转置之后的数据结构如下
他发现转置之后多了一行,也就是有了geneid这一行,和他预期的不符合。按照预期,geneid这一行应该是成为列名,而不是作为输出的第一行。那么,为什么会出现这个情况呢?这就需要从 t() 这个函数说起。
使用 ?t ,你会得到关于这个函数的函数说明。在函数的Detials部分中,有这样一段
即,数据框会先用 as.matrix() 转成矩阵格式,然后再引用 t() ,最终你对一个数据框使用 t() 函数时,你会得到一个矩阵,而非原先的data.frame.
举个例子:
因为矩阵要求存放的内容是同一种数据类型,对于输入的数据框而言,一般都会有字符串,数值这些,那么最终都会被转成字符串。
对于最开始的问题而言,因为原先的数据框的第一列是字符串,那么自然而然会把所有的数据都变成字符串,然后把第一列变成第一行。而如果要实现他真正的目的,需要先将第第一行变成行名,然后删掉第一行在转置,也就是
其结果就是先保证原来的数据框里面都是数值数据,而不是让第一列充当行名。
延伸一下,对于超过2维的数组,我们要用到 aperm 函数才能对数据进行转置。当然,超过二维的转置,你甚至都无法直观感受到这是一个什么过程。
第一步:导入数据
data1<-read.table('clipboard',header=T) (其中,将EXCEL表格中的数据先复制,然后进行导入,即可),
第二步:将数据框转化为矩阵(A)
A<-as.matrix(data1)
第三步:将数据框的第一行的标题去掉
colnames(A)<-NULL
第四步:求矩阵A的转置阵,设转置阵为A1
A1<-t(A)
第五部:计算矩阵A与其转置阵A1相乘
H1<-A%*%A1