R语言绘图系列:
使用geom_label绘制标签散点图
绘制点,并通过nudge参数对标签进行x轴和y轴上的平移
使用angle参数对标签角度进行设置
geom_label可以使用fill对颜色进行填充,fontface设置字体,geom_text不能填充颜色
parse参数意思是前面传入的是一个数学表达式,size定义标签相对大小。
画一个散点图
annotate函数传入标签
添加矩形
添加短线段
2.1 guide_legend函数(主要参数:color, shape, size)
图例调整函数也属于标度函数的一类,但不可以直接使用加号来连接,必须放在函数中,作为一个参数。
guide_colorbar和guide_legend设置的是不同的图例,guide_colorbar定义色条图例,guide_legend定义普通图例。
2.2 标度函数scale
对于连续型变量,使用的参数是scale_xxx_continous(),对于分类型变量,使用的是scale_xxx_discrete()。
2.3:theme函数
在theme函数中,与图例有关的主要参数有:
标题主要有五种:主标题,副标题,角注,x轴标签和y轴标签
ggtitle()只能定义标题和副标题,默认的位置在左上角。
R语言绘制环形树状图
1.主要用到dendextend和circlize包绘图;
2.更改树状图的位置;
3.如果想要去掉图例标签,可设置 labels = FALSE参数;
4.个性化设置:树状分支颜色、文字标签颜色、风格和树状线条的宽度。
韦恩图(Venn plot),又称文氏图,是英国的哲学家和数学家约翰·维恩(John Venn)在1881年发明的,主要是用于展示在不同的事物群组(集合)之间的数学或逻辑联系,尤其适合用来表示集合(或)类之间的“大致关系”,它也常常被用来帮助推导(或理解推导过程)关于集合运算(或类运算)的一些规律。在我们常用的领域,简单来说就是多个集合之间取交集。
绘制韦恩图有很多方式,R,Python,Perl等,这里主要是用R来展示;在R语言中,绘制venn图有很多包可以实现:Venn, Vennplot, VennDiagram, VennDetail, ggvenn,gplots等。
此文主要展示一下用VennDiagram包绘制高纬度的韦恩图。
这样一个简单的GUOFUYASEWANG(国服亚瑟王)的韦恩图就画出来,通过参数给他加点颜色,美观一下。
增加配色之后好看了不少。
除了用R绘制韦恩图,还可以用网站实现。 http://www.interactivenn.net/ 可以绘制2-6维的韦恩图,不需要学会R也能绘制韦恩图。同学们可以自行探索。
有时候自己需要取交集的数据集太多,韦恩图满足不了,可以采用UpSetplot,它可以将交集数目通过柱状图的方式呈现。以UpSetR包里的movies文件做示例:
这是一个3883行,21列的数据集,包含了1995上映的电影具体情况(如Action是否是运动电影,0表示不是运动电影,1表示是运动电影,以此类推)
该图中 黑色 表示该位置有数据, 灰色 的点表示没有, 不同点连线 表示存在 交集 , 不同 柱状图 表示不同的 数目
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