QTL分析的一般程序是什么?

QTL分析的一般程序是什么?

这个,只能复制别人的东西了。可以跟你明说,整个中国对QTL定位真正明白能用自己话说清楚的人不超过100个,而且这些人都不上百度。一般而言,步骤就是,创建群体--分子标记筛选---做连锁图谱---性状测量(多重复)---寻找QTL就群体而言,
Python210
R语言相关性分析

R语言相关性分析

1.  R语言自带函数cor(data, method=" ")可以快速计算出相关系数 ,数据类型:data.frame  如data.frame为:zz, 绘图如下:a. single protein:线性
Python220
R语言相关性分析

R语言相关性分析

1.  R语言自带函数cor(data, method=" ")可以快速计算出相关系数 ,数据类型:data.frame  如data.frame为:zz, 绘图如下:a. single protein:线性
Python790
R语言常用函数整理(基础篇)

R语言常用函数整理(基础篇)

R语言常用函数整理本篇是基础篇,即R语言自带的函数。 vector:向量 numeric:数值型向量 logical:逻辑型向量 character;字符型向量 list:列表 data.frame:数据框 c:
Python180
r语言线性回归分析怎么看正负相关

r语言线性回归分析怎么看正负相关

看回归方程y=a+bx中的b值的正负,如果b是正数,就是正相关;如果b是负数,就是负相关。b值只能用来判断相关性的正负,但b并不是相关系数,相关系数在线性回归方程中是确定系数R^2的平方根R值,其正负号由b值的正负号决定。x&lt-
Python180
Python数据分析 | 数据描述性分析

Python数据分析 | 数据描述性分析

首先导入一些必要的数据处理包和可视化的包,读文档数据并通过前几行查看数据字段。 对于我的数据来说,由于数据量比较大,因此对于缺失值可以直接做删除处理。 得到最终的数据,并提取需要的列作为特征。 对类别数据进行统计: 类别型字
Python240
使用R语言进行协整关系检验

使用R语言进行协整关系检验

使用R语言进行协整关系检验协整检验是为了检验非平稳序列的因果关系,协整检验是解决伪回归为问题的重要方法。首先回归伪回归例子:伪回归Spurious regression伪回归方程的拟合优度、显著性水平等指标都很好,但是其残差序列是一个非平稳
Python170
R语言进行相关性分析

R语言进行相关性分析

相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析,从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性分析旨在研究两个或两个以上随机变量之间相互依存关系的方向和密切程度。一般来讲研究对象(样品或处理组)之间使用距离分析,而元素(物种或
Python130
R语言进行相关性分析

R语言进行相关性分析

相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析,从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性分析旨在研究两个或两个以上随机变量之间相互依存关系的方向和密切程度。一般来讲研究对象(样品或处理组)之间使用距离分析,而元素(物种或
Python200
如何用python作空间自回归模型

如何用python作空间自回归模型

基本形式线性模型(linear model)就是试图通过属性的线性组合来进行预测的函数,基本形式如下: f(x)=wTx+b 许多非线性模型可在线性模型的基础上通过引入层结构或者高维映射(比如核方法)来解决。线性模型有很好的解释性。线性回归
Python190
R语言进行相关性分析

R语言进行相关性分析

相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析,从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性分析旨在研究两个或两个以上随机变量之间相互依存关系的方向和密切程度。一般来讲研究对象(样品或处理组)之间使用距离分析,而元素(物种或
Python190
GWAS分析(R包GAPIT)之二(数据准备)

GWAS分析(R包GAPIT)之二(数据准备)

第一行是表头,第一列是个体号,其余每一列一个表型,Tab键分隔。 可以接受 standard HapMap format 或 numeric format。 第一种,Hapmap Format。 在基因型数据前有11列数据。尽管
Python150
R语言进行相关性分析

R语言进行相关性分析

相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析,从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性分析旨在研究两个或两个以上随机变量之间相互依存关系的方向和密切程度。一般来讲研究对象(样品或处理组)之间使用距离分析,而元素(物种或
Python170
R语言,分别计算pearson和spearman相关系数

R语言,分别计算pearson和spearman相关系数

1、打开R语言自带开发工具,RGui。2、定义一个向量  bd&lt-c(1,2,3,4,5)。3、通过length和sum函数对向量的均值进行计算,将计算出的均值放到meanx中。4、输入meanx即可看到计算出的均值。5、这只是
Python190
sklearn中tfidf的计算与手工计算详解

sklearn中tfidf的计算与手工计算详解

    引言:本周数据仓库与数据挖掘课程布置了word2vec的课程作业,要求是手动计算corpus中各个词的tfidf,并用sklearn验证自己计算的结果。但是博主手动计算的结果无论如何也与sklearn中的结果无法对应,在查阅大量资料
Python190