R语言绘图包06--基因表达相关性绘图corrplot

Python019

R语言绘图包06--基因表达相关性绘图corrplot,第1张

R语言绘图包系列：

参数

参考：

https://cran.r-project.org/web/packages/corrplot/vignettes/corrplot-intro.html

https://mp.weixin.qq.com/s/zq5jiOTeAM1dxfqnthWBBg

前言： 在构建ceRNA 网络时，需要计算lncRNA 与 蛋白编码gene (pc gene） 间的表达相关性，一般采用皮尔逊相关系数。具体如何做呢？

2.获得mRNA的表达矩阵

4个基因在100个样本的表达量矩阵：

3.计算lncRNA 与gene 的表达相关性

使用cor()函数进行皮尔森相关系数计算，就是这么简单：