-Usage
aggregate(x, by, FUN, ..., simplify = TRUE, drop = TRUE)
与tapply类似，但是x可以为data.frame或矩阵；
-Arguments
by
a list of grouping elements, each as long as the variables in the data frame x. The
elements are coerced to factors before use.
-Example
-Usage
by(data, INDICES, FUN, ..., simplify = TRUE)
-Example
将warpbreaks的一二列，根据tension这一列的（L、M、H）运行summary
aggregate与by的区别 ：aggregate是对x的每一列分别根据因子进行分组计算，而by是根据因子将data整个分成几个小的data.frame，然后进行运算；
首先，merge的by.x和by.y是针对merge（x,y,...）的第一个参数x和第二个参数y而言的；然后指定by.x和by.y到底起什么作用呢，by.x和by.y实际上是用来告诉merge函数我们取出x的by.x列和y的by.y列中具有相同取值的行进行合并，其他的丢掉，另外如果指定了其中一个，那么另一个就必须同时指定，不然就报错；
最后，merge（x,y）为默认参数的调用函数（ by = intersect(names(x), names(y))），如果x,y有相同的列名，就按那个列具有相同的取值的行进行合并，x在前面，y在后面，相同的列名不再重复，如果x,y没有相同的列名，就把x的每一行和y的每一行合并一次。
以上就是merge的by，by.x,by.y参数的说明，Rstudio中有相关的帮助文档（help(merge)），楼主可以运行实例自己体会下。
