R语言 subset函数

R语言 subset函数

假设你的向量v是v &lt- sample(100, replace = T)那么v就有100个从1 到100的数(可以有重复)你若想挑出50到100的那些,可以这么做ind &lt- v &gt= 50 &
Python140
R语言学习笔记之聚类分析

R语言学习笔记之聚类分析

R语言学习笔记之聚类分析使用k-means聚类所需的包:factoextracluster #加载包library(factoextra)library(cluster)l#数据准备使用内置的R数据集USArrests#load t
Python290
r语言中的var函数是什么意思

r语言中的var函数是什么意思

c语言中函数var是什么意思?函数var假定其参数是样本总体中的样本。如果数据是样本总体,则应使用VarP函数计算方差。意义:根据给定的样本计算方差。语法:VAR(Number1,number2,…)Number1,number2,。。。是
Python170
R语言-17决策树

R语言-17决策树

是一个预测模型,分为回归决策树和分类决策树,根据已知样本训练出一个树模型,从而根据该模型对新样本因变量进行预测,得到预测值或预测的分类 从根节点到叶节点的一条路径就对应着一条规则.整棵决策树就对应着一组表达式规则。叶节点就代表该规则下
Python220
r语言 length和ncol的区别

r语言 length和ncol的区别

a本身是一个矩阵,而定义dimnames=list()则表示其每一个元素都被命名且命名方式是列表(list),因此在调用a中的元素的时候可以调用a[]或者a[[]]都可以。a[]是调用a本身的第几个元素,a[[]]是命名中的第几个名字下的元
Python160
R语言:有关差异分析的检验方法

R语言:有关差异分析的检验方法

1 读取,计算均值,箱图观察 2 查看数据分布 2.1 hist直方图 2.2 qqnorm散点图 3 Shapiro-Wilk正态性检验 4 方差齐性检验意义:方差分析就是在大家误差水平
Python130
R语言实现bootstrap和jackknife检验方法

R语言实现bootstrap和jackknife检验方法

写在最前面: 首先需要说一下,本文的bootstrap和jackknife都算是蒙特卡罗方法(Monte Carlo method)的一种。应用广泛的的MCMC链(马尔可夫链蒙特卡洛方法Markov chain Monte Carlo
Python150
模糊C均值聚类算法(FCM)

模糊C均值聚类算法(FCM)

【嵌牛导读】FCM算法是一种基于划分的聚类算法,它的思想就是使得被划分到同一簇的对象之间相似度最大,而不同簇之间的相似度最小。模糊C均值算法是普通C均值算法的改进,普通C均值算法对于数据的划分是硬性的,而FCM则是一种柔性的模糊划分。【嵌牛
Python170
r语言偏度峰度函数需要安装什么包

r语言偏度峰度函数需要安装什么包

moments包。R语言使用moments包计算偏度(Skewness)和峰度(Kurtosis)实战计算偏度(Skewness)和峰度(Kurtosis)、确定样本数据是否具有与正态分布匹配的偏度和峰度(假设检验)。读《Discoveri
Python150
R|Affymetrix芯片分析(1)-affy

R|Affymetrix芯片分析(1)-affy

Affymetrix芯片储存着大量的生物信息学数据,因此有必要从实战出发的角度,汇总下Affymetrix芯片处理的流程。下面以GSE1438为例 常用的质量控制的指标: 平均数法、RLE、NUSE和RNA降解曲线根据以上指标综合决
Python190
使用R语言进行卡方检验(chi-square test)

使用R语言进行卡方检验(chi-square test)

文|程瑞林(山东大学第二医院足踝外科) 来源|(微信公众号)云中瑞麟(ID:ruilinfly) 瑞麟导读: 对于计量资料,临床医学研究中常用的统计分析方法是t检验;而对于计数资料,卡方检验是一个常用的统计分析方法。 最近
Python150
R语言Rose

R语言Rose

重点就是把柱状图画好,然后极坐标系展示就可以了~ 简单的画图,数据类型data.frame,Gene一列为character,RatioIC为numeric; p = ggplot(dt, aes(x = reorder(Gene,
Python190
lefse分析LDA可以设为2.5吗

lefse分析LDA可以设为2.5吗

lefse分析LDA可以设为2.5。当出现超过两类的情况时,可以使用由费舍尔判别派生出的分析方法,它延伸为寻找一个保留了所有类的变化性的子空间。这是由 C.R.Rao 总结出来的。假设,C个类中每一个类都有均值和相同的协方差。在对自变量
Python220
R语言实现bootstrap和jackknife检验方法

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写在最前面: 首先需要说一下,本文的bootstrap和jackknife都算是蒙特卡罗方法(Monte Carlo method)的一种。应用广泛的的MCMC链(马尔可夫链蒙特卡洛方法Markov chain Monte Carlo
Python160