R语言实战-基本图形

Python07

R语言实战-基本图形,第1张

条形图使用的函数为'barplot(x)',其中x为向量

以关节炎研究包vcd为演示对象

治疗类型和改善情况的列联表

条形图并不一定要基于计数数据或频率数据。你可以使用数据整合函数将结果传递给barplot()函数。

来创建表示均值、中位数、标准差等的条形图。

棘状图对堆砌条形图进行了重缩放,这样每个条形的高度均为1,每段的高度即表示比例。

增加名称、颜色和填充颜色

可比较的密度图

箱线图(又称盒须图)通过绘制连续型变量的五数总括,即最小值、下四分位数(第25百分位数)、中位数(第50百分位数)、上四分位数(第75百分位数)以及最大值,描述了连续型变量的分布。箱线图能够显示出可能为离群点(范围±1.5*IQR以外的值,IQR表示四分位距,即上四分位数与下四分位数的差值)的观测。

并列箱线图

对box图的参数进行修改

双因素交叉的箱式图

小提琴图(violin plot)是箱线图与核密度图的结合。需要安装vioplot包

点图提供了一种在简单水平刻度上绘制大量有标签值的方法。

分组、排序、着色后的点图

数据框(data.frame)是R中最常处理的数据结构。

函数:data.frame(col1,col2,col3,....,row.name=NULL, check.rows = FALSE, check.names=TRUE, stringsAsFactors = default.stringsAsFactors())

其中的列向量col1, col2, col3,...可为任何类型(如字符型、数值型或逻辑型),每一列的名称可由函数names指定;

row.name用于指定各行(样本)的名称,默认没有名称,使用从1开始自增的序列来标识每一行;

check.rows用于用来检查行的名称和数量是否一致,默认为FALSE;

check.names来检查变量(列)的名称是否唯一且符合语法,默认为TRUE;

stringsAsFactors用来描述是否将字符型向量自动转换为因子,默认转换,若不改变的话使用stringsAsFactors = FALSE来指定即可。

每一列数据的模式必须唯一,不过你却可以将多个模式的不同列放到一起组成数据框。

先构建向量,再组成数据框。

直接用data.frame函数构建数据框。

R语言的下标索引是从1开始的,且下标索引为负数的话表示删除某个元素。

[] 可进行索引,括号内对应的是[行下标, 列下标]。

[1] 1 2 3 4 5 6 7 8

[1] "four"

[1] 1 2 3 4 5 6 7 8

[1] "four"

[1] 1 2 3 4 5 6 7 8

[1] "one" "two" "three"

attach、detach和with()

函数attach()可将数据框添加到R的搜索路径中。

函数detach()将数据框从搜索路径中移除。

函数attach()和detach()最好在你分析一个单独的数据框,并且不太可能有多个同名对象时使用。

with()就是把所有操作都限制在数据框上。

The following objects are masked by .GlobalEnv:

[1] 1 2 3 4 5 6 7 8

[1] "n1" "n2" "n3" "n4" "n5" "n6" "n7" "n8"

[1] 8

[1] 3

[1] 8

[1] "name""values" "values2"

[1] "r1" "r2" "r3" "r4" "r5" "r6" "r7" "r8"

[1] 8 3

[1] "data.frame"

[1] "numeric"

[1] "character"

Length:8 Min. :1.00 Min. :1.00

Class :character 1st Qu.:2.75 1st Qu.:2.75

Mode :character Median :4.50 Median :4.50

Mean :4.50 Mean :4.50

3rd Qu.:6.25 3rd Qu.:6.25

Max. :8.00 Max. :8.00

[1] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE

通过par()设定图形参数,设定后将对当前所有图形参数有效,而在绘图函数中指定的参数则仅对那个特定图形有效。

函数:par(...,no.readonly = FALSE) 通过设定函数par()的各个参数来调整图形。

...,表示需要设定的图形参数,"参数名=取值"或"赋值参数列表"形式的变量。

no.readonly逻辑变量,如果是TRUE且没有其他变量,则返回当前绘图设备下已设定好的绘图参数。 13

可以使用图形参数来指定绘图时使用的符号和线条类型。

选项pch=用于指定绘制点时使用的符号。

选项lty=用于指定想要的线条类型。

可选取的值见下图。

在R中,可以通过颜色下标、颜色名称、十六进制的颜色值、RGB值或HSV值来指定颜色。查看系统中所有可用颜色colors(),也可写为colours()。

函数rgb()可基于红---绿---蓝三色值生成颜色。 14 函数:rgb(red, green, blue, alpha, names = NULL, maxColorValue = 1)

红、绿、蓝三色的取值范围在0-1之间,alpha设置透明度,0代表完全透明,1代表完全不透明。names用于指定生产颜色的名称。

palette()调色板。

默认是8种颜色,即:"black"、"red"、"green3"、"blue"、"cyan"、 "magenta"、"yellow"、"gray",并且循环引用。

hsv()则基于色相(Hue)-饱和度(Saturation)-亮度(Value)值来生成颜色。

函数:hsv(h = 1, s = 1, v = 1, alpha)

h,s,v的取值为0-1之间。

R中也有多种用于创建连续型颜色向量的函数, 包括rainbow()、heat.colors()、 terrain.colors()、 topo.colors()以及cm.colors()。

图形参数同样可以用来指定字号、字体和字样。

参考资料:

R中设置图形参数--函数par()详解, https://blog.csdn.net/qingchongxinshuru/article/details/52004182

R语言基础图形元素------颜色, https://blog.csdn.net/qq_40794743/article/details/107746723