x,y 用于横纵坐标作图的数据对象。
type 图类型(线条和点类型),使用格式type=" "。
type="p"显示为空心点。plot
type="l"显示为线条。line
type="b"显示为空心点和线条。both
type="c"显示为无点和线条。
type="o"显示为空心点和线条,线穿过空心点。
type="s"/"S"显示为阶梯线。
type="h"显示为直方图样的垂直线。
type="n"显示为无点和无线条。
xlim/ylim 用于指定图的x轴和y轴的范围,使用格式:xlim=c(x1,x2), ylim=c(y1,y2)。
xlab/ylab 用于给图的x轴和y轴添加标签,使用格式:xlab="xlab",ylab="ylab"。
main 用于对plot添加主标题, main=" "。
sub 用于对plot添加副标题, sub=" "。
log 用于对x或者y值取log。log="x"/"y"/"xy"。
ann 使用T/F对plot中的标题,x轴标签,y轴标签是否显示进行定义。
axes 使用T/F对坐标轴是否显示进行定义。
frame.plot 使用T/F对画图外框是否显示进行定义。
panel.first 参数还没弄懂,panel.first="grid(8,8)"对背景线进行定义。
asp 表示y/x的纵横比。
lty 用于线条类型的定义,指定值为整数,lty="1"。
lty="0"显示为空白,即无线条。
lty="1"显示为实线线条。
lty="2"显示为虚线线条。
lty="3"显示为点状线条。
lty="4"显示为点虚线线条,点和虚线线条间隔。
lty="5"显示为长虚线。
lty="1"显示为双破折号线条。
par(mfrow = c(n,m),mar = c(0,0,0,0),mai = c(0,0,0,0))
mar,mai参数主要是调节图形的margin的大小,顺序是下、左、上、右
R语言中,设置plot(x,y,'..., bty="o",..)里参数bty,就可以不同的6种边框了。
bty可以取6种字符,分别为“o”、“l”、“7”、“c”、“u”、“]”。这些字符代 表6种边框。
bty=“o” 绘制图形的上边框、下边框、左边框和右边框;注意这是小写的O
bty="l" 绘制图形的左边框和下边框;注意这是小写的L
bty="7"绘制图形的上边框和右边框;
bty="c"绘制图形的上边框、下边框和左边框;
bty="u"绘制图形的左边框、下边框和右边框;
bty="]"绘制图形的上边框、下边框和右边框;
title("Main Title", sub = "sub title",cex.main = 2, font.main= 4, col.main= "blue",
cex.sub = 0.75, font.sub = 3, col.sub = "red")
lty 取值为整数值,表示线型
tck 表示横纵坐标的刻度
ggsurvplot(fit, #生存分析结果
data = NULL, #a dataset used to fit survival curves
fun = NULL, # 定义生存曲线转换的任意函数。 经常使用的转换可以用字符参数指定:“event”绘制累积事件(f(y) = 1-y),“cumhaz”绘制累积风险函数(f(y) = -log(y)),“pct”以百分比表示生存概率。
color = NULL, #曲线颜色
palette = NULL, #颜色调色板,可选调色板有 "grey","npg","aaas","lancet","jco", "ucscgb","uchicago","simpsons"和"rickandmorty".
linetype = 1, #线条形状,可以用数值型向量1,2表示,也可以用字符串向量c("solid", "dashed").
conf.int = FALSE, #是否画出置信区间
pval = FALSE, #是否显示P值
pval.method = FALSE, #是否添加计算P值得方法得文本,前提是pval = TRUE
test.for.trend = FALSE, #默认是F,如果TURE,返回trend Pvalues检验。 趋势检验旨在检测生存曲线的有序差异。 也就是说,至少对一个群体来说。 只有组数为>2时,才能进行趋势测试。
surv.median.line = "none", #画一条水平或者垂直得生存中位值线,允许的值有c("none", "hv", "h", "v"). v: 垂直vertical, h:水平horizontal.
risk.table = FALSE, #是否显示风险table。其他值有absolute" or "percentage",显示绝对数值/百分比;参数"abs_pct" ,百分比以及绝对数值都显示
cumevents = FALSE, # logical value specifying whether to show or not the table of the cumulative number of events.
cumcensor = FALSE, #logical value specifying whether to show or not the table of the cumulative number of censoring.
tables.height = 0.25, #设置table得高度,取值范围0-1
group.by = NULL, #包含分组变量名称得字符串向量。长度<=2
facet.by = NULL, #一个字符向量,包含将生存曲线分成多个面板的分组变量的名称。
add.all = FALSE, #一个逻辑值。 如果为TRUE,则在主图中添加合并患者(null model)的生存曲线。
combine = FALSE, # a logical value. If TRUE, combine a list survfit objects on the same plot.
ggtheme = theme_survminer(), #主题名称
tables.theme = ggtheme, #主题名称,默认是theme_survminer.
... #后面描述的参数和其他参数将被传递给ggplot2 geom_*()函数,如linetype, size, ii)或ggpar()函数来定制图形。 看到的细节部分
)