案例演示 | R语言绘制热图代码

Python025

案例演示 | R语言绘制热图代码,第1张

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我们在分析了差异表达数据之后,经常要进行热图的可视化展示。

热图(Heat map) 是一个以 颜色 变化来显示数据的 矩阵 。虽然“热图”是一个新兴的词汇,但是用明暗的矩阵来标示元素的方法已经有超过一世纪的历史了。

热图源自于展示数据的平面图像,较大的数字以小的深灰色、黑色方格呈现,而较小的数字则以较亮的方格标示。如Toussaint Loua在1873年就曾使用这样的手法来绘制对 巴黎 各区的社会学统计。 [1] 彼得·斯伊斯在1957年时进行 群集分析 时也透过置换矩阵的行和列的方法将更相似的值标示在一起。雅克·贝尔坦也曾用过类似的方法标示出 累积量表 的资料。而将 阶层式分群法 加入到矩阵中的概念则是由罗伯特·F·林于1973年创造,他利用多次印刷堆叠出的字符来表示不同程度的灰色,将每个字符大小则视为一像素。利兰·威尔金森则是于1994年开发出了第一个能生成高分辨率的矩阵的计算机程序—SYSTAT。

软件设计师科尔马克·金尼则在1991年时注册了热图这个商标用以形容一种描绘金融市场信息的平面图形, [2] 但是取得了金尼发明的公司在2003年时不小心使得这个商标失效了 [3]

R语言教程是指导使用R语言的手册,用于统计分析,图形表示和报告的编程语言和软件环境。

R语言由Ross Ihaka和Robert Gentleman在新西兰奥克兰大学创建,目前由R语言开发核心团队开发。R语言在GNU通用公共许可证下免费提供,并为各种操作系统(如Linux,Windows和Mac)提供预编译的二进制版本。

这种编程语言被命名为R语言,基于两个R语言作者的名字的第一个字母(Robert Gentleman和Ross Ihaka),并且部分是贝尔实验室语言S的名称。

扩展资料

适用人群

本教程是为期待使用R编程开发统计软件的软件程序员,统计学家和数据挖掘者设计的。如果你试图理解R编程语言作为一个初学者,本教程将给你足够的了解语言的几乎所有的概念,从那里你可以把自己的更高水平的专业知识。

学习前提

在继续学习本教程之前,您应该基本了解计算机编程术语。对任何编程语言的基本理解将帮助您理解R语言编程概念,并在学习轨道上快速移动。