2019-05-06

Python015

2019-05-06,第1张

之前用的R版本是3.5.3,一切运行顺畅。

五一前就很想安装maftools包,但是反复尝试就是安装不成功,不知道原因出在哪里了

点开主页:类似于markdown格式的

maftools : Summarize, Analyze and Visualize MAF Files

昨天也就是五月四号,再次尝试,实际上这个包的介绍其实也是刚刚的事情

再一看,bioconduct上的安装要求,要求是R版本是3.6的(这个细节不容易发现吧)

接下来就是升级R版本到3.6,然后就顺利安装了maftools。PS:如果不知道怎么升级R版本,就去baidu

R版本是升级了,但是发现原来的R包用不了了,那就重新安装一遍,速度飞快,问题解决。

常规的R包安装没毛病,但是一下有个性的R包更新没有即使,对于刚升级的R不兼容,举例

ESTIMATE包 ESTIMATE: Home

2016年9月更新过一次,最新版本是1.0.13。注意这个包的的地址

本来一开始,我要设置安装版本的

install_version(c('estimate'), c('1.0.13'),repos=rforge,type="source")

后来我发现,不需要制定版本号,直接安装

rm(list = ls()) 

options()$repos

options()$BioC_mirror

options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))

options()$repos

options()$BioC_mirror

library(utils)

rforge <- "http://r-forge.r-project.org"

install.packages("estimate", repos=rforge, dependencies=TRUE)

the end。

补充一下,安装R包,一定要在网速最好的时候。另外,多去搜狗微信搜索,绝大部分 能解决你的问题,因为你现在遇到的问题别人可能早已遇见过了。

以上,第一次分享,感觉分享的不好。因为是问题解决了,才想起来分享,过程中的一些细节还是没有展示出来。遗憾。

你好,看你的报错信息,很明显是无法连接到mirros.ustc.edu.cn的镜像地址;第一种情况:你的网络环境不太好;推荐在网速良好的情况下再试一下;第二种来说:这个中国科技大的镜像抽风了,那就把R包镜像地址给换一下;再试一下,应该就可以解决了。