R语言-limma差异分析与heatmap绘制#mRNA表达矩阵与GROUP文件样式,heatmap样式见文章最后 library(limma) mRNA <- read.table("表达矩阵.txt",sep = "t&qu2023-02-27Python130
如何在R语言中进行神经网络模型的建立不能发链接,所以我复制过来了。#载入程序和数据 library(RSNNS) data(iris)#将数据顺序打乱 iris <- iris[sample(1:nrow(iris),length(1:nrow(iris))),12023-02-27Python70
xgboost的python包有多少参数XGBoost参数XGBoost的参数可以分为三种类型:通用参数、booster参数以及学习目标参数General parameters:参数控制在提升(boosting)过程中使用哪种booster,常用的booster有树模型(tre2023-02-27Python90
R语言可视化通路富集网络图我们输入的数据包含 gene ID 和 vector(单样本)部分,这里的 gene ID 是一个通用概念,可以是基因、转录本、酶或蛋白质。这里的 vector 可以是样本的表达量、倍数变化, p-value, 组蛋白修饰数据等可测量的属2023-02-27Python130
R语言ggtree画圆形的树状图展示聚类分析的结果那么圆形的树状图如何实现呢?我查找了一下相关资料。 R语言包 dendextend 这个包可以实现,利用 help(package="dendextend") 查看帮助文档,能够看到其中的一个小例子 但是这个后期2023-02-27Python140
r语言中mcnemar.test函数怎么使用cat函数用于输出到外部文件: cat("av3=function(x){n=length(x)m=mean(x)d3=(x-m)^3sum(d3)n} ",file="aa.r") cat(&qu2023-02-27Python130
人工智能一些术语总结随着智能时代慢慢的到来,有一些基本概念都不知道真的是要落伍了,作为正在积极学习向上的青年,我想总结一份笔记,此份笔记会记录众多AI领域的术语和概念,当然,学一部分记录一部分,并且可能会夹杂着自己的一些理解,由于能力有限,有问题希望大家多多赐2023-02-27Python170
在r语言中,哪一项命令用来执行wilcoxon秩和检验wilcox.test()其中paired参数需要是FALSE(默认值)比如x<-rnorm(10)y<-rnorm(10)wilcox.test(x,y)参看帮助文档 一般根据数据是否符合正态分布,选择合适2023-02-27Python170
如何在R语言中进行神经网络模型的建立不能发链接,所以我复制过来了。#载入程序和数据 library(RSNNS) data(iris)#将数据顺序打乱 iris <- iris[sample(1:nrow(iris),length(1:nrow(iris))),12023-02-27Python150
r语言指的是什么?R语言是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R语言是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。R语言是统计领域广泛使用的诞生于1980年左右的S语言的一个分支。可以认为R语言是S语言的一种2023-02-27Python130
R语言Rose重点就是把柱状图画好,然后极坐标系展示就可以了~ 简单的画图,数据类型data.frame,Gene一列为character,RatioIC为numeric; p = ggplot(dt, aes(x = reorder(Gene,2023-02-27Python270
r语言 t.test用法paired=TRUE(TRUE可以简写成T)意思是对X和Y这组paired数据(就是说(X_i,Y_i)可以很自然地组成一对,而(X_i,Y_j)(i≠j)就不能当成一对)做t检验,即对所有Y_i-X_i(也可能是X-Y,忘了是哪个了)组2023-02-27Python170
R语言:十一个统计检验都在这了R语言的各种检验 1、W检验(Shapiro–Wilk (夏皮罗–威克尔 ) W统计量检验) 检验数据是否符合正态分布,R函数:shapiro.test(). 结果含义:当p值小于某个显著性水平α(比如0.05)时,则认为2023-02-27Python90
assay 和 purity 的区别assay英[əˈseɪ]美[ˈæsˌe, æˈse]n.试验化验<古>尝试试金 vt.试验分析化验考验 vi.经检验证明内含成分 [网络]含量含量测定实验 [例句]The assay methods2023-02-27Python150
R语言:十一个统计检验都在这了R语言的各种检验 1、W检验(Shapiro–Wilk (夏皮罗–威克尔 ) W统计量检验) 检验数据是否符合正态分布,R函数:shapiro.test(). 结果含义:当p值小于某个显著性水平α(比如0.05)时,则认为2023-02-27Python120
R语言单因素、多因素方差分析ANOVA analysis of variance@[toc] 假设检验的前提是要满足正态分布和方差齐性 组内平方和SSE:同一组内的数据误差平方和 组间平方和SSA:不同组之间的数据误差平方和一个分类型自变量 例如四个班级学生的语文成绩,班级是分类型自变2023-02-27Python150
如何用R做GARCH模型以AR(3)-GARCH(2,1)模型为例:首先在主窗口输入LS RR RR(-1) (-2) (-3)得出Variable Coefficient Std. Error t-Statistic Prob. RR(-1) 0.0076062023-02-27Python150
r语言中distances函数怎样用?R语言实际上是函数的集合,用户可以使用base,stats等包中的基本函数,也可以自己编写函数完成一定的功能。但是初学者往往认为编写R函数十分困难,或者难以理解。这里对如何编写R函数进行简要的介绍。函数是对一些程序语句的封装。换句话说,编12023-02-27Python210
R语言常用函数整理(基础篇)R语言常用函数整理本篇是基础篇,即R语言自带的函数。 vector:向量 numeric:数值型向量 logical:逻辑型向量 character;字符型向量 list:列表 data.frame:数据框 c:2023-02-27Python170
R语言-17决策树是一个预测模型,分为回归决策树和分类决策树,根据已知样本训练出一个树模型,从而根据该模型对新样本因变量进行预测,得到预测值或预测的分类 从根节点到叶节点的一条路径就对应着一条规则.整棵决策树就对应着一组表达式规则。叶节点就代表该规则下2023-02-27Python170