生物信息学在线工具gorilla执行go富集分析有没有多重假设检验矫正

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生物信息学在线工具gorilla执行go富集分析有没有多重假设检验矫正,第1张

在生物信息学分析中,通常要用到统计学的知识,具体的例子如下在paml计算选择压力时,计算正选择基因的显著性、基因家族收缩和扩张时的显著性、计算差异表达基因的显著性、富集分析等。对于这些分析通常都会有p值和校正之后的p值,那么对于我们什么时候用p值,什么时候用校正之后的p值,你知道吗?

P值是啥

P 值即概率,反映某一事件发生的可能性大小。统计学根据显著性检验方法所得到的P 值,一般以P <0.05 为显著, P <0.01 为非常显著,其含义是样本间的差异由抽样误差所致的概率小于0.05 或0.01。实际上,P 值不能赋予数据任何重要性,只能说明某事件发生的机率。

纠正p是啥意思

通常意义上讲,p值<0.01,就保证了99%的准确性,在生信分析中,也就是说在100个个体中可能有1个是假阳性,这样误差在100这么大的样本量中是可以接受的,但是如果样本量为10万,那么就有1000个事假阳性,那么这样,我们可能就不会接受这么多的错误。处女座的人尤其如此,如果心理是可以接受找的到的结果少,但是必须准确。那么我们必须这么做啦。

对于一个个体,我们觉得99%的准确率就可以啦。同样我们要求第二个个体也要99%的准确率,并且二者要同时满足,也就是同时发生,那么p值必须是p1*p2,也就是说显著水平要满足<0.0001,才可以。

因此有一种校正的方法就是p<0.01/10^n不过这种纠正过于严格,会丢掉超级多的真阳性。因此现在更多的是FDR校正,Bonferroni校正等。

是什么时候需要矫正呢

建议:单次检验或者样本量不超过100的时候,原始p值就可以啦。

多次检验或者样本量超过100的时候,建议使用校正之后的p值。

希望可以帮到你。

1整理和导入

通过GoPro的导入向导或手动复制粘贴两种方式进行拷贝,将所有视频素材放在同一个文件夹内,并依次按照镜头位置有规律的重命名,例如:正面机器为1号机,视频素材为1.mov;顺时针方向第二台机器为2号机,视频素材为2.mov,以此类推完成对视频素材的整理之后,将其全选拖放到AVP软件界面中,即可实现快速导入。

2同步

为保证视频素材同步成功,在拍摄时有两种解决方法:一种是全部开机后对着摄像机不同的方向响亮地击掌,最大化音频特征有助于AVP识别同步;另一种就是快速旋转摄像机,通过画面进行同步。如果忘记做这一系列动作的话,我们也可以借助第三方剪辑软件(例如:Premiere、Vegas、Final Cut)进行同步后再缝合。

点击工具栏中的同步按钮“Synchro”打开同步工具窗,上面是需要校准的时间段,软件默认为30秒,下方分别是“Use audio to synchronize(通过声音同步)”和“Use motion to synchronize(通过运动同步)”两个按钮,分别代表两种同步方式。选择其一后,可以看到视频当前帧所处的时间点发生改变,这便是自动同步后的结果,点击下面“Apply(应用)”按钮确认完成同步。

3缝合

一起就绪,把当前帧拖动到所有画面相对静止且清晰的位置以保证缝合的准确度,点击“Stitch(缝合)”按钮后会弹出下拉菜单,选项中包括:“Stitch as GoPro”和“Stitch as ...”

4细节调整

缝合完毕后,我们可以看到几段视频被整合到一起。点击预览窗口左下角的“Edit(编辑)”按钮,调用同属Kolor公司的Autopano Giga软件,在这里对全景视频进行各种校正编辑。依次调整方向、水平、垂直并保存,点击关闭按钮返回到AVP。

5视频裁剪

确定输出视频的起始时间和结束时间,分别将帧拖动到指定位置,点击“起始帧按钮”(小旗子标识)和“结束帧按钮”(小旗子标识)即可。

6渲染输出

点击“Render(渲染)”按钮弹出窗口

可以看出渲染框被分为三部分,分别是:Size(尺寸)、Blending presets(混合预设)、Output(输出)。将尺寸设置为相机拍摄的原尺寸或4096*2048,选择输出视频文件的位置,也可以手动修改此按钮左边的输入框中的文件路径和文件名。最后点击OK开始渲染,这是一个比较漫长的过程,请耐心等待。

经过以上六步工序之后,一部由6目GoPro拍摄的全景视频就被缝合好了,接下来可以用全景播放器Kolor Eyes进行预览。

1、在djigo4APP进入“飞控参数设置”,下拉到底部,选“高级设置”进入“传感器状态”,选“指南针”,然后点击指南针校准。这时无人机状态指示灯黄灯常亮表示指南针校准程序已经启动。

2、在离地面1.5米的地方,水平旋转飞行器360°飞行器状态指示灯绿常亮。

3、在离地面1.5米的地方,机头朝下竖直旋转360度。

4、完成校准后,如果状态指示灯显示红灯闪烁,表示校准失败,需要更换起飞地点后重新校准指南针。指南针校准成功后,三分钟内可起飞。如果把飞无人机放回地面三分钟后再次提示需要校准,则需要重新校准。