基于R语言绘制Network几种方式

基于R语言绘制Network几种方式

我们输入的数据包含 gene ID 和 vector(单样本)部分,这里的 gene ID 是一个通用概念,可以是基因、转录本、酶或蛋白质。这里的 vector 可以是样本的表达量、倍数变化, p-value, 组蛋白修饰数据等可测量的属
Python100
R语言可视化通路富集网络图

R语言可视化通路富集网络图

我们输入的数据包含 gene ID 和 vector(单样本)部分,这里的 gene ID 是一个通用概念,可以是基因、转录本、酶或蛋白质。这里的 vector 可以是样本的表达量、倍数变化, p-value, 组蛋白修饰数据等可测量的属
Python190
r语言找不到对象geneexp

r语言找不到对象geneexp

r语言找不到对象geneexp,原因和解决方法如下。cor.test(x, ...)## Default S3 method:cor.test(x, y,alternative = c("two.sided", &quo
Python100
R语言可视化通路富集网络图

R语言可视化通路富集网络图

我们输入的数据包含 gene ID 和 vector(单样本)部分,这里的 gene ID 是一个通用概念,可以是基因、转录本、酶或蛋白质。这里的 vector 可以是样本的表达量、倍数变化, p-value, 组蛋白修饰数据等可测量的属
Python130
榴莲闻起来那么臭,为什么会受到很多人的喜欢?

榴莲闻起来那么臭,为什么会受到很多人的喜欢?

榴莲闻起来那么臭,然而却有很多人都特别喜欢吃榴莲,这是因为榴莲的全身都是宝。首先榴莲的外壳看起来非常的坚硬,而且也感觉很扎,事实上榴莲的外壳也可以用来煲汤,有很多人都喜欢用榴莲的外壳来煲汤,这种汤是非常有营养价值的。而榴莲的果肉是可以直接吃
Python160
R语言可视化通路富集网络图

R语言可视化通路富集网络图

我们输入的数据包含 gene ID 和 vector(单样本)部分,这里的 gene ID 是一个通用概念,可以是基因、转录本、酶或蛋白质。这里的 vector 可以是样本的表达量、倍数变化, p-value, 组蛋白修饰数据等可测量的属
Python170
R语言网络图介数怎么算

R语言网络图介数怎么算

在最短路算法的基础上,每替换一次k点时该点介数+1,(k,j)边介数+1,不知道你的最短路总数怎么算,是包括所有的还是只包括3节点以上的路?反正再除下最短路总数就出来了。R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、
Python240
R语言可视化通路富集网络图

R语言可视化通路富集网络图

我们输入的数据包含 gene ID 和 vector(单样本)部分,这里的 gene ID 是一个通用概念,可以是基因、转录本、酶或蛋白质。这里的 vector 可以是样本的表达量、倍数变化, p-value, 组蛋白修饰数据等可测量的属
Python210
R语言中哪些包是处理混合属性聚类的

R语言中哪些包是处理混合属性聚类的

聚类的包,cluster包,里面包含了pam,agnes等函数,可以十分方便进行聚类计算。另外有系统自带的stats包,hclust, kmeans等函数。fpc包做聚类分析,也是可以的。另外,如果需要例子,这些包自带的文档里面都有使用的实
Python170
什么叫R语言数据可视化

什么叫R语言数据可视化

比如你有一个Excel数据文件,里面数据一大堆,看起来毫无规律,你是不是想做个饼图看一下各成分分布的百分比?是不是想做个折线图看有没有相关性或其他规律?是不是想做个直方图看哪个区间分布的较多?把这些数据做个图出来看起来更直观就叫数据可视化。
Python100
R语言可视化通路富集网络图

R语言可视化通路富集网络图

我们输入的数据包含 gene ID 和 vector(单样本)部分,这里的 gene ID 是一个通用概念,可以是基因、转录本、酶或蛋白质。这里的 vector 可以是样本的表达量、倍数变化, p-value, 组蛋白修饰数据等可测量的属
Python280
R语言可视化通路富集网络图

R语言可视化通路富集网络图

我们输入的数据包含 gene ID 和 vector(单样本)部分,这里的 gene ID 是一个通用概念,可以是基因、转录本、酶或蛋白质。这里的 vector 可以是样本的表达量、倍数变化, p-value, 组蛋白修饰数据等可测量的属
Python230
R语言可视化通路富集网络图

R语言可视化通路富集网络图

我们输入的数据包含 gene ID 和 vector(单样本)部分,这里的 gene ID 是一个通用概念,可以是基因、转录本、酶或蛋白质。这里的 vector 可以是样本的表达量、倍数变化, p-value, 组蛋白修饰数据等可测量的属
Python200
推荐几个模拟构建蛋白质结构的软件

推荐几个模拟构建蛋白质结构的软件

你是说做出一个蛋白质结构模型呢还是说看蛋白质的空间结构的软件的呢都说了吧:由一条序列做出一个蛋白质结构模型最常用的方法是同源模建,软件有modeller(比较专业)swiss-pdb-viewer(本地提交在线预测结构的)看蛋白质空间结构图
Python180
R语言可视化之ggplot2——KEGG通路富集分析

R语言可视化之ggplot2——KEGG通路富集分析

之前分享了如何用ggplot2可视化GO分析的结果。既然做了GO,当然少不了KEGG了。 同样的,我们从 DAVID 获取KEGG pathway的结果。 对于KEGG,我比较喜欢做气泡图,这样用两种形式的图结合在一起,效果更丰富更
Python160
R语言可视化通路富集网络图

R语言可视化通路富集网络图

我们输入的数据包含 gene ID 和 vector(单样本)部分,这里的 gene ID 是一个通用概念,可以是基因、转录本、酶或蛋白质。这里的 vector 可以是样本的表达量、倍数变化, p-value, 组蛋白修饰数据等可测量的属
Python620
怎么将r语言编写的数据用关系图展示在前端页面

怎么将r语言编写的数据用关系图展示在前端页面

这样: 这里主要介绍下在R语言中绘制地图的个人琢磨的思路。绘制地图步骤有三: 你得需要绘制地图;(约等于废话) 你得有要绘制地图的地理信息,经纬度啊,边界啊等等; 你得利用2的数据在R中画出来。 以上步骤中,目前最关键的是2,怎么将r语言编
Python340