x,y 用于横纵坐标作图的数据对象。
type 图类型（线条和点类型），使用格式type=" "。
type="p"显示为空心点。plot
type="l"显示为线条。line
type="b"显示为空心点和线条。both
type="c"显示为无点和线条。
type="o"显示为空心点和线条，线穿过空心点。
type="s"/"S"显示为阶梯线。
type="h"显示为直方图样的垂直线。
type="n"显示为无点和无线条。
xlim/ylim 用于指定图的x轴和y轴的范围，使用格式：xlim=c(x1,x2), ylim=c(y1,y2)。
xlab/ylab 用于给图的x轴和y轴添加标签，使用格式：xlab="xlab"，ylab="ylab"。
main 用于对plot添加主标题， main=" "。
sub 用于对plot添加副标题， sub=" "。
log 用于对x或者y值取log。log="x"/"y"/"xy"。
ann 使用T/F对plot中的标题，x轴标签，y轴标签是否显示进行定义。
axes 使用T/F对坐标轴是否显示进行定义。
frame.plot 使用T/F对画图外框是否显示进行定义。
panel.first 参数还没弄懂，panel.first="grid(8,8)"对背景线进行定义。
asp 表示y/x的纵横比。
lty 用于线条类型的定义，指定值为整数，lty="1"。
lty="0"显示为空白，即无线条。
lty="1"显示为实线线条。
lty="2"显示为虚线线条。
lty="3"显示为点状线条。
lty="4"显示为点虚线线条，点和虚线线条间隔。
lty="5"显示为长虚线。
lty="1"显示为双破折号线条。
1. 判断存在：一个元素是不是在向量中用 a%in%b>a="TT"
>b=c("AA","AT","TT")
>a %in% b
[1] TRUE
2. 判断某一元素这向量中的索引（第几个位置）： index.TT=which(b==”TT”)
>index.TT=which(b=="TT")#index.TT是想知道的索引号，which是判断函数，b是想知道的元素所在的向量
>index.TT
[1] 3
3. 相当于 python 中的字典， names 函数
>b
[1] "AA" "AT" "TT"
>names(b)=c("geno1","geno2","geno3")#geno mean genotype
>names(b)
[1] "geno1" "geno2" "geno3"
>names(b)[1]
[1] "geno1"
>names(b)[1]="test"
>names(b)
[1] "test""geno2" "geno3"
>names(b)=NULL
>b
[1] "AA" "AT"
>b["geno2"]
"AT"
pop_name=c(“CEU”,"YRI")
names(pop_name)=c(1,2)
names(pop_name[1])=1
4. 去除某一元素： b[-index.nu]
#想去除元素”TT”,如果你不知道是第几个索引，可以先判断索引，再删除。
>b=c("AA","AT","TT")
>names(b)=c("geno1","geno2","geno3")
>index.TT=which(b=="TT")
>b=b[-index.TT]
>b
geno1 geno2
"AA""AT"
5. 相当于 Python 中的 set() 函数 和 count() 函数： unique() ， table()
>b=c("TT","AT","AT","TT","AA")
>unique(b)#即相当于去除所有的重复，只保留一个
[1] "TT" "AT" "AA"
>table(b)#以元素为name,统计各元素的个数
b
AA AT TT
122
6. 字符串的分割： strsplit()
>test="AA"
>strsplit(test)
错误于strsplit(test) :缺少参数"split",也没有缺省值
>strsplit(test,split='')
[[1]]
[1] "A" "A"
>test=strsplit(test,split='')[[1]]
>test
[1] "A" "A"
7. 文本文档的写入： write.table()
write.table( res.matrix,file=new.file,sep='\t',quote=F,row.names=F,col.names=F,append=T)#quote=F去掉引号后写入，row.names=F去掉行的名字写入，否则会把名字写进去
##写入数据时候最好把数据存储成一个matrix然后直接写。要是每行每行写的话要注意数据的格式了。先建立一个空的matrix，见8，然后通过rbind或者cbind叠加上去。
方法一：
a=c()
b=c(“AA”,”TT”,”CC”)
for (i in 1:3){
a=c(a,b)
}
write.table(a,file=”test.txt”)#你会发现结果是
AA
TT
CC
….
##而且还有行和列的名字，因为没有设置参数。因为对于c向量来说，写的话默认是竖着写的，每个元素占一行。所以比较方便的就是rbind
方法二：
a=c()
b=c(“AA”,”TT”,”CC”)
for (i in 1:3){
a=rbind(a,b)
}
write.table(a,file=”test.txt”，quote=F,row.names=F,col.names=F)#你会发现结果是
AA TT CC
AA TT CC
AA TT CC
##原因是rbind把最总结果当做矩阵了。对于R数据的写入最好能生成最后的矩阵再写入。但是西面的梅一行写一次和方法二的效果是想通的，但是要用到append参数。
a=c()
b=c(“AA”,”TT”,”CC”)
for (i in 1:3){
a=rbind(a,b)
write.table(a,file=”test.txt”，quote=F,row.names=F,col.names=F,append=T)
}
8. 建立一个空的 matrix ：
res.matrix <- matrix( ,nrow=0,ncol=6 )##这样就建立了一个0行6列的空matrix了。
9. 如何将 R 运行结果输出到文件
>x=read.table("F:/my/work/chengxu/PValue/pc2jieguo/pc2302.txt")
>z=t(x)
>ks.test(y,z)
Two-sample Kolmogorov-Smirnov test
data:y and z
D = 0.207, p-value <2.2e-16
alternative hypothesis: two-sided
如上面运行结果，我想将p-value <2.2e-16自动保存到一个文件中，如何用R程序实现，谢谢！
sink("output.txt")
print(ks.test(y,z)$p.value)
sink()
http://cos.name/cn/topic/16300
10 降序排列：
>a=c(1,1.2,0.1,4,5,-0.1)
>a=sort(a,decreasing=T)
>a
[1]5.04.01.21.00.1 -0.1
11. 取前1％的数
>a=c(1:10,4:20,1:100,1:1000)
>a=sort(a,decreasing=T)#先降序
>sig=a[round(length(a)*0.01)]
>sig
[1] 990
12.在shell中直接执行R脚本
R CMD BATCH --argstest.R
13. R中高级作图的方法
http://qizhi502.blog.163.com/blog/static/11497002520120611451736/
14:设置字体类型：
par(family='Times New Roman')
15:控制图形四周的空白大小
par(mfrow=c(3,1),mar=c(0,0,0,0))
其中mar是四周的间距,分别为x,y上下的距离
16控制作图区域的大小layout
layout(c(1,2,3),height=c(1,1,0.5))
分成竖着三份， 其中三份比列依次为（高度依次为2：2：1）
17保留两位小数
round(0.123,digits=2)
18 在原有图的基础上画图：
par(fig=c(0.1,0.5,0.43,0.65), new=TRUE)
19 只显示y轴
plot(1:10,1:10,axes=F)
axis(2,at.....)
20 调节刻度方向 las
plot(1:10,1:10,las=1)
21 屏幕分割
layout(matrix(1:16,4,4))＃＃＃竖着plot
par(mfrow=c(4,4))##横着plot
22.逻辑表示或者
xor为异或，两值不等为真，两值相等为假。例：xor(0, 1)
23. 从向量中随机取几个数sample
sample(rep(1:1000),10)
23 字符串转换成小数浮点型
as.numeric("0.123")
24. 读取不规范的文本
f=readLines(afile,n=1)＃n表示读几行
f=strsplit(f,'\t')##分割
f[1][[1]]##第一行
f[1][[1]][1]##第一行 第一个字符串
25. write 写入文件
write(afile, "a\tb\t",append=T) #沿着每行一次 写入
26. 不需要循环，这直接对matrix没行或者每列进行筛选操作apply（）
apply（data,col2 or row1, max>0）
27.保留2位小数
a=2.300
a=as.numeric(sprintf(“%.3f”,a))
28。调出假设检验的p value
t.test(data1,data2)$p.value
x <- seq(-1,1,length = 5000)y1 <- (1-x 2) (1/2)+(x 2) (1/3)
y2 <- -(1-x 2) (1/2)+(x 2) (1/3)
plot(c(rev(x),x),c(rev(y2),y1), type = 'l' ,xlim = c(-1,1), xlab = "",ylab = "", axes = F,col=2)
library("RColorBrewer")
col<-brewer.pal(3,'Set1')[1]
t<-seq(0,60,len=100)
x<--0.01 (-t^2+40 t+1200) sin(pi t/180)
y<- 0.01 (-t^2+40 t+1200) cos(pi t/180)
plot(c(-12,14),c(0,20),type = 'n',axes = T,xlab = '',ylab = '')
arrows(-11,8,14,8,lwd=8,col='gold')
arrows(14,8,-11,8,lwd=8,col='gold',angle = 120)
polygon(x,y,col=col,border = NA)
polygon(-x,y,col=col,border = NA)
lines(x,y,lwd=1)
lines(-x,y,lwd=1)
参考文献：
https://blog.csdn.net/kMD8d5R/article/details/79327603
https://www.r-bloggers.com/make-a-valentines-heart-with-r/
https://mp.weixin.qq.com/s/Iqcqo5YTy1qmXdsuIrlrYQ
http://www.matrix67.com/blog/archives/4139 </pre>
PS：
据说笛卡尔最后还是没能等到 自己等了很久的那个人
但是这不重要，重要的是。。。群里好多有心型图啊
不知道作者们愿不愿意放上来分享一下（哈哈哈哈）
各位端午节快乐，没脱单的早日脱单
以及，下次再有人问你R语言能干什么，告诉他可以拿去表白
和大神们比画图我还是嫩了点（顶锅盖逃走）
