R语言做聚类分析用统计量确定类的个数.有什么代码或者包吗聚类分析有两种主要计算方法,分别是凝聚层次聚类(Agglomerative hierarchical method)和K均值聚类(K-Means)。层次聚类又称为系统聚类,首先要定义样本之间的距离关系,距离较近的归为一类,较远的则属于不同的2023-02-25Python90
给定检验水准和样本量,R 语言中如何求t检验的临界值?qt()函数标准输入qt(检验水准,样本量-1,lower.tail=F)比如说检验水平alpha=0.05, 20个样本,那么上分位点t_alpha=qt(0.05,19,lower.tail=F)在进行t检验之前让我们先看看2023-02-25Python240
R语言绘制配对样品箱线图配对箱线图,常见于配对样本的数据分析中。 例如下图示例,为了研究某些基因在肿瘤组织和正常组织中是否具有表达量的显著不同,在取样时,往往会在同一患者个体中同时获取肿瘤和临近正常组织,两个组织样本就是配对关系。当然在这类研究中,往往需要调查2023-02-25Python190
R语言分布的卡方拟合优度检验卡方拟合优度检验,用于衡量观测频数与期望频数之间的差异 一般地,假设总体分r类,分布假设检验问题在原假设下, 期望频数 : 假设从总体中随机抽取n个样本,并记为样本中分到类中的个数,称为 观测频数 。 K.2023-02-25Python170
R语言|绘制物种累计曲线物种累积曲线( species accumulation curves)用于衡量和预测群落中物种丰富度随样本量扩大而增加的幅度,在生物多样性和群落调查中,被广泛用于判断样本量是否充分的并估计群落丰富度。 一般而言,在样本量较少的情况下,2023-02-25Python230
WGCNA(1):R包安装及数据导入清洗WGCNA :加权基因共表达网络分析,简而言之,就是将基因划分为若干个模块,探究与表型数据与基因模块之间的相关关系,并找到模块中的核心基因。 适用于复杂的数据模式,推荐5组(或者15个样品)以上的数据。一般可应用的研究方向有:不同器2023-02-25Python240
R语言做聚类分析用统计量确定类的个数.有什么代码或者包吗聚类分析有两种主要计算方法,分别是凝聚层次聚类(Agglomerative hierarchical method)和K均值聚类(K-Means)。层次聚类又称为系统聚类,首先要定义样本之间的距离关系,距离较近的归为一类,较远的则属于不同的2023-02-25Python180
R语言ggtree画圆形的树状图展示聚类分析的结果那么圆形的树状图如何实现呢?我查找了一下相关资料。 R语言包 dendextend 这个包可以实现,利用 help(package="dendextend") 查看帮助文档,能够看到其中的一个小例子 但是这个后期2023-02-25Python100
R语言--不均衡问题处理样本不均衡问题是指在机器学习分类任务中,不同类型的样本占比差距悬殊。 比如训练数据有100个样本,其中只有5个正样本,其余均为负样本,这样正样本:负样本=5%:95%,训练数据中负样本过多,会导致模型无法充分学习到正样本的信息,这时候2023-02-25Python190
r语言贝叶斯判别先验概率怎么去Bayes判别,它是基于Bayes准则的判别方法,判别指标为定量资料,它的判别规则和最大似然判别、Bayes公式判别相似,都是根据概率大小进行判别,要求各类近似服从多元正态分布。1. Bayes准则:寻求一种判别规则,使得属于第k类的样品在2023-02-25Python190
python检验是否服从威布尔分布服从。python检验由风速分布密度曲线形状,初步可判定,风电场分布模型初步服从威布尔分布。韦布尔分布,即韦伯分布(Weibulldistribution),又称韦氏分布或威布尔分布,是可靠性分析和寿命检验的理论基础。1.直方图 由于正2023-02-25Python160
R语言学习由浅入深路线图R语言学习由浅入深路线图_数据分析师考试现在对R感兴趣的人越来越多,很多人都想快速的掌握R语言,然而,由于目前大部分高校都没有开设R语言课程,这就导致很多人不知道如何着手学习R语言。对于初学R语言的人,最常见的方式是:遇到不会的地方,就2023-02-25Python130
在R语言中,只已知2个样本各自的个数,均值,方差,怎么检验差异是否显著?如果两个样本具有方差齐性,那么做独立样本t检验时,直接套用t检验的公式,计算t值,,查表的自由度为n1+n2-2,然后用函数pt( t value, n1+n2-2)给出p值,小于0.05即为显著。如果方差不齐,需要计算校正后的自由度,n2023-02-25Python160
复现详解:纯R代码实现ssGSEA算法评估肿瘤免疫浸润程度GSE112996_merged_fpkm_table.txtGSE112996_series_matrix.txt,把GSE112996_series_matrix.txt解压,得到如下两个文件,把这两个文件放到对应的project文件夹2023-02-25Python150
R语言-limma差异分析与heatmap绘制#mRNA表达矩阵与GROUP文件样式,heatmap样式见文章最后 library(limma) mRNA <- read.table("表达矩阵.txt",sep = "t&qu2023-02-25Python140
怎么用R软件画线性判别函数?急求!函数在下,求代码水平不济,仅提供个笨方法:> x=seq(-10,10,by=0.1)> y=-0.1453404*x-0.7590457*x^2> z=cbind(x,y)> plot(z)cor()函数可2023-02-25Python160
r语言中t检验如何单独取t值独立双样本t检验,首先假设我们的两组数据完全由独立抽样得来;t.test函数可以直接用于检验像sleep这样的长数据,列group则为样本的分组依据。配对样本t检验,数据集为包含分组变量的数据框,那么程序将默认group=1的数据行中的第2023-02-25Python140
单位员工学历比例怎么计算就是占比多少。比如,如果要统计单位职工大学学历的比例,那就是“拥有大学学历的职工”÷公司全体干部职工总人数x100%。比如,公司有200人,其中30人拥是大学本科毕业,那么本科学历的比例就是30÷200=15%80个员工有5个本科学历2023-02-25Python120
机器学习模型评价指标及R实现机器学习模型评价指标及R实现1.ROC曲线考虑一个二分问题,即将实例分成正类(positive)或负类(negative)。对一个二分问题来说,会出现四种情况。如果一个实例是正类并且也被 预测成正类,即为真正类(True positive)2023-02-25Python80
请会统计会R语言的大神帮忙呀~关于贝叶斯推理这个我觉得可以选择beta分布为先验分布,因为首先binomial distribution 正比例于beta分布,而且未知参数p的后验分布正比例于binomial distribution 与 beta distribution 的乘积,2023-02-25Python180