HTML分析是一个比较复杂的工作，Java世界主要有几款比较方便的分析工具：
1.Jsoup
Jsoup是一个集强大和便利于一体的HTML解析工具。它方便的地方是，可以用于支持用jQuery中css selector的方式选取元素，这对于熟悉js的开发者来说基本没有学习成本。
String content = "blabla"
Document doc = JSoup.parse(content)
Elements links = doc.select("a[href]")
Jsoup还支持白名单过滤机制，对于网站防止XSS攻击也是很好的。
2.HtmlParser
HtmlParser的功能比较完备，也挺灵活，但谈不上方便。这个项目很久没有维护了，最新版本是2.1。HtmlParser的核心元素是Node，对应一个HTML标签，支持getChildren()等树状遍历方式。HtmlParser另外一个核心元素是NodeFilter，通过实现NodeFilter接口，可以对页面元素进行筛选。这里有一篇HtmlParser的使用文章：使用 HttpClient 和 HtmlParser 实现简易爬虫。
3.Apache tika
tika是专为抽取而生的工具，还支持PDF、Zip甚至是Java Class。使用tika分析HTML，需要自己定义一个抽取内容的Handler并继承org.xml.sax.helpers.DefaultHandler，解析方式就是xml标准的方式。crawler4j中就使用了tika作为解析工具。SAX这种流式的解析方式对于分析大文件很有用，我个人倒是认为对于解析html意义不是很大。
InputStream inputStream = nullHtmlParser htmlParser = new HtmlParser()
htmlParser.parse(new ByteArrayInputStream(page.getContentData()),
contentHandler, metadata, new ParseContext())
4.HtmlCleaner与XPath
HtmlCleaner最大的优点是：支持XPath的方式选取元素。XPath是一门在XML中查找信息的语言，也可以用于抽取HTML元素。XPath与CSS Selector大部分功能都是重合的，但是CSS Selector专门针对HTML，写法更简洁，而XPath则是通用的标准，可以精确到属性值。XPath有一定的学习成本，但是对经常需要编写爬虫的人来说，这点投入绝对是值得的。
感觉上你这里应该是有点问题的：一、你在while判断的时候会让reader往后读一行的数据；然后在里面执行的时候又走一行；这就可能出现原本你的while里面判断的时候有值，但是在里面执行的时候已经没有值了。
二、如果你的文件里面有一行是空的，不满足while的条件，是不是程序到这里就被中断了呢？
其他的问题也没有发现什么。你看一下吧。
