4分位点、最大值点;

3、第三方部分(Coefficients)Estimate表示回归方程参数的估计,std.Error表示回归参数的标准差,t value 为t值,Pr(>|t|)表示p值

说明一下:***表示极为显著,**表示高度显著,*表示显著,.表示不太显著,没有记号表示不显著

4、第四部分(Residual standard error)表示残差的标准差,(F-statistic)表示F的统计量

通过上面的结果可以看出回归模型:Y=2.13656X1+0.40022X2-62.96336

我们根据得出的回归模型进行预测

例如:预测体重X1=100,年龄X2=40的血压值Y

newdata<-data.frame(X1=100,X2=40)

pre<-predict(lm.sol,newdata,interval="prediction",level=0.95)

pre

从结果可以预测值Y166.7011和预测值Y的区间[157.2417,176,1605]