如何在64位win7系统中搭建R语言
第一步，下载Android开发的程序现在简称ADT，下载完就可以使用，已经不需要再另外下载eclipse了，直接到安卓官方下载即可。进入下载页面后，点击下载SDK的蓝色按钮。复选框打勾，选择64位，点击下载按钮。这个文件也就4百多兆。接下来
推荐阅读
热门文章
R语言中curve(dunif(x,0,1)),dunif(x,o,1)是什么意思呢
curve()接受的第一个参数可以是一个关于x（一维变量）的函数，可以直接写成f(x)（f是定义好的函数）。dunif()是均一分布的密度函数，第一个参数是要求密度的点，第二、三的参数给出均一分布的最小最大值。所以合起来就是要画出U(0,1
【R语言编程】---利用三代测序绘制菌群聚类热图与物种丰度图
前言： 仍然是三代测序数据的分析，宏基因组的文章中经常出现聚类热图和物种丰度图，用来直观地识别与某些疾病或者表型相关的菌群构成。 1.读取数据 一共有11个样本，每一个样本的测序reads都经过Nanopore官方的Epi2Me
R语言 排序 次条件
使用R包dplyr的函数arrange更简单，更简洁：#多条件排序：使用dplyr::arrangelibrary(dplyr)data("iris")head(iris)#第一列升序，然后是第三列升序arran
R语言DESeq2基因差异表达分析
经过表达定量后，我们已经得到了基因的表达量矩阵，差异表达分析通常是RNA-seq分析的第一步。 差异基因表达分析通常都是在R中，常用的有DESeq2，edgeR，limma等几种，这次主要介绍用DESeq2来进行差异表达分析。 需
R语言|绘制物种累计曲线
物种累积曲线( species accumulation curves)用于衡量和预测群落中物种丰富度随样本量扩大而增加的幅度，在生物多样性和群落调查中，被广泛用于判断样本量是否充分的并估计群落丰富度。 一般而言，在样本量较少的情况下，
R语言 RDA分析（去冗余物种）
也做了挺多次RDA分析，自己现在小结一下RDA分析流程： 就我个人而言，虚线前面都是不太经历的步骤，我一般不会主动删去样品的环境信息，因为我接触的菌群这块本来就没有什么多余的环境信息-_-||，所以我的重点放在怎么去除多余OTU或菌群上
R 语言计算生态位指数
生态位宽度(Bi)采用Colwell等（1971）加权修正的Levins指数 式中，Bi为物种i的生态位宽度值，其范围在[0-1]之间，值越大说明该物种生态位宽度越宽；Pij为物种i在第j资源状态下的个体数占该种所有个体数的比例，r为资
R语言绘制环形树状图
R语言绘制环形树状图 1.主要用到dendextend和circlize包绘图； 2.更改树状图的位置； 3.如果想要去掉图例标签，可设置 labels = FALSE参数； 4.个性化设置：树状分支颜色、文字标签颜色、风格
英语动物单词到底有哪些？
老虎——tiger狮子——lion [lan]白狮——white Lion母狮——lioness [lanes]美洲狮——puma [pju:m] 长的有点像豹熊——bear北极熊——polar bear [pul b] 极地棕熊——bro
R 语言计算生态位指数
生态位宽度(Bi)采用Colwell等（1971）加权修正的Levins指数 式中，Bi为物种i的生态位宽度值，其范围在[0-1]之间，值越大说明该物种生态位宽度越宽；Pij为物种i在第j资源状态下的个体数占该种所有个体数的比例，r为资
R计算功能多样性— functional diversity (FD)
一般植物功能特征被划分为3类：一是植物形态特征, 包括生长型、生活型、植株高度等；二是植物生殖特征,包括传粉方式、扩散方式、种子重量等；三是植物生理特征, 如植物固氮能力等[30].为研究中包括的每个物种创建一个定性和或定量性状的
怎样才能学好电脑的R语言？
R语言快速入门：数据结构+生成数据+数据引用+读取外部数据查看完整文档可至百度网盘：链接: https:pan.baidu.coms1cEdmpO5idfxx044TpqVBuA提取码: bi3tR是用于统计分析、绘图的语言和操作
Lotka-Volterra模型
种间竞争是指具有相似要求的物种，为了争夺空间和资源，而产生的一种直接或间接抑制对方的现象。Lotka-Volterrra的种间竞争模型：K是环境容纳量N则是物种的种群数量两者稳定共存的基本条件就是dN1dt=0和dN2dt=0
聚类分析4—环境数据来解释 (数量生态学：R语言的应用-第四章)
在这之前我们学习了聚类分析的基本概念、几种计算层次聚类的方法、进一步解读和比较层次聚类结果以及非层次聚类，这些聚类方法都是基于物种多度数据对样方进行分组，当然这些聚类方法也可以用于其他类型数据，特别是环境数据，所以本次就是介绍用 环境数据
R 数据可视化 —— circlize 基因组绘图函数
创建基因组数据的绘图区域的函数是circos.genomicTrack() ，或者circos.genomicTrackPlotRegions() 。 其实用方式类似于circos.track()函数，可以使用pan
《数量生态学：R语言的应用》第二版第三章-关联测度与矩阵------Q模式
生态学涉及多元统计方法，特别是排序和聚类，都是明确或不明确地基于所有可能对象或者变量之间的比较。这些比较通常采用关联测度（association meansures）(常称为系数或者指数)的形式，不管是样方还是变量之间的比较都是基于他
R语言与统计-3：卡方检验
R语言与统计-1：t检验与秩和检验 R语言与统计-2：方差分析拟合优度检验是用卡方统计量进行统计显著性检验的重要内容之一。它是依据总体分布状况，计算出分类变量中各类别的期望频数，与分布的观察频数进行对比，判断期望频数与观察频数是否有
R语言DESeq2基因差异表达分析
经过表达定量后，我们已经得到了基因的表达量矩阵，差异表达分析通常是RNA-seq分析的第一步。 差异基因表达分析通常都是在R中，常用的有DESeq2，edgeR，limma等几种，这次主要介绍用DESeq2来进行差异表达分析。 需
R语言计算α多样性指数与画图
操作之前安装好ggplot2、vegan、ggpubr包。如下: install.packages("ggplot2")install.packages("ggpubr") install.p