主要区别是，意思不同、基本解释不同、引证解释不同，具体如下：
一、意思不同
1、悸动
意思是因心慌而心跳得厉害。
2、心动
意思指心脏的跳动，内心有所触动。
二、基本解释不同
1、悸动
因恐惧紧张、情绪激动，而致心跳加速。可比喻紧张忐忑的内心活动。
2、心动
①、 心脏的跳动。
②、 内心有所触动。
③、内心惊动，吃惊害怕。
三、引证解释不同
1、悸动
汉·应劭《风俗通·怪神·世间人家多有见赤白光为变怪者》：“夜半后，见东壁正白，如开门明，呼问左右，左右莫见。因起自往手抆莫之，壁白如故，还牀，复见之，心大悸动。”
白话文：“半夜之后，看见东墙雪白，如果打开门明，呼问身边的人，左右的人没有看见。于是起身亲自前去，用手擦拭不去，壁白照旧，回到牀，再次见到他，心里十分害怕心跳得厉害。”
2、心动
应修人 《不留名字的爱我者》：“我每每投身到人群里，看见头一个人，就觉得有些面熟，有些心动。”
参考资料来源：百度百科-悸动
参考资料来源：百度百科-心动
怎么判断自己心动了，参考如下：
1.见你时脸红心跳，小鹿乱撞。
见到你会害羞地低下头，怕与你对视，哪怕一秒钟，生怕你窥见我的小心思，在人群中我的眼里都是你，别人都沦为背景。你是唯一的，特别的，无与伦比的，甚至连怪癖都是可爱的，见到你嘴角就忍不住上扬，莫名的好心情。
2.分享欲。
有一句很有名的话这样说，如果在路旁看到一朵花很好看的第一想法是拍照发给TA的话，那就是了。
3.身体距离。
一个人的动作也能反应出 TA 的真实心思。当 TA 对你有好感的时候，身体会不自觉地向你靠拢。有人会刻意控制距离，但聊着聊着，可能就忘了，又向对方靠过去。
