QTL分析的一般程序是什么?

QTL分析的一般程序是什么?

这个,只能复制别人的东西了。可以跟你明说,整个中国对QTL定位真正明白能用自己话说清楚的人不超过100个,而且这些人都不上百度。一般而言,步骤就是,创建群体--分子标记筛选---做连锁图谱---性状测量(多重复)---寻找QTL就群体而言,
Python300
WGCNA代码

WGCNA代码

WGCNA rm(list = ls()) #加载R包 library(WGCNA) library(tidyr) library(ggplot2) library(gridExtra) setwd("
Python1010
系统发育比较分析—R

系统发育比较分析—R

系统发育树 是研究物种进化历史必不可少的信息,我们可以利用它得到一些重要历史线索,如: 首先,安装系统发育分析所需的软件包 其实,此处的树文件就是一个字符串列表(列表还可以是数字型)。 接下来,主要是看一下这些对象是如何存储
Python170
我国甜樱桃早熟品种有哪些?各有何特点?

我国甜樱桃早熟品种有哪些?各有何特点?

甜樱桃早熟品种果实发育期在30~50天左右,是目前生产上栽培量比较大、品种资源较多的类型。早熟品种硬核期和胚发育周期很短,有些品种甚至无明显硬核期,至果实着色时种核尚未完全木质化,胚发育不完善,败育现象较普遍。甜樱桃早熟品种果实大小受气温条
Python170
离散模型和连续模型的优缺点

离散模型和连续模型的优缺点

首先声明,我只是个搞生物竞赛的,假如你对这个一无所知的话,也许我略知道一点,试着解释一下吧。人口模型有离散的吗?好像不是吧。离散模型适用于许多一年生植物与昆虫,其特点是种群各世代不相重叠(说白了,也就是子代出生看不见它爹妈了的)。有人告诉我
Python200
R语言的ggtree展示进化树的一些常用操作

R语言的ggtree展示进化树的一些常用操作

现在假设你已经拿到了nwk格式的进化树文件,如下 现在进化树的所有信息都存储在了 tree 这个变量里 用到的的 geom_tiplab()可以首先加上 theme_tree2() 函数显示出坐标轴范围,然后用 xlim()
Python110
樱桃等级划分标准

樱桃等级划分标准

车厘子其实就是樱桃,我们一般把进口的樱桃叫成车厘子,国内种植的叫樱桃。进口的车厘子颜色偏暗红色,果实更大些、果肉更紧实,多汁而甜。而国内的樱桃虽然个头更小,但皮薄多汁,还新鲜,价格也更便宜。车厘子主要产地在美国、加拿大、智利、澳洲、欧洲等地
Python140
什么是估计育种值的BLUP法?它有何优点?

什么是估计育种值的BLUP法?它有何优点?

BLUP是Best Linear Unbiased Prediction的缩写,中文译名是“最佳线性无偏预测”,是当今世界上动物育种值估计中应用相当广泛的先进的统计方法。它是由美国著名数量遗传学家C.R.HENDERSON于20世纪50年代
Python160
系统发育比较分析—R

系统发育比较分析—R

系统发育树 是研究物种进化历史必不可少的信息,我们可以利用它得到一些重要历史线索,如: 首先,安装系统发育分析所需的软件包 其实,此处的树文件就是一个字符串列表(列表还可以是数字型)。 接下来,主要是看一下这些对象是如何存储
Python140
如何制作全基因组cnv染色体分布图

如何制作全基因组cnv染色体分布图

楼主可以尝试Circos 环形图很漂亮。Perl的话只能SVG做矢量图,不是很好编程,也不太美观。Rmatlabpython作图也有相应的教程。其实工具不重要,主要是坐标转换的问题,画出来的矢量图用Adobe Illustrator可以
Python110
系统发育比较分析—R

系统发育比较分析—R

系统发育树 是研究物种进化历史必不可少的信息,我们可以利用它得到一些重要历史线索,如: 首先,安装系统发育分析所需的软件包 其实,此处的树文件就是一个字符串列表(列表还可以是数字型)。 接下来,主要是看一下这些对象是如何存储
Python160
相合估计和无偏估计的区别

相合估计和无偏估计的区别

1、性质相合估计是一种一致估计、相容估计,估计量的一种大样本性质为:当样本容量n充分大时,估计量可以以任意的精确程度逼近被估计参数的真值。无偏估计是用样本统计量来估计总体参数时的一种无偏推断。2、特点相合估计:按收敛意义不同,可以区分
Python410
系统发育比较分析—R

系统发育比较分析—R

系统发育树 是研究物种进化历史必不可少的信息,我们可以利用它得到一些重要历史线索,如: 首先,安装系统发育分析所需的软件包 其实,此处的树文件就是一个字符串列表(列表还可以是数字型)。 接下来,主要是看一下这些对象是如何存储
Python150
R语言:有关差异分析的检验方法

R语言:有关差异分析的检验方法

1 读取,计算均值,箱图观察 2 查看数据分布 2.1 hist直方图 2.2 qqnorm散点图 3 Shapiro-Wilk正态性检验 4 方差齐性检验意义:方差分析就是在大家误差水平
Python90
系统发育比较分析—R

系统发育比较分析—R

系统发育树 是研究物种进化历史必不可少的信息,我们可以利用它得到一些重要历史线索,如: 首先,安装系统发育分析所需的软件包 其实,此处的树文件就是一个字符串列表(列表还可以是数字型)。 接下来,主要是看一下这些对象是如何存储
Python200
survfit生成的结果怎么引用

survfit生成的结果怎么引用

在R语言中我们可以使用survival包进行生存分析,其中主要的函数功能罗列如下:Surv:用于创建生存数据对象survfit:创建KM生存曲线或是Cox调整生存曲线survdiff:用于不同组的统计检验coxph:构建COX回归模型cox
Python160
系统发育比较分析—R

系统发育比较分析—R

系统发育树 是研究物种进化历史必不可少的信息,我们可以利用它得到一些重要历史线索,如: 首先,安装系统发育分析所需的软件包 其实,此处的树文件就是一个字符串列表(列表还可以是数字型)。 接下来,主要是看一下这些对象是如何存储
Python230
系统发育比较分析—R

系统发育比较分析—R

系统发育树 是研究物种进化历史必不可少的信息,我们可以利用它得到一些重要历史线索,如: 首先,安装系统发育分析所需的软件包 其实,此处的树文件就是一个字符串列表(列表还可以是数字型)。 接下来,主要是看一下这些对象是如何存储
Python330
系统发育比较分析—R

系统发育比较分析—R

系统发育树 是研究物种进化历史必不可少的信息,我们可以利用它得到一些重要历史线索,如: 首先,安装系统发育分析所需的软件包 其实,此处的树文件就是一个字符串列表(列表还可以是数字型)。 接下来,主要是看一下这些对象是如何存储
Python130
2019-02-23 QTL(转自知乎)

2019-02-23 QTL(转自知乎)

链接:https:www.zhihu.comquestion27695566answer40741777 我是来顺便整理一下自己脑子里的东西的。欢迎知友们评论指正。一、QTL定位的基本思想QTL全称是Quan
Python300