肿瘤突变负荷计算
之前看到TMB还以为在骂人呢。后来知道这是一个随着肿瘤免疫火起来的新名词。 定义： 肿瘤基因组每个编码区域的非同义突变的总数。好吧，那就需要知道什么是非同义突变了。不导致氨基酸改变的核苷酸变异我们称为同义突变，反之则称
推荐阅读
热门文章
肿瘤突变负荷计算
之前看到TMB还以为在骂人呢。后来知道这是一个随着肿瘤免疫火起来的新名词。 定义： 肿瘤基因组每个编码区域的非同义突变的总数。好吧，那就需要知道什么是非同义突变了。不导致氨基酸改变的核苷酸变异我们称为同义突变，反之则称
Python气象数据处理与绘图(5)：气候突变检验(年代际突变检验)
长时间尺度的气候研究中通常涉及到年际变化和年代际变化。文献中也经常出现所谓年代际突变这类的描述，这次便介绍两个用来检验年代际变化的方法， 其一是滑动t检验(sliding t-test)，另一个则是曼肯德尔检验(Man-Kendall te
小波去噪和突变点去除
stepfun(n,26)-stepfun(n,27)+stepfun(n,299)-stepfun(n,300)... +stepfun(n,589)-stepfun(n,590)+stepfun(n,900)-stepfun(n,901
R包——maftools 可视化神器
随着癌症基因组学的进步，突变注释格式（MAF）被广泛接受并用于存储检测到的体细胞变体。 癌症基因组图谱项目对30多种不同的癌症进行了测序，每种癌症类型的样本量超过200种。由体细胞变体组成的结果数据以MAF格式形式存储。 只要数据采用MA
【求助】弱问：M-K检验，RS分析用什么软件做的啊？
Fortran多princeado(站内联系TA)M-K检验是做趋势分析还是突变检验，我编了相关的程序，不是很长的，用R语言编的，不过DPS系统也可以做M-K检验，如果有你可以试一下.guoguo1983(站内联系TA)要是用MK做趋势检验
共价结合药物的设计与开发【转载】
https:med.sina.comarticle_detail_103_2_46000.html共价结合药物的设计与开发前言 图1 经典的共价结合药物 长久以来，亲电性基团是药物开发中的雷区，因而在以往经典的药物化学
什么叫R语言数据可视化
比如你有一个Excel数据文件，里面数据一大堆，看起来毫无规律，你是不是想做个饼图看一下各成分分布的百分比？是不是想做个折线图看有没有相关性或其他规律？是不是想做个直方图看哪个区间分布的较多？把这些数据做个图出来看起来更直观就叫数据可视化。
什么是mk检验
mk检验是曼－肯德尔法，又称Mann—Kenddall 检验法，是一种气候诊断与预测技术，应用Mann-Kendall检验法可以判断气候序列中是否存在气候突变，如果存在，可确定出突变发生的时间。Mann-Kendall检验法也经常用于气候变
PCAWG | 泛癌全基因组分析
发表期刊：Nature 发表日期：2020.02 影响因子：42.778 癌症是全球第二大常见死因，每年超过800万人因癌症丧命。预计在未来十年，癌症发生率将增加50%以上。癌症是体细胞亚克隆自主发展和扩散类疾病的总称。癌症克
PCAWG | 泛癌全基因组分析
发表期刊：Nature 发表日期：2020.02 影响因子：42.778 癌症是全球第二大常见死因，每年超过800万人因癌症丧命。预计在未来十年，癌症发生率将增加50%以上。癌症是体细胞亚克隆自主发展和扩散类疾病的总称。癌症克
vcf文件转换为maf格式
假设已经安装了VEP软件，对自己的vcf进行了注释，然后就可以进行转换：https:github.commskccvcf2maf安装GitHub上面的小工具 cd~biosoftvcf2maf expo
基因突变
基因突变科技名词定义中文名称：基因突变 英文名称：gene mutation 定义：由于核酸序列发生变化，包括缺失突变、定点突变、移框突变等，使之不再是原有基因的现象。 应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科）；基因表达与调控（二级学科）
R语言学习笔记之聚类分析
R语言学习笔记之聚类分析使用k-means聚类所需的包：factoextracluster #加载包library(factoextra)library(cluster)l#数据准备使用内置的R数据集USArrests#load t
Python气象数据处理与绘图(4)：显著性检验
其实在(2)中已经提到了相关系数和回归系数，在计算过程中，直接返回了对应的p-value，因此可以直接使用p-value。 计算两个独立样本得分均值的T检验。 这是对两个独立样本具有相同平均值（预期值）的零假设的双边检验。此测试假设
R包——maftools 可视化神器
随着癌症基因组学的进步，突变注释格式（MAF）被广泛接受并用于存储检测到的体细胞变体。 癌症基因组图谱项目对30多种不同的癌症进行了测序，每种癌症类型的样本量超过200种。由体细胞变体组成的结果数据以MAF格式形式存储。 只要数据采用MA