R语言分组箱线图添加显著性标记简单小例子

Python0110

R语言分组箱线图添加显著性标记简单小例子,第1张

最终出图如下

这里自动做统计检验的函数是 stat_compare_means()

读入数据

作图

这个函数来自于ggpubr这个包,只需要指定根据那一列来分组就可以了

默认的是Wilcoxon Rank Sum and Signed Rank Tests,如果要用t检验指定method参数

如果想把P值改成星号,直接加label=“p.signif”参数

这里如果不显著会在图上显示ns,如果不想要ns,可以加 hide.ns = TRUE 参数

星号的位置可以手动指定,用 label.y = c(26,31) 参数

使用到的是 ggsignif 这个包

小明的数据分析笔记本

线图主要是通过四分位数描述数据分布,通过最大值,上四分位数,中位数,下四分位数,最小值五处位置描述数据分布情况。箱线图能够显示出可能为离群点(范围±1.5*IQR以外的值,IQR表示四分位距,即上四分位数与下四分位数的差值)的观测。从箱线图中,可以大致推断出数据的集中或离散趋势。

boxplot() 是一个泛型函数,目前支持两种参数类型:公式和数据。

x 参数为一个数值向量或者列表,若为列表则对列表中每一个子对象依次作出箱线图。

formula 为一个公式,比如 y ~ x。

data 参数为一个数据框或者列表。

na.action 参数是对NA值的操作,默认为忽略。

ann 参数为逻辑值,是否绘制坐标轴。

range 是一个延伸倍数,决定了箱线图的须延伸到什么位置。

width 设置箱子的宽度。

varwidth 为逻辑值,若为 TRUE,那么箱子的宽度与样本量的平方根成比例。

notch 决定了是否在箱子上画凹槽,可以用于比较两组数据的中位数是否有差异。

horizontal 是否水平放置箱线图。

add 参数设置是否将箱线图添加到现有图形上。

at 参数,当add为TRUE时,设置箱线图位置。

[1] https://www.sohu.com/a/220236877_434937

[2] https://zhuanlan.zhihu.com/p/144339417

[3] Robert I. Kabacoff (著). R语言实战(高涛/肖楠/陈钢 译). 北京: 人民邮电出版社.