所有的DLT产品都优化了使用大的BlockSize。BlockSize指定了写到磁带上的数据模块的大小。
CAARCserve(forWindowsNT)
查看CA的技术支持文档："NT-AS6:Title:ChangingtheBlockSizeforaDLTdrive"
http://support.cai.com/techbases/asnt/NASNT123.html
ARCserveforWindowsNTversion6.x默认为DLT设备设置了16K的write-BlockSize。为了增强性能，在NT的注册表中，做如下改动：
运行：Regedt32.exe
HKEY_LOCAL_MACHINESOFTWARECheyenneARCserveCurrentVersionTapeEngineDevice#(设备号码相当于需要更改BlockSize的磁带设备，磁带名称可以可以在设备管理器中看到。)
点击Edit,选择ADDVALUE:ValueName=DefaultBlockFactorDatatype=Reg_DwordData:6,Hex
除了6，如下数值同样可以被选择：
0=512(default)1=1,024(1KB)2=2,048(2KB)3=4,096(4KB)4=8,192(8KB)5=16,384(16KB6=32,768(32KB)7=65,536(64KB)
更改完成后，关闭应用程序，再打开应用程序开始新的备份任务。
VeritasBackupExec(forWindowsNTand2000)
启动应用程序：BackupExec.
在"Devicestab"中选择DLT1磁带器的属性Properties
选择：Configuration
对于DLT1设备，更改DLT1的BlockSize为64KB，对于其他DAT，DLT设备，更改BlockSize为32KB。
逐一改变其他设备。
如果硬件设置更改（比如：SCSIID改变，新磁带设备加入），这个过程还需要再做。
TapeWare
关于BlockSize有两个要素需要明确。第一、执行OBDR需要一个aBlockSize2048K，如果改动了这个数值，那么灾难恢复不可执行。第二、不同的产品，更改BlockSize会有不同的性能影响。
DDS磁带机的BlockSize对于性能影响很小。这样，增加BlockSize只能带来很小的改进，同时影响灾难备份不正常。HP建议保留DDS的默认BlockSize在2048K，不要更改。
DLT磁带机使用32或64K的BlockSize时性能最好。而且DLT产品不支持OBDR，所以，可以更改2048K的BlockSize。
TapeWare对DLT产品默认使用32K的BlockSize。如果遇到DLT产品的性能问题，可以增加BlockSize到64K来改进备份速度。
方法：
关闭TapeWare应用程序，停止TapeWare服务。然后，编辑TWTAPDEV.INIFILE：
在文本文件的编辑器中打开文件，（比如记事本）找到如下段落：
[dltDevices]
readToWriteDelay=50
deviceBlockSize=32768
mediaClass=4
developmentLevel=3
改变：deviceBlockSize=32768为deviceBlockSize=65536.
保存文件，重新启动TapeWare。
LTO设备，如果要使用OBDR功能，同样限于2048K,然而，LTO产品处理数据的方式不同于DLT和DDS产品，所以，增加BlockSize的大小不会明显改进性能。
Sco中更改BlockSize的大小，命令：
SetblksetBlockSize(inbytes)fordevice
GetblkgetBlockSize(inbytes)fromdevice
安装R包GOstats，出现以下错误：
ERROR: dependency ‘httr’ is not available for package ‘KEGGREST’
* removing ‘/public/home/wangyantao/soft/anaconda3/envs/r-4.1/lib/R/library/KEGGREST’
ERROR: dependency ‘ KEGGREST ’ is not available for package ‘AnnotationDbi’
* removing ‘/public/home/wangyantao/soft/anaconda3/envs/r-4.1/lib/R/library/AnnotationDbi’
ERROR: dependency ‘ AnnotationDbi ’ is not available for package ‘GO.db’
* removing ‘/public/home/wangyantao/soft/anaconda3/envs/r-4.1/lib/R/library/ GO.db ’
ERROR: dependencies ‘AnnotationDbi’, ‘httr’ are not available for package ‘ annotate ’
* removing ‘/public/home/wangyantao/soft/anaconda3/envs/r-4.1/lib/R/library/annotate’
ERROR: dependency ‘AnnotationDbi’ is not available for package ‘ AnnotationForge ’
* removing ‘/public/home/wangyantao/soft/anaconda3/envs/r-4.1/lib/R/library/AnnotationForge’
ERROR: dependencies ‘annotate’, ‘AnnotationDbi’ are not available for package ‘ GSEABase ’
* removing ‘/public/home/wangyantao/soft/anaconda3/envs/r-4.1/lib/R/library/GSEABase’
ERROR: dependencies ‘AnnotationDbi’, ‘annotate’ are not available for package ‘ genefilter ’
* removing ‘/public/home/wangyantao/soft/anaconda3/envs/r-4.1/lib/R/library/genefilter’
ERROR: dependencies ‘AnnotationDbi’, ‘GSEABase’, ‘genefilter’, ‘annotate’ are not available for package ‘ Category ’
* removing ‘/public/home/wangyantao/soft/anaconda3/envs/r-4.1/lib/R/library/Category’
ERROR: dependencies ‘Category’, ‘AnnotationDbi’, ‘GO.db’, ‘annotate’, ‘AnnotationForge’ are not available for package ‘ GOstats ’
* removing ‘/public/home/wangyantao/soft/anaconda3/envs/r-4.1/lib/R/library/GOstats’
尝试安装“ httr ”
Installing package(s) 'httr'
also installing the dependency ‘openssl’
报错：
Error: package or namespace load failed for ‘openssl’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
unable to load shared object '/public/home/wangyantao/soft/anaconda3/envs/r-4.1/lib/R/library/00LOCK-openssl/00new/openssl/libs/openssl.so':
/public/home/wangyantao/soft/anaconda3/envs/r-4.1/lib/R/library/00LOCK-openssl/00new/openssl/libs/openssl.so: undefined symbol: EVP_CIPHER_CTX_block_size
Error: loading failed
Execution halted
ERROR: loading failed
* removing ‘/public/home/wangyantao/soft/anaconda3/envs/r-4.1/lib/R/library/openssl’
ERROR: dependency ‘openssl’ is not available for package ‘httr’
* removing ‘/public/home/wangyantao/soft/anaconda3/envs/r-4.1/lib/R/library/httr’
始终解决不了这个bug
Error: package or namespace load failed for ‘openssl’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
unable to load shared object '/public/home/wangyantao/soft/anaconda3/envs/r-4.1/lib/R/library/00LOCK-openssl/00new/openssl/libs/openssl.so':
/public/home/wangyantao/soft/anaconda3/envs/r-4.1/lib/R/library/00LOCK-openssl/00new/openssl/libs/openssl.so: undefined symbol: EVP_CIPHER_CTX_block_size
使用conda install r-package 进行R包的安装，直接安装GOstats还是不行，
现在尝试把报错的那些附属包先安装上。
使用conda install r-package 或者 在R下使用BiocManager::install("package")
将GOstats中缺少的依赖包全部安装：
1、安装openssl
conda install r-openssl
2、安装httr
conda install r-httr
3、安装KEGGREST，安装失败
conda install r-KEGGREST
4、进入R中进行安装KEGGREST
BiocManager::install("KEGGREST")
5、安装 AnnotationDbi
BiocManager::install("AnnotationDbi")
6、安装 GO.db
BiocManager::install("GO.db")
7、安装annotate
BiocManager::install("annotate")
依次安装
BiocManager::install("AnnotationForge")
BiocManager::install("GSEABase")
BiocManager::install("genefilter")
BiocManager::install("Category")
BiocManager::install("GOstats")
安装成功！
bed文件怎么看区域大小1）BED文件
BED 文件(Browser Extensible Data)格式是ucsc 的genome browser的一个格式 ,提供了一种灵活的方式来定义的数据行，以用来描述注释信息。BED行有3个必须的列和9个额外可选的列。每行的数据格式要求一致(见下图)。 每条线的字段数目必须是任意单条数据的在注释上一致。
BED文件结构：
-------------------------------------------------------------必须有以下3列------------------------------------------------------------------------
chrom :即染色体号
chromStart :即feature在染色体上起始位置 。在染色体上最左端坐标是0
chromEnd :即feature在染色体上的终止位置。例如一个染色体前100个碱基定义为chromStart=0, chromEnd=100, 跨度为 0-99.
----------------------------------------------------------------可选9列-------------------------------------------------------------------------------
name ：feature的名字 ，在基因组浏览器左边显示；
score ：在基因组浏览器中显示的灰度设定，值介于0-1000；
strand ：定义链的方向，''+” 或者”-”
thickStart ：起始位置(例如，基因起始编码位置）
thickEnd ：终止位置（例如：基因终止编码位置）
itemRGB ：是一个RGB值的形式, R, G, B (eg. 255, 0,0), 如果itemRgb设置为'On”, 这个RBG值将决定数据的显示的颜色。
blockCount ：BED行中的block数目，也就是外显子数目
blockSize：用逗号分割的外显子的大小, 这个item的数目对应于BlockCount的数目
blockStarts ：用逗号分割的列表, 所有外显子的起始位置，数目也与blockCount数目对应
2)bed和gff之间的关系
前面已经讲过GFF格式，用UCSC Genome Browser可以将两者进行可视化比较。 Bed文件和GFF文件最基本的信息就是染色体或Contig的ID或编号，然后就是DNA的正负链信息，接着就是在染色体上的起始和终止位置数值。
两种文件的区别在于，BED文件中起始坐标为0，结束坐标至少是1；GFF中起始坐标是1而结束坐标至少是1。
