R语言绘制配对样品箱线图

R语言绘制配对样品箱线图

配对箱线图,常见于配对样本的数据分析中。 例如下图示例,为了研究某些基因在肿瘤组织和正常组织中是否具有表达量的显著不同,在取样时,往往会在同一患者个体中同时获取肿瘤和临近正常组织,两个组织样本就是配对关系。当然在这类研究中,往往需要调查
Python130
R语言绘制配对样品箱线图

R语言绘制配对样品箱线图

配对箱线图,常见于配对样本的数据分析中。 例如下图示例,为了研究某些基因在肿瘤组织和正常组织中是否具有表达量的显著不同,在取样时,往往会在同一患者个体中同时获取肿瘤和临近正常组织,两个组织样本就是配对关系。当然在这类研究中,往往需要调查
Python170
R语言作业-统计30题

R语言作业-统计30题

链接: http:www.bio-info-trainee.com4385.html我做题的时候主要翻阅学习了《R语言实战》里统计相关内容。 需要掌握R内置数据集及R包数据集 鸢尾花(iris)数据集,包含150个鸢尾
Python160
R|Affymetrix芯片分析(1)-affy

R|Affymetrix芯片分析(1)-affy

Affymetrix芯片储存着大量的生物信息学数据,因此有必要从实战出发的角度,汇总下Affymetrix芯片处理的流程。下面以GSE1438为例 常用的质量控制的指标: 平均数法、RLE、NUSE和RNA降解曲线根据以上指标综合决
Python150
《R语言实战》自学笔记69-重抽样和自助法

《R语言实战》自学笔记69-重抽样和自助法

数据准备 许多实际情况中统计假设(假定观测数据抽样自正态分布或者其他性质较好的理论分布)并不一定满足,比如数据抽样于未知或混合分布、样本量过小、存在离群点、基于理论分布设计合适的统计检验过于复杂且数学上难以处理等情况,这时基于随机化和
Python130
《R语言实战》自学笔记69-重抽样和自助法

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数据准备 许多实际情况中统计假设(假定观测数据抽样自正态分布或者其他性质较好的理论分布)并不一定满足,比如数据抽样于未知或混合分布、样本量过小、存在离群点、基于理论分布设计合适的统计检验过于复杂且数学上难以处理等情况,这时基于随机化和
Python200
数据的统计描述(计量资料)

数据的统计描述(计量资料)

1. 算数平均数(arithmetic mean) R语言函数:mean( )2.中位数(median)将所有观测值从小到大排列,居于中间位置的观测值称为中位数,用表示。 当观测值为奇数个时,中位数是第位置的观测
Python120
机器学习模型评价指标及R实现

机器学习模型评价指标及R实现

机器学习模型评价指标及R实现1.ROC曲线考虑一个二分问题,即将实例分成正类(positive)或负类(negative)。对一个二分问题来说,会出现四种情况。如果一个实例是正类并且也被 预测成正类,即为真正类(True positive)
Python110
R语言-v1-基础知识

R语言-v1-基础知识

R语言-v1-基础知识 Iretara 12-17 21:18 以例题的形式简述R语言基础知识 # 读取文件setwd("文件链接的时候,用    ") install.pa
Python210
R语言-KNN算法

R语言-KNN算法

1、K最近邻(k-NearestNeighbor,KNN)分类算法,是一个理论上比较成熟的方法,也是最简单的机器学习算法之一。该方法的思路是:如果一个样本在特征空间中的k个最相似(即特征空间中最邻近)的样本中的大多数属于某一个类别,则该样本
Python150
组间差异检验,终于有人讲清楚了!

组间差异检验,终于有人讲清楚了!

什么是组间差异检验?就是组间的差异分析以及显著性检验,应用统计学上的 假设检验 方法,检验组间是否有差异及其差异程度。坦率地讲,所有的差异检验都基于一个假设:组间没有差异,变量之间没有关系(即原假设,)。上海交大王成老师也说方差分析其
Python370
R语言-17决策树

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是一个预测模型,分为回归决策树和分类决策树,根据已知样本训练出一个树模型,从而根据该模型对新样本因变量进行预测,得到预测值或预测的分类 从根节点到叶节点的一条路径就对应着一条规则.整棵决策树就对应着一组表达式规则。叶节点就代表该规则下
Python190
R语言怎么检验分布是不是T分布

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ks.test()实现了KS检验,可以检验任意样本是不是来自给定的连续分布。你这里的用法就是:ks.test(data,pt,df=df) #data是样本的数据,df是要检验的t分布的自由度KS&gt0.2。KS值表示了模型将+和
Python170
R语言绘制配对样品箱线图

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Python150
r语言arma-garch怎样预测

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原文链接:http:tecdat.cn?p=20015本文将说明单变量和多变量金融时间序列的不同模型,特别是条件均值和条件协方差矩阵、波动率的模型。均值模型本节探讨条件均值模型。iid模型我们从简单的iid模型开始。iid模型
Python110