工具原料一台电脑下载完毕的R software
方法/步骤分步阅读
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安装完毕R语言，新建属于自己的R变成文件夹，然后 File ->Change Dir..,设置成自己的工作文件，自己工作空间将都会产生在这个文件夹下。
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然后Files - >New Script，打开新的脚本编辑，在这里键入自己代码，编辑。
在此模式下，摁F5键意味着执行这一行，当我们编辑很多行的时候，我们可以进行全选，然后摁下F5，这样就会执行所有行的代码。
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下面进行实战，我们下面将会用R语言画出一个简单房子，具体的代码含义不解释，推荐Manning出版的《R语言实战》，里面有大量的联系及讲解。
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选中，然后执行F5按键，R语言就会画出一个简单的房子，具体代码可以参见下图。
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总之，R语言是一个非常好的统计软件，在生物统计，金融统计中发挥着越来越多的作用，同时R语言作为一款开源软件，也被世界的R语言兴趣者优化着。
注意事项
R作为一款免费的软件，有时候即使编正确的情况下，仍然可能出现错误
软件的学习在于多联系
内容仅供参考并受版权保护
（供自己记录）adj位置调整
ask询问
bg背景
bty图形边框风格，o四边都有边框，l左边和下边，7右边和上边，c上边、左边和下边，
cex设置点和字符的大小，axis坐标轴上标签字的大小，lab坐标轴上命名的大小，main标题的大小，sub副标题的大小，col颜色。
family字体的风格，
fg前景颜色
font图片字体的风格，字体，粗体，斜体
las坐标轴的运行关系，坐标轴上的字和坐标轴的关系，字会转
lend线的两端的样式
lty线的形式,直线、虚线
lwd线的粗细
Mai、mar、mex画布的大小
Mfcol、mfrow是来切分画布的，放几个fig在画布中，两个功能一样
pch是用来定义点的形状的，有25个形状
srt用来定义图中的文字的角度
Txk坐标轴上的刻度的大小，刻度的字体大小
Xaxt/yaxt不想要坐标轴的标签
Xlog/ylog是x轴和y轴设置为log值
Xpd把绘图区设置为整个画布
Fig表示图形的四个角的位置
New是在图中生成图
mycounts<-read.csv("2020武汉加油.csv")head(mycounts)
rownames(mycounts)<-mycounts[,1]
mycounts<-mycounts[,-1]
head(mycounts)
kb <- mycounts$Length / 1000
kb
countdata <- mycounts[,1:9]
rpk <- countdata / kb
rpk
tpm <- t(t(rpk)/colSums(rpk) * 1000000)
head(tpm)
write.table(tpm,file="2020武汉加油_tpm.xls",sep="\t",quote=F)
fpkm <- t(t(rpk)/colSums(countdata) * 10^6) （之前这里写成了10^9，多谢@不爱说话的生物狗 提醒，现在已经修改）
head(fpkm)
write.table(fpkm,file="2020武汉加油_fpkm.xls",sep="\t",quote=F)
fpkm_to_tpm = t(t(fpkm)/colSums(fpkm))*10^6
head(fpkm_to_tpm)
当然，已知所有基因的FPKM情况下，可以通过上述公式直接在excel里计算相应基因的TPM值。
